RNA–Protein interactions for RNA: YNL108C

YNL108C, Transcript of Protein phosphatase, yeast

Gene YNL108C, Length 813 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNL108C	YNL108C	YGL262W	P53054	175 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNL108C	YNL108C	YPL039W	Q03080	316 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNL108C	YNL108C	GAS3	Q03655	524 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNL108C	YNL108C	YDR029W	Q12111	104 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNL108C	YNL108C	YFR032C-B	Q8TGU2	87 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNL108C	YNL108C	ECM12	O13529	151 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNL108C	YNL108C	MSW1	P04803	379 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNL108C	YNL108C	RPL9A	P05738	191 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YNL108C	YNL108C	TOM40	P23644	387 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YNL108C	YNL108C	UTP30	P36144	274 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YNL108C	YNL108C	SHE1	P38200	338 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNL108C	YNL108C	RPL9B	P51401	191 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YNL108C	YNL108C	TDA7	P53882	636 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YNL108C	YNL108C	YPR174C	Q06616	221 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YNL108C	YNL108C	MIM1	Q08176	113 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNL108C	YNL108C	YML100W-A	Q8TGT0	57 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNL108C	YNL108C	TY1B-H	O13535	1793 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNL108C	YNL108C	CPA1	P07258	411 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YNL108C	YNL108C	FUN14	P18411	198 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YNL108C	YNL108C	EMP24	P32803	203 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YNL108C	YNL108C	YJL218W	P40892	196 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YNL108C	YNL108C	CUP9	P41817	306 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YNL108C	YNL108C	RSM10	Q03201	203 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YNL108C	YNL108C	YDR102C	Q03864	110 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YNL108C	YNL108C	GPI11	Q06636	219 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YNL108C	YNL108C	NIP7	Q08962	181 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YNL108C	YNL108C	PST1	Q12355	444 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YNL108C	YNL108C	XRN1	P22147	1528 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YNL108C	YNL108C	GEA1	P47102	1408 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YNL108C	YNL108C	INO4	P13902	151 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YNL108C	YNL108C	NSA2	P40078	261 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YNL108C	YNL108C	YNL208W	P40159	199 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YNL108C	YNL108C	GAT4	P40569	121 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YNL108C	YNL108C	YFL019C	P43576	117 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YNL108C	YNL108C	PIR3	Q03180	325 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YNL108C	YNL108C	PAI3	P01094	68 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YNL108C	YNL108C	HMRA1	P0CY11	126 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YNL108C	YNL108C	NOP1	P15646	327 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
YNL108C	YNL108C	YER135C	P40082	130 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YNL108C	YNL108C	ATP19	P81451	68 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YNL108C	YNL108C	MRPS8	Q03799	155 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YNL108C	YNL108C	FCF1	Q05498	189 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
YNL108C	YNL108C	ANT1	Q06497	328 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YNL108C	YNL108C	YOL014W	Q08110	124 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YNL108C	YNL108C	YPR170W-B	P0C5R9	85 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YNL108C	YNL108C	DDR48	P18899	430 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
YNL108C	YNL108C	YCR050C	P25630	102 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YNL108C	YNL108C	MSL1	P40567	111 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
YNL108C	YNL108C	YMR252C	Q04814	134 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YNL108C	YNL108C	SYM1	Q06563	197 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YNL108C	YNL108C	ODC2	Q99297	307 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YNL108C	YNL108C	YIL177C	P40434	1758 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YNL108C	YNL108C	YJL225C	P40889	1758 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YNL108C	YNL108C	ZRT3	P34240	503 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YNL108C	YNL108C	SSS1	P35179	80 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YNL108C	YNL108C	UMP1	P38293	148 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YNL108C	YNL108C	YAR068W	P39564	161 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YNL108C	YNL108C	TDA2	P40045	126 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YNL108C	YNL108C	CAX4	P53223	239 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YNL108C	YNL108C	SMD1	Q02260	146 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
YNL108C	YNL108C	GAL83	Q04739	417 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YNL108C	YNL108C	YLR156W	P0CE96	114 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YNL108C	YNL108C	YLR159W	P0CE97	114 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YNL108C	YNL108C	YLR161W	P0CE98	114 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YNL108C	YNL108C	MDH2	P22133	377 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YNL108C	YNL108C	OM14	P38325	134 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YNL108C	YNL108C	YPR011C	Q12251	326 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YNL108C	YNL108C	YAR023C	D6VPM8	179 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YNL108C	YNL108C	CDC43	P18898	376 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YNL108C	YNL108C	FYV4	P38783	130 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
YNL108C	YNL108C	CYB5	P40312	120 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YNL108C	YNL108C	FLX1	P40464	311 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YNL108C	YNL108C	DIM1	P41819	318 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
YNL108C	YNL108C	YFR010W-A	P0C5N0	62 aa		4.5	□□□□□ -1.69
YNL108C	YNL108C	ATP15	P21306	62 aa		4.5	□□□□□ -1.69
YNL108C	YNL108C	PAM17	P36147	197 aa		4.5	□□□□□ -1.69
YNL108C	YNL108C	PHO88	P38264	188 aa	Predicted RBP	4.5	□□□□□ -1.69
YNL108C	YNL108C	SWM2	P40342	146 aa		4.5	□□□□□ -1.69
YNL108C	YNL108C	EMC5	P40540	141 aa		4.5	□□□□□ -1.69
YNL108C	YNL108C	YJL028W	P47062	111 aa		4.5	□□□□□ -1.69
YNL108C	YNL108C	DSK2	P48510	373 aa		4.5	□□□□□ -1.69
YNL108C	YNL108C	YDR415C	Q04033	374 aa	Predicted RBP	4.5	□□□□□ -1.69
YNL108C	YNL108C	TIM22	Q12328	207 aa		4.5	□□□□□ -1.69
YNL108C	YNL108C	ATG5	Q12380	294 aa		4.5	□□□□□ -1.69
YNL108C	YNL108C	YOS1	Q3E834	85 aa		4.5	□□□□□ -1.69
YNL108C	YNL108C	SUS1	Q6WNK7	96 aa		4.5	□□□□□ -1.69
YNL108C	YNL108C	NRG2	P38082	220 aa		4.49	□□□□□ -1.69
YNL108C	YNL108C	VTC1	P40046	129 aa	RIP-Chip data	4.49	□□□□□ -1.69	not detected
YNL108C	YNL108C	ARC15	P40518	154 aa	RIP-Chip data	4.49	□□□□□ -1.69	not detected
YNL108C	YNL108C	THG1	P53215	237 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
YNL108C	YNL108C	TVP15	Q03860	143 aa		4.49	□□□□□ -1.69
YNL108C	YNL108C	EMI1	Q04406	187 aa		4.49	□□□□□ -1.69
YNL108C	YNL108C	YLR112W	Q12130	139 aa		4.49	□□□□□ -1.69
YNL108C	YNL108C	BSC1	Q12140	328 aa		4.49	□□□□□ -1.69
YNL108C	YNL108C	SCS22	Q6Q595	175 aa		4.49	□□□□□ -1.69
YNL108C	YNL108C	KSH1	Q8TGJ3	72 aa		4.49	□□□□□ -1.69
YNL108C	YNL108C	AUS1	Q08409	1394 aa		4.49	□□□□□ -1.69
YNL108C	YNL108C	UBC4	P15731	148 aa		4.48	□□□□□ -1.69
YNL108C	YNL108C	YCR025C	P25352	136 aa		4.48	□□□□□ -1.69
YNL108C	YNL108C	YEL028W	P39989	153 aa		4.48	□□□□□ -1.69

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 70.3 ms