RNA–Protein interactions for RNA: YEL009C

GCN4, Transcript of bZIP transcriptional activator of amino acid biosynthetic genes, yeastyeast

Gene GCN4, Length 846 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GCN4YEL009C COA2Q3E823 68 aa1.75□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C YHR213W-AQ8TGT4 77 aa1.75□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C CDC39P25655 2108 aaKnown RBP1.75□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C UBI4P0CG63 381 aaKnown RBP1.74□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C FCY2P17064 533 aa1.74□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C YCR025CP25352 136 aa1.74□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C INO2P26798 304 aa1.74□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C EMP24P32803 203 aaKnown RBP1.74□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C UPS2P35200 230 aa1.74□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C MRPL38P35996 138 aaPredicted RBP1.74□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C YCR041WP37265 110 aa1.74□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C PRS4P38063 326 aaPredicted RBP1.74□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C SLM6P38343 150 aa1.74□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C YPT31P38555 223 aaKnown RBP1.74□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C ASP1P38986 381 aaPredicted RBP1.74□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C GCV3P39726 170 aaPredicted RBP1.74□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C HXT14P42833 540 aa1.74□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C SNX4P47057 423 aa1.74□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C SRB7P47822 140 aa1.74□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C MRPS17Q03246 237 aaPredicted RBP1.74□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C DCS1Q06151 350 aa1.74□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C FRQ1Q06389 190 aa1.74□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C MSA1Q08471 629 aa1.74□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C POC4Q12245 148 aaPredicted RBP1.74□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C YPS3Q12303 508 aa1.74□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C PRR2Q12310 699 aa1.74□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C AGC1Q12482 902 aa1.74□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C YDR157WA0A023PZE8 133 aa1.73□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C ILV5P06168 395 aaKnown RBP1.73□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C RPS25BP0C0T4 108 aaKnown RBP1.73□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C YPS1P32329 569 aa1.73□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C YBL059WP34224 193 aa1.73□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C YKL075CP36083 450 aa1.73□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C UIP3P39547 235 aa1.73□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C YAR068WP39564 161 aa1.73□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C YGR269WP40326 108 aa1.73□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C EMC5P40540 141 aa1.73□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C YJR015WP47090 510 aa1.73□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C VPS55P47111 140 aa1.73□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C ERG25P53045 309 aa1.73□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C YHP1Q04116 353 aa1.73□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C SPG4Q04438 115 aa1.73□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C HOR7Q05827 59 aa1.73□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C YLR179CQ06252 201 aaKnown RBP1.73□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C PBP4Q07362 185 aaKnown RBP1.73□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C IRC23Q08416 157 aa1.73□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C RAD28Q12021 506 aa1.73□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C ERV2Q12284 196 aa1.73□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C PAA1Q12447 191 aaKnown RBP1.73□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C FMP16Q12497 93 aa1.73□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C RPS25AQ3E792 108 aaPredicted RBP1.73□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C PET494P07390 489 aaPredicted RBP1.72□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C QCR9P22289 66 aa1.72□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C SPO13P23624 291 aa1.72□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C ELO2P25358 347 aa1.72□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C AHT1P29589 182 aa1.72□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C FPR2P32472 135 aa1.72□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C YKL102CP34249 101 aa1.72□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C PRY2P36110 329 aa1.72□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C SHB17P36136 271 aaKnown RBP1.72□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C YBL071CP38185 102 aa1.72□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C RRT1P38192 103 aa1.72□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C QDR3P38227 689 aa1.72□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C YBR292CP38357 123 aa1.72□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C DOG2P38773 246 aa1.72□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C DOG1P38774 246 aa1.72□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C VMA7P39111 118 aa1.72□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C BDH1P39714 382 aa1.72□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C UBC12P52491 188 aa1.72□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C TOS8P53147 276 aa1.72□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C YGR018CP53211 109 aa1.72□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C ORM1P53224 222 aa1.72□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C LST7P53237 242 aa1.72□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C YGR219WP53307 113 aa1.72□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C YNR066CP53752 436 aa1.72□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C SWT21P53873 357 aaPredicted RBP1.72□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C YCL001W-AP87012 153 aa1.72□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C YMR007WQ03675 126 aa1.72□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C SHH3Q04487 196 aa1.72□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C CTR3Q06686 241 aa1.72□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C YOR015WQ12169 119 aa1.72□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C YGR035W-AQ45U48 73 aa1.72□□□□□ -2.13
GCN4YEL009C YMR316C-AI2HB70 103 aa1.71□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C PIS1P06197 220 aaKnown RBP1.71□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C CDC7P06243 507 aa1.71□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C DFR1P07807 211 aaKnown RBP RIP-Chip data1.71□□□□□ -2.14not detected
GCN4YEL009C ZRC1P20107 442 aa1.71□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C VMA16P23968 213 aa1.71□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C CDC50P25656 391 aa1.71□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C ARO2P28777 376 aaKnown RBP1.71□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C MSK1P32048 576 aa1.71□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C ICS2P38284 255 aa1.71□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C CSH1P38287 376 aa1.71□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C DER1P38307 211 aa1.71□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C SHG1P38337 142 aa1.71□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C MIC12P38341 106 aa1.71□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C SNU13P39990 126 aaKnown RBP1.71□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C SPC25P40014 221 aa1.71□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C SYG1P40528 902 aa1.71□□□□□ -2.14
GCN4YEL009C AGE2P40529 298 aa1.71□□□□□ -2.14
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