RNA–Protein interactions for RNA: YPR108W

RPN7, Transcript of Essential non-ATPase regulatory subunit of the 26S proteasome, yeast

Gene RPN7, Length 1,290 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPN7	YPR108W	FMP49	A0A023PZB3	126 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPN7	YPR108W	PAU19	P0CE85	124 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPN7	YPR108W	PAU21	P0CE86	164 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPN7	YPR108W	PAU22	P0CE87	164 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPN7	YPR108W	PCL1	P24867	279 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPN7	YPR108W	PAU3	P25610	124 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPN7	YPR108W	ICS2	P38284	255 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPN7	YPR108W	PTC7	P38797	343 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPN7	YPR108W	RPB11	P38902	120 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPN7	YPR108W	ARP3	P47117	449 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RPN7	YPR108W	YGR026W	P53217	278 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPN7	YPR108W	AVO2	Q04749	426 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPN7	YPR108W	YMR253C	Q04835	414 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPN7	YPR108W	FRQ1	Q06389	190 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPN7	YPR108W	ATG5	Q12380	294 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPN7	YPR108W	YOP1	Q12402	180 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPN7	YPR108W	COA2	Q3E823	68 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPN7	YPR108W	CDC39	P25655	2108 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RPN7	YPR108W	SUA7	P29055	345 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RPN7	YPR108W	RPL14A	P36105	138 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RPN7	YPR108W	YBL071C	P38185	102 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPN7	YPR108W	QDR3	P38227	689 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPN7	YPR108W	YHL037C	P38733	133 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPN7	YPR108W	RPL14B	P38754	138 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RPN7	YPR108W	PAU5	P43575	122 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPN7	YPR108W	GON7	P46984	123 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPN7	YPR108W	YJL118W	P47022	219 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPN7	YPR108W	SBH2	P52871	88 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPN7	YPR108W	YGL114W	P53134	725 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPN7	YPR108W	STD1	Q02794	444 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPN7	YPR108W	NRG1	Q03125	231 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPN7	YPR108W	SNO1	Q03144	224 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPN7	YPR108W	YLR118C	Q12354	227 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPN7	YPR108W	DFR1	P07807	211 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.9	□□□□□ -1.63	not detected
RPN7	YPR108W	CDC50	P25656	391 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPN7	YPR108W	AHT1	P29589	182 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPN7	YPR108W	SPS18	P32572	300 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPN7	YPR108W	IES6	P32617	166 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPN7	YPR108W	REC104	P33323	182 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPN7	YPR108W	SDH4	P37298	181 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPN7	YPR108W	GPI18	P38211	433 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPN7	YPR108W	DER1	P38307	211 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPN7	YPR108W	MTC6	P38849	526 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPN7	YPR108W	NSE4	P43124	402 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPN7	YPR108W	SHH3	Q04487	196 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPN7	YPR108W	YDL009C	Q12210	107 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPN7	YPR108W	YOR192C-C	Q3E736	78 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPN7	YPR108W	DAL3	P32459	195 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPN7	YPR108W	SSS1	P35179	80 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPN7	YPR108W	GPI2	P46961	280 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPN7	YPR108W	DAN1	P47178	298 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPN7	YPR108W	FYV6	P53913	173 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPN7	YPR108W	CTR3	Q06686	241 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPN7	YPR108W	MED7	Q08278	222 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPN7	YPR108W	POM33	Q12164	279 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPN7	YPR108W	RKI1	Q12189	258 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPN7	YPR108W	NCE102	Q12207	173 aa	RIP-Chip data	4.89	□□□□□ -1.63	not detected
RPN7	YPR108W	PAA1	Q12447	191 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RPN7	YPR108W	RAX2	Q12465	1220 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPN7	YPR108W	HTB1	P02293	131 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RPN7	YPR108W	NOP1	P15646	327 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RPN7	YPR108W	ERS1	P17261	260 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPN7	YPR108W	MRPL20	P22354	195 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RPN7	YPR108W	POF1	P25576	258 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPN7	YPR108W	SPC29	P33419	253 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPN7	YPR108W	YBL059W	P34224	193 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPN7	YPR108W	AVT5	P38176	459 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPN7	YPR108W	YAR068W	P39564	161 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPN7	YPR108W	PIR5	P46999	287 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPN7	YPR108W	YJR015W	P47090	510 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPN7	YPR108W	YGR045C	P53229	120 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPN7	YPR108W	YNR071C	P53757	342 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPN7	YPR108W	SKO1	Q02100	647 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPN7	YPR108W	LOA1	Q06508	300 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPN7	YPR108W	YOR105W	Q08504	108 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPN7	YPR108W	YPR063C	Q12160	140 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPN7	YPR108W	HMRA1	P0CY11	126 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPN7	YPR108W	FEN2	P25621	512 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPN7	YPR108W	PMU1	P36069	295 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPN7	YPR108W	RRT1	P38192	103 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPN7	YPR108W	IMD2	P38697	523 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPN7	YPR108W	LSM4	P40070	187 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPN7	YPR108W	YGL260W	P53056	76 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPN7	YPR108W	YGL185C	P53100	379 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPN7	YPR108W	LST7	P53237	242 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPN7	YPR108W	TEX1	P53851	422 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPN7	YPR108W	TIM10	P87108	93 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPN7	YPR108W	MRX11	Q03079	207 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPN7	YPR108W	ARR3	Q06598	404 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPN7	YPR108W	PIS1	P06197	220 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RPN7	YPR108W	NTF2	P33331	125 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RPN7	YPR108W	DOG2	P38773	246 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPN7	YPR108W	DOG1	P38774	246 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPN7	YPR108W	YHR173C	P38864	112 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPN7	YPR108W	FLO5	P38894	1075 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPN7	YPR108W	YGR269W	P40326	108 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPN7	YPR108W	ATG27	P46989	271 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPN7	YPR108W	BNS1	P50084	137 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPN7	YPR108W	HCH1	P53834	153 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPN7	YPR108W	YPL108W	Q02872	168 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63

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