RNA–Protein interactions for RNA: YKL216W

URA1, Transcript of Dihydroorotate dehydrogenase, yeast

Gene URA1, Length 945 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
URA1	YKL216W	LST7	P53237	242 aa		5.08	□□□□□ -1.6
URA1	YKL216W	SCM3	Q12334	223 aa		5.08	□□□□□ -1.6
URA1	YKL216W	YCR075W-A	Q3E830	75 aa		5.08	□□□□□ -1.6
URA1	YKL216W	CYC1	P00044	109 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
URA1	YKL216W	VMA16	P23968	213 aa		5.07	□□□□□ -1.6
URA1	YKL216W	YGR025W	P53216	100 aa		5.07	□□□□□ -1.6
URA1	YKL216W	FMP41	P53889	259 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
URA1	YKL216W	HTZ1	Q12692	134 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
URA1	YKL216W	ANB1	P19211	157 aa		5.06	□□□□□ -1.6
URA1	YKL216W	HST4	P53688	370 aa		5.06	□□□□□ -1.6
URA1	YKL216W	HCH1	P53834	153 aa		5.06	□□□□□ -1.6
URA1	YKL216W	VPS28	Q02767	242 aa		5.06	□□□□□ -1.6
URA1	YKL216W	YOL160W	Q08321	113 aa		5.06	□□□□□ -1.6
URA1	YKL216W	VTS1	Q08831	523 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.06	□□□□□ -1.6	not detected
URA1	YKL216W	YKL162C	P36052	402 aa		5.05	□□□□□ -1.6
URA1	YKL216W	NIF3	P53081	288 aa		5.05	□□□□□ -1.6
URA1	YKL216W	IZH1	Q03419	316 aa		5.05	□□□□□ -1.6
URA1	YKL216W	POC4	Q12245	148 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
URA1	YKL216W	YBR126W-A	Q8TGU7	68 aa		5.05	□□□□□ -1.6
URA1	YKL216W	FCY2	P17064	533 aa		5.04	□□□□□ -1.6
URA1	YKL216W	YCR025C	P25352	136 aa		5.04	□□□□□ -1.6
URA1	YKL216W	IES5	P40060	125 aa		5.04	□□□□□ -1.6
URA1	YKL216W	LCL2	Q08045	131 aa		5.04	□□□□□ -1.6
URA1	YKL216W	YPL264C	Q08980	353 aa		5.04	□□□□□ -1.6
URA1	YKL216W	SEC22	P22214	214 aa		5.03	□□□□□ -1.6
URA1	YKL216W	IRC22	P40006	225 aa		5.03	□□□□□ -1.6
URA1	YKL216W	AIM24	P47127	394 aa		5.03	□□□□□ -1.6
URA1	YKL216W	ODC1	Q03028	310 aa		5.03	□□□□□ -1.6
URA1	YKL216W	CCW12	Q12127	133 aa		5.03	□□□□□ -1.6
URA1	YKL216W	AYT1	Q12226	474 aa		5.03	□□□□□ -1.6
URA1	YKL216W	CUP2	P15315	225 aa		5.02	□□□□□ -1.61
URA1	YKL216W	YCR016W	P25617	290 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
URA1	YKL216W	RPL13B	P40212	199 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
URA1	YKL216W	VHS2	P40463	436 aa		5.02	□□□□□ -1.61
URA1	YKL216W	SER2	P42941	309 aa		5.02	□□□□□ -1.61
URA1	YKL216W	PDR17	P53844	350 aa		5.02	□□□□□ -1.61
URA1	YKL216W	CRC1	Q12289	327 aa		5.02	□□□□□ -1.61
URA1	YKL216W	AIM45	Q12480	344 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
URA1	YKL216W	RPL13A	Q12690	199 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
URA1	YKL216W	DFR1	P07807	211 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.01	□□□□□ -1.61	not detected
URA1	YKL216W	RPS25B	P0C0T4	108 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
URA1	YKL216W	SFT2	P38166	215 aa		5.01	□□□□□ -1.61
URA1	YKL216W	SIT1	P39980	628 aa		5.01	□□□□□ -1.61
URA1	YKL216W	PRE5	P40302	234 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
URA1	YKL216W	YIL077C	P40508	320 aa		5.01	□□□□□ -1.61
URA1	YKL216W	SNO1	Q03144	224 aa		5.01	□□□□□ -1.61
URA1	YKL216W	YMR090W	Q04304	227 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
URA1	YKL216W	TRM13	Q12383	476 aa		5.01	□□□□□ -1.61
URA1	YKL216W	RDI1	Q12434	202 aa		5.01	□□□□□ -1.61
