RNA–Protein interactions for RNA: YDR247W

VHS1, Transcript of Cytoplasmic serine/threonine protein kinase, yeastyeast

Gene VHS1, Length 1,386 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VHS1YDR247W SHB17P36136 271 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.69
VHS1YDR247W CUE1P38428 203 aa4.53□□□□□ -1.69
VHS1YDR247W NCA3P46955 337 aa4.53□□□□□ -1.69
VHS1YDR247W RIB4P50861 169 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.69
VHS1YDR247W YOR186WQ08560 144 aa4.53□□□□□ -1.69
VHS1YDR247W NIP7Q08962 181 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.69
VHS1YDR247W PPT2Q12036 173 aa4.53□□□□□ -1.69
VHS1YDR247W FRE8Q12209 686 aa4.53□□□□□ -1.69
VHS1YDR247W RPL9AP05738 191 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
VHS1YDR247W RPL31AP0C2H8 113 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
VHS1YDR247W YGL010WP25338 174 aa4.52□□□□□ -1.69
VHS1YDR247W SWD3P38123 315 aa4.52□□□□□ -1.69
VHS1YDR247W YGR269WP40326 108 aa4.52□□□□□ -1.69
VHS1YDR247W WWM1P43582 211 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
VHS1YDR247W LOC1P43586 204 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
VHS1YDR247W TRM9P49957 279 aa4.52□□□□□ -1.69
VHS1YDR247W RPL9BP51401 191 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
VHS1YDR247W PKR1Q03880 122 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
VHS1YDR247W CDC39P25655 2108 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
VHS1YDR247W VPS63O13549 108 aa4.51□□□□□ -1.69
VHS1YDR247W QCR9P22289 66 aa4.51□□□□□ -1.69
VHS1YDR247W DEG1P31115 442 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
VHS1YDR247W TCA17P32613 152 aa4.51□□□□□ -1.69
VHS1YDR247W YUH1P35127 236 aa4.51□□□□□ -1.69
VHS1YDR247W SRX1P36077 127 aa4.51□□□□□ -1.69
VHS1YDR247W YMR262WP38430 313 aa4.51□□□□□ -1.69
VHS1YDR247W COX14P39103 70 aa4.51□□□□□ -1.69
VHS1YDR247W YIL086CP40503 102 aa4.51□□□□□ -1.69
VHS1YDR247W CDC40P40968 455 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
VHS1YDR247W TTI2P47168 421 aa4.51□□□□□ -1.69
VHS1YDR247W RPN14P53196 417 aa4.51□□□□□ -1.69
VHS1YDR247W NAT3Q06504 195 aa4.51□□□□□ -1.69
VHS1YDR247W NAT5Q08689 176 aa4.51□□□□□ -1.69
VHS1YDR247W AKR2Q12013 749 aa4.51□□□□□ -1.69
VHS1YDR247W RPS22AP0C0W1 130 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
VHS1YDR247W YBL059WP34224 193 aa4.5□□□□□ -1.69
VHS1YDR247W RPB11P38902 120 aa4.5□□□□□ -1.69
VHS1YDR247W CCS1P40202 249 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
VHS1YDR247W GEP7P53171 287 aa4.5□□□□□ -1.69
VHS1YDR247W YMR007WQ03675 126 aa4.5□□□□□ -1.69
VHS1YDR247W YMR317WQ04893 1140 aa4.5□□□□□ -1.69
VHS1YDR247W MSC3Q05812 728 aa4.5□□□□□ -1.69
VHS1YDR247W YOL118CQ08259 102 aa4.5□□□□□ -1.69
VHS1YDR247W USB1Q12208 290 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
VHS1YDR247W YOR192C-CQ3E736 78 aa4.5□□□□□ -1.69
VHS1YDR247W SPO24Q3E752 67 aa4.5□□□□□ -1.69
