RNA–Protein interactions for RNA: YLR167W

RPS31, Transcript of Fusion protein cleaved to yield ribosomal protein S31 and ubiquitin, yeast

Gene RPS31, Length 459 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPS31	YLR167W	RPO21	P04050	1733 aa	Known RBP	2.79	□□□□□ -1.96
RPS31	YLR167W	DNF3	Q12674	1656 aa		2.79	□□□□□ -1.96
RPS31	YLR167W	FYV4	P38783	130 aa	Predicted RBP	2.78	□□□□□ -1.96
RPS31	YLR167W	YER135C	P40082	130 aa		2.78	□□□□□ -1.96
RPS31	YLR167W	YGL235W	P53071	178 aa		2.78	□□□□□ -1.96
RPS31	YLR167W	DAD4	P69851	72 aa		2.78	□□□□□ -1.96
RPS31	YLR167W	THI74	Q04083	370 aa		2.78	□□□□□ -1.96
RPS31	YLR167W	GAL83	Q04739	417 aa		2.78	□□□□□ -1.96
RPS31	YLR167W	YOR214C	Q12282	236 aa		2.78	□□□□□ -1.96
RPS31	YLR167W	EFG1	Q3E705	233 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
RPS31	YLR167W	PDR10	P51533	1564 aa		2.78	□□□□□ -1.96
RPS31	YLR167W	YCR023C	P25351	611 aa		2.77	□□□□□ -1.97
RPS31	YLR167W	YGL101W	P53144	215 aa		2.77	□□□□□ -1.97
RPS31	YLR167W	TIM13	P53299	105 aa		2.77	□□□□□ -1.97
RPS31	YLR167W	DIG2	Q03373	323 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
RPS31	YLR167W	RNH202	Q05635	350 aa		2.77	□□□□□ -1.97
RPS31	YLR167W	FYV12	Q08559	129 aa		2.77	□□□□□ -1.97
RPS31	YLR167W	ULS1	Q08562	1619 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RPS31	YLR167W	FLO9	P39712	1322 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RPS31	YLR167W	YKR045C	P36138	183 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RPS31	YLR167W	CSH1	P38287	376 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RPS31	YLR167W	YLR162W	Q06235	118 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RPS31	YLR167W	YPR174C	Q06616	221 aa	Predicted RBP	2.76	□□□□□ -1.97
RPS31	YLR167W	RPS28B	P0C0X0	67 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
RPS31	YLR167W	STP22	P25604	385 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RPS31	YLR167W	HSP30	P25619	332 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RPS31	YLR167W	RRT1	P38192	103 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RPS31	YLR167W	YBR219C	P38317	127 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RPS31	YLR167W	GLR1	P41921	483 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
RPS31	YLR167W	PRP11	Q07350	266 aa	Predicted RBP	2.75	□□□□□ -1.97
RPS31	YLR167W	YPR013C	Q12145	317 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RPS31	YLR167W	RPS28A	Q3E7X9	67 aa	Predicted RBP	2.75	□□□□□ -1.97
RPS31	YLR167W	ARO1	P08566	1588 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
RPS31	YLR167W	CPR5	P35176	225 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RPS31	YLR167W	YPL073C	P40323	161 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RPS31	YLR167W	SBH1	P52870	82 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RPS31	YLR167W	YKR005C	Q02203	525 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RPS31	YLR167W	VPS28	Q02767	242 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RPS31	YLR167W	YDR476C	Q03362	224 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RPS31	YLR167W	SPP41	P38904	1435 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RPS31	YLR167W	UBI4	P0CG63	381 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
RPS31	YLR167W	YBR220C	P38318	560 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RPS31	YLR167W	THG1	P53215	237 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
RPS31	YLR167W	LSM3	P57743	89 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
