RNA–Protein interactions for RNA: YKR059W

TIF1, Transcript of Translation initiation factor eIF4A, yeast

Gene TIF1, Length 1,188 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TIF1	YKR059W	NOC4	Q06512	552 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TIF1	YKR059W	MCH1	Q07376	486 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TIF1	YKR059W	YPS3	Q12303	508 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TIF1	YKR059W	YAL063C-A	Q3E791	96 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TIF1	YKR059W	YEL009C-A	A0A023PZF2	135 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TIF1	YKR059W	SIR2	P06700	562 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TIF1	YKR059W	TOM40	P23644	387 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TIF1	YKR059W	OAC1	P32332	324 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TIF1	YKR059W	RRT13	P40042	185 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TIF1	YKR059W	TOS8	P53147	276 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TIF1	YKR059W	YGL034C	P53186	121 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TIF1	YKR059W	YMR315W	Q04869	349 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TIF1	YKR059W	SRY1	P36007	326 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TIF1	YKR059W	PDX3	P38075	228 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TIF1	YKR059W	PIR5	P46999	287 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TIF1	YKR059W	YGL041W-A	P0C5N3	154 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TIF1	YKR059W	PEX17	P40155	199 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TIF1	YKR059W	PDS1	P40316	373 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TIF1	YKR059W	CAX4	P53223	239 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TIF1	YKR059W	RSM27	P53305	110 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TIF1	YKR059W	YMD8	Q03697	442 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TIF1	YKR059W	PST2	Q12335	198 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TIF1	YKR059W	BBP1	Q12365	385 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TIF1	YKR059W	AGC1	Q12482	902 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TIF1	YKR059W	DFM1	Q12743	341 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TIF1	YKR059W	IGO2	Q9P305	131 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TIF1	YKR059W	RPL25	P04456	142 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TIF1	YKR059W	PHO85	P17157	305 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TIF1	YKR059W	MIG1	P27705	504 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TIF1	YKR059W	CPR5	P35176	225 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TIF1	YKR059W	DLS1	P40366	167 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TIF1	YKR059W	TIR3	P40552	269 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TIF1	YKR059W	YDR114C	Q04597	100 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TIF1	YKR059W	UPS1	Q05776	175 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TIF1	YKR059W	TIR4	Q12218	487 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TIF1	YKR059W	YDL085C-A	Q3E7B7	68 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TIF1	YKR059W	COX9	P07255	59 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TIF1	YKR059W	SMP1	P38128	452 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TIF1	YKR059W	TEM1	P38987	245 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TIF1	YKR059W	YKE4	P40544	346 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TIF1	YKR059W	SYS1	P41544	203 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TIF1	YKR059W	CAT5	P41735	233 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TIF1	YKR059W	YPI1	P43587	155 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TIF1	YKR059W	ERJ5	P43613	295 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TIF1	YKR059W	SAY1	P53324	424 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TIF1	YKR059W	YAL067W-A	Q8TGK6	75 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TIF1	YKR059W	UBC8	P28263	218 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TIF1	YKR059W	YGL204C	P53089	101 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TIF1	YKR059W	ABF2	Q02486	183 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TIF1	YKR059W	MIX17	Q03667	156 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TIF1	YKR059W	HTL1	Q9URQ5	78 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TIF1	YKR059W	MRS1	P07266	363 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TIF1	YKR059W	SNF4	P12904	322 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TIF1	YKR059W	FIP1	P45976	327 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TIF1	YKR059W	RPA43	P46669	326 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TIF1	YKR059W	YJL028W	P47062	111 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TIF1	YKR059W	AIM25	P47140	327 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TIF1	YKR059W	TTI2	P47168	421 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TIF1	YKR059W	ERV29	P53337	310 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TIF1	YKR059W	YPL225W	Q08971	146 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
TIF1	YKR059W	MPD1	Q12404	318 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
TIF1	YKR059W	CPT1	P17898	393 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TIF1	YKR059W	ATG22	P25568	528 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TIF1	YKR059W	YCR101C	P25607	182 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TIF1	YKR059W	PEX4	P29340	183 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TIF1	YKR059W	SWD3	P38123	315 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TIF1	YKR059W	LSM7	P53905	115 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
TIF1	YKR059W	SMT3	Q12306	101 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
TIF1	YKR059W	ATG5	Q12380	294 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TIF1	YKR059W	YMR230W-A	Q3E7B5	62 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TIF1	YKR059W	ISD11	Q6Q560	94 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TIF1	YKR059W	RPS28B	P0C0X0	67 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
TIF1	YKR059W	YPT53	P36019	220 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TIF1	YKR059W	DOG2	P38773	246 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TIF1	YKR059W	DOG1	P38774	246 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TIF1	YKR059W	CCS1	P40202	249 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
TIF1	YKR059W	MRPS16	Q02608	121 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TIF1	YKR059W	ECM19	Q06011	112 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TIF1	YKR059W	YLR179C	Q06252	201 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
TIF1	YKR059W	YPL257W	Q08974	193 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TIF1	YKR059W	YLR050C	Q12155	161 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
TIF1	YKR059W	RPS28A	Q3E7X9	67 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
TIF1	YKR059W	YOR020W-A	Q3E824	90 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TIF1	YKR059W	KIN28	P06242	306 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TIF1	YKR059W	ACT1	P60010	375 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
TIF1	YKR059W	PLP1	Q04004	230 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TIF1	YKR059W	YPL264C	Q08980	353 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TIF1	YKR059W	HUT1	Q12520	339 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TIF1	YKR059W	ADK1	P07170	222 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
TIF1	YKR059W	RNP1	P32385	249 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TIF1	YKR059W	UTR5	P32630	166 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TIF1	YKR059W	SNC2	P33328	115 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TIF1	YKR059W	RCN1	P36054	211 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TIF1	YKR059W	MRPL27	P36526	146 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
TIF1	YKR059W	PAU12	P53343	120 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TIF1	YKR059W	MAK3	Q03503	176 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TIF1	YKR059W	YHR212W-A	P0CX91	67 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TIF1	YKR059W	IDP1	P21954	428 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
TIF1	YKR059W	SDH4	P37298	181 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TIF1	YKR059W	LSM1	P47017	172 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65

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