URA1	YKL216W	RPS25A	Q3E792	108 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
URA1	YKL216W	MRP2	P10663	115 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
URA1	YKL216W	SUA5	P32579	426 aa		5	□□□□□ -1.61
URA1	YKL216W	TIR2	P33890	251 aa		5	□□□□□ -1.61
URA1	YKL216W	SPC1	P46965	94 aa		5	□□□□□ -1.61
URA1	YKL216W	YIF1	P53845	314 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
URA1	YKL216W	ERV2	Q12284	196 aa		5	□□□□□ -1.61
URA1	YKL216W	YPR145C-A	Q2V2P0	78 aa		5	□□□□□ -1.61
URA1	YKL216W	TPI1	P00942	248 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
URA1	YKL216W	ATG27	P46989	271 aa		4.99	□□□□□ -1.61
URA1	YKL216W	MIC27	P50945	234 aa		4.99	□□□□□ -1.61
URA1	YKL216W	LSM7	P53905	115 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
URA1	YKL216W	YMR316C-A	I2HB70	103 aa		4.98	□□□□□ -1.61
URA1	YKL216W	YHR022C	P38763	256 aa		4.98	□□□□□ -1.61
URA1	YKL216W	SAS2	P40963	338 aa		4.98	□□□□□ -1.61
URA1	YKL216W	CDC40	P40968	455 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
URA1	YKL216W	YJR096W	P47137	282 aa		4.98	□□□□□ -1.61
URA1	YKL216W	GPG1	P53130	126 aa		4.98	□□□□□ -1.61
URA1	YKL216W	NGL1	Q08213	363 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
URA1	YKL216W	POM34	Q12445	299 aa		4.98	□□□□□ -1.61
URA1	YKL216W	DDI2	P0CH63	225 aa		4.97	□□□□□ -1.61
URA1	YKL216W	DDI3	P0CH64	225 aa		4.97	□□□□□ -1.61
URA1	YKL216W	EMP24	P32803	203 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
URA1	YKL216W	NPL6	P32832	435 aa		4.97	□□□□□ -1.61
URA1	YKL216W	SHB17	P36136	271 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
URA1	YKL216W	MRPL4	P36517	319 aa		4.97	□□□□□ -1.61
URA1	YKL216W	TPN1	P53099	579 aa		4.97	□□□□□ -1.61
URA1	YKL216W	YNR071C	P53757	342 aa		4.97	□□□□□ -1.61
URA1	YKL216W	BOR1	P53838	576 aa		4.97	□□□□□ -1.61
URA1	YKL216W	COA4	Q05809	96 aa		4.97	□□□□□ -1.61
URA1	YKL216W	ENV7	Q12003	364 aa		4.97	□□□□□ -1.61
URA1	YKL216W	USV1	Q12132	391 aa		4.97	□□□□□ -1.61
URA1	YKL216W	NKP1	Q12493	238 aa		4.97	□□□□□ -1.61
URA1	YKL216W	YGR240C-A	Q3E786	66 aa		4.97	□□□□□ -1.61
URA1	YKL216W	TFB5	Q3E7C1	72 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
URA1	YKL216W	MRPL3	P36516	390 aa		4.96	□□□□□ -1.62
URA1	YKL216W	YPC1	P38298	316 aa		4.96	□□□□□ -1.62
URA1	YKL216W	IPI1	P38803	334 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
URA1	YKL216W	TOM7	P53507	60 aa		4.96	□□□□□ -1.62
URA1	YKL216W	COA2	Q3E823	68 aa		4.96	□□□□□ -1.62
URA1	YKL216W	YPL229W	Q99395	206 aa		4.96	□□□□□ -1.62
URA1	YKL216W	ELF1	P36053	145 aa		4.95	□□□□□ -1.62
URA1	YKL216W	LSM2	P38203	95 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
URA1	YKL216W	SLM6	P38343	150 aa		4.95	□□□□□ -1.62
URA1	YKL216W	SWM2	P40342	146 aa		4.95	□□□□□ -1.62
URA1	YKL216W	CWC23	P52868	283 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
URA1	YKL216W	YPS5	P53057	165 aa		4.95	□□□□□ -1.62
URA1	YKL216W	GPI15	P53961	229 aa		4.95	□□□□□ -1.62
URA1	YKL216W	SHH3	Q04487	196 aa		4.95	□□□□□ -1.62
URA1	YKL216W	ARG80	P07249	177 aa		4.94	□□□□□ -1.62
URA1	YKL216W	NHP6B	P11633	99 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62

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