VHS1YDR247W BRR2P32639 2163 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
VHS1YDR247W FAB1P34756 2278 aa4.49□□□□□ -1.69
VHS1YDR247W FAS1P07149 2051 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
VHS1YDR247W RPS16AP0CX51 143 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
VHS1YDR247W RPS16BP0CX52 143 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
VHS1YDR247W HAP3P13434 144 aa4.49□□□□□ -1.69
VHS1YDR247W FCY2P17064 533 aa4.49□□□□□ -1.69
VHS1YDR247W SPS18P32572 300 aa4.49□□□□□ -1.69
VHS1YDR247W TIR2P33890 251 aa4.49□□□□□ -1.69
VHS1YDR247W COX15P40086 486 aa4.49□□□□□ -1.69
VHS1YDR247W YIL029CP40538 142 aa4.49□□□□□ -1.69
VHS1YDR247W GPI2P46961 280 aa4.49□□□□□ -1.69
VHS1YDR247W CRH1P53301 507 aa4.49□□□□□ -1.69
VHS1YDR247W RPL21AQ02753 160 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
VHS1YDR247W YPL067CQ02754 198 aa4.49□□□□□ -1.69
VHS1YDR247W CWC27Q02770 301 aa4.49□□□□□ -1.69
VHS1YDR247W CSI2Q08054 341 aa4.49□□□□□ -1.69
VHS1YDR247W YOR292CQ08743 309 aa4.49□□□□□ -1.69
VHS1YDR247W RPL21BQ12672 160 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
VHS1YDR247W YCL021W-AQ96VH3 125 aa4.49□□□□□ -1.69
VHS1YDR247W BLM10P43583 2143 aa4.48□□□□□ -1.69
VHS1YDR247W PRM5P40476 318 aa4.48□□□□□ -1.69
VHS1YDR247W YGR050CP53231 118 aa4.48□□□□□ -1.69
VHS1YDR247W YPL077CQ02831 240 aa4.48□□□□□ -1.69
VHS1YDR247W LOA1Q06508 300 aa4.48□□□□□ -1.69
VHS1YDR247W MCH1Q07376 486 aa4.48□□□□□ -1.69
VHS1YDR247W RFU1Q08003 200 aa4.48□□□□□ -1.69
VHS1YDR247W MPD1Q12404 318 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
VHS1YDR247W TRP1P00912 224 aa4.47□□□□□ -1.69
VHS1YDR247W YHR214C-DP0CX93 97 aa4.47□□□□□ -1.69
VHS1YDR247W MSI1P13712 422 aa4.47□□□□□ -1.69
VHS1YDR247W MIG1P27705 504 aa4.47□□□□□ -1.69
VHS1YDR247W CWP1P28319 239 aa4.47□□□□□ -1.69
VHS1YDR247W SUA7P29055 345 aaPredicted RBP4.47□□□□□ -1.69
VHS1YDR247W YER134CP40081 178 aa4.47□□□□□ -1.69
VHS1YDR247W REE1P40893 198 aa4.47□□□□□ -1.69
VHS1YDR247W ABM1P47146 123 aa4.47□□□□□ -1.69
VHS1YDR247W SHH3Q04487 196 aa4.47□□□□□ -1.69
VHS1YDR247W RIM9Q04734 239 aa4.47□□□□□ -1.69
VHS1YDR247W TVP18Q04767 167 aa4.47□□□□□ -1.69
VHS1YDR247W YOR105WQ08504 108 aa4.47□□□□□ -1.69
VHS1YDR247W GRE1Q08969 168 aa4.47□□□□□ -1.69
VHS1YDR247W SMT3Q12306 101 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
VHS1YDR247W ATG40Q99325 256 aa4.47□□□□□ -1.69
VHS1YDR247W FLO9P39712 1322 aa4.46□□□□□ -1.7
VHS1YDR247W IMP1P28627 190 aa4.46□□□□□ -1.7
VHS1YDR247W YKL102CP34249 101 aa4.46□□□□□ -1.7
VHS1YDR247W PAU16P35994 123 aa4.46□□□□□ -1.7
VHS1YDR247W DER1P38307 211 aa4.46□□□□□ -1.7
VHS1YDR247W AME1P38313 324 aa4.46□□□□□ -1.7
VHS1YDR247W DOG1P38774 246 aa4.46□□□□□ -1.7
VHS1YDR247W CYB5P40312 120 aa4.46□□□□□ -1.7
VHS1YDR247W YIL163CP40448 117 aa4.46□□□□□ -1.7
VHS1YDR247W ARP3P47117 449 aaKnown RBP4.46□□□□□ -1.7
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