RPS31	YLR167W	GRX5	Q02784	150 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RPS31	YLR167W	YOR015W	Q12169	119 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RPS31	YLR167W	YLR046C	Q12253	270 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RPS31	YLR167W	SFK1	P35735	353 aa		2.72	□□□□□ -1.97
RPS31	YLR167W	SLM6	P38343	150 aa		2.72	□□□□□ -1.97
RPS31	YLR167W	YHL018W	P38744	120 aa	Predicted RBP	2.72	□□□□□ -1.97
RPS31	YLR167W	RPL13B	P40212	199 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
RPS31	YLR167W	SBH2	P52871	88 aa		2.72	□□□□□ -1.97
RPS31	YLR167W	YHR007C-A	Q07074	71 aa		2.72	□□□□□ -1.97
RPS31	YLR167W	RPL13A	Q12690	199 aa	Predicted RBP	2.72	□□□□□ -1.97
RPS31	YLR167W	YOR381W-A	Q3E804	55 aa		2.72	□□□□□ -1.97
RPS31	YLR167W	TOP2	P06786	1428 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
RPS31	YLR167W	MDM35	O60200	86 aa		2.71	□□□□□ -1.98
RPS31	YLR167W	YGL010W	P25338	174 aa		2.71	□□□□□ -1.98
RPS31	YLR167W	UPS2	P35200	230 aa		2.71	□□□□□ -1.98
RPS31	YLR167W	CSI2	Q08054	341 aa		2.71	□□□□□ -1.98
RPS31	YLR167W	PET20	Q99373	253 aa		2.71	□□□□□ -1.98
RPS31	YLR167W	BUD3	P25558	1636 aa		2.71	□□□□□ -1.98
RPS31	YLR167W	COX8	P04039	78 aa		2.7	□□□□□ -1.98
RPS31	YLR167W	RAD6	P06104	172 aa		2.7	□□□□□ -1.98
RPS31	YLR167W	BUB2	P26448	306 aa	Predicted RBP	2.7	□□□□□ -1.98
RPS31	YLR167W	DLS1	P40366	167 aa		2.7	□□□□□ -1.98
RPS31	YLR167W	BAT2	P47176	376 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
RPS31	YLR167W	ORM1	P53224	222 aa		2.7	□□□□□ -1.98
RPS31	YLR167W	PBI2	P0CT04	75 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
RPS31	YLR167W	GSP2	P32836	220 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
RPS31	YLR167W	YRA2	P36036	203 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.69	□□□□□ -1.98	not detected
RPS31	YLR167W	APQ12	P40532	138 aa		2.69	□□□□□ -1.98
RPS31	YLR167W	MOG1	P47123	218 aa		2.69	□□□□□ -1.98
RPS31	YLR167W	DML1	Q03652	475 aa		2.69	□□□□□ -1.98
RPS31	YLR167W	YSP2	Q06681	1438 aa		2.68	□□□□□ -1.98
RPS31	YLR167W	VTH1	P40438	1549 aa		2.68	□□□□□ -1.98
RPS31	YLR167W	VTH2	P40890	1549 aa		2.68	□□□□□ -1.98
RPS31	YLR167W	GDB1	Q06625	1536 aa		2.68	□□□□□ -1.98
RPS31	YLR167W	GPA2	P10823	449 aa		2.68	□□□□□ -1.98
RPS31	YLR167W	FLX1	P40464	311 aa		2.68	□□□□□ -1.98
RPS31	YLR167W	NQM1	P53228	333 aa	Predicted RBP	2.68	□□□□□ -1.98
RPS31	YLR167W	SYM1	Q06563	197 aa		2.68	□□□□□ -1.98
RPS31	YLR167W	YPR202W	Q08993	238 aa		2.68	□□□□□ -1.98
RPS31	YLR167W	CHC1	P22137	1653 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
RPS31	YLR167W	MLP2	P40457	1679 aa		2.68	□□□□□ -1.98
RPS31	YLR167W	FAS1	P07149	2051 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
RPS31	YLR167W	ATP5	P09457	212 aa		2.67	□□□□□ -1.98
RPS31	YLR167W	RPL2A	P0CX45	254 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
RPS31	YLR167W	RPL2B	P0CX46	254 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
RPS31	YLR167W	YEL073C	P39974	107 aa		2.67	□□□□□ -1.98
RPS31	YLR167W	HPA3	P39979	161 aa		2.67	□□□□□ -1.98
RPS31	YLR167W	NSE4	P43124	402 aa		2.67	□□□□□ -1.98
RPS31	YLR167W	ALB1	P47019	175 aa	Predicted RBP	2.67	□□□□□ -1.98
RPS31	YLR167W	PAC10	P48363	199 aa		2.67	□□□□□ -1.98
RPS31	YLR167W	PST2	Q12335	198 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
RPS31	YLR167W	TSC11	P40061	1430 aa		2.67	□□□□□ -1.98
RPS31	YLR167W	TRM3	Q07527	1436 aa		2.67	□□□□□ -1.98
RPS31	YLR167W	RPL30	P14120	105 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
RPS31	YLR167W	MAK31	P23059	88 aa		2.66	□□□□□ -1.98
RPS31	YLR167W	SRP102	P36057	244 aa	Predicted RBP	2.66	□□□□□ -1.98

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