RNA–Protein interactions for RNA: YMR088C

VBA1, Transcript of Permease of basic amino acids in the vacuolar membrane, yeast

Gene VBA1, Length 1,689 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VBA1	YMR088C	VPS71	Q03433	280 aa		4.78	□□□□□ -1.64
VBA1	YMR088C	KEI1	Q06346	221 aa		4.78	□□□□□ -1.64
VBA1	YMR088C	RRG7	Q08774	242 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
VBA1	YMR088C	FIT3	Q08907	204 aa		4.78	□□□□□ -1.64
VBA1	YMR088C	RLM1	Q12224	676 aa		4.78	□□□□□ -1.64
VBA1	YMR088C	VMR1	P38735	1592 aa		4.78	□□□□□ -1.64
VBA1	YMR088C	ECM12	O13529	151 aa		4.77	□□□□□ -1.65
VBA1	YMR088C	RPS19A	P07280	144 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
VBA1	YMR088C	RPS19B	P07281	144 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
VBA1	YMR088C	POP5	P28005	173 aa		4.77	□□□□□ -1.65
VBA1	YMR088C	URA10	P30402	227 aa		4.77	□□□□□ -1.65
VBA1	YMR088C	MRPL6	P32904	214 aa		4.77	□□□□□ -1.65
VBA1	YMR088C	YKR073C	P36153	106 aa		4.77	□□□□□ -1.65
VBA1	YMR088C	ATX1	P38636	73 aa		4.77	□□□□□ -1.65
VBA1	YMR088C	IRC22	P40006	225 aa		4.77	□□□□□ -1.65
VBA1	YMR088C	YPL073C	P40323	161 aa		4.77	□□□□□ -1.65
VBA1	YMR088C	EGT2	P42835	1041 aa		4.77	□□□□□ -1.65
VBA1	YMR088C	UBX6	P47049	396 aa		4.77	□□□□□ -1.65
VBA1	YMR088C	MSS11	Q03825	758 aa		4.77	□□□□□ -1.65
VBA1	YMR088C	YMR082C	Q04276	118 aa		4.77	□□□□□ -1.65
VBA1	YMR088C	YMR103C	Q04436	120 aa		4.77	□□□□□ -1.65
VBA1	YMR088C	YLR049C	Q12110	428 aa		4.77	□□□□□ -1.65
VBA1	YMR088C	ERV2	Q12284	196 aa		4.77	□□□□□ -1.65
VBA1	YMR088C	IGO2	Q9P305	131 aa		4.77	□□□□□ -1.65
VBA1	YMR088C	MRS1	P07266	363 aa		4.77	□□□□□ -1.65
VBA1	YMR088C	PAU19	P0CE85	124 aa		4.77	□□□□□ -1.65
VBA1	YMR088C	PAU21	P0CE86	164 aa		4.77	□□□□□ -1.65
VBA1	YMR088C	PAU22	P0CE87	164 aa		4.77	□□□□□ -1.65
VBA1	YMR088C	PAU3	P25610	124 aa		4.77	□□□□□ -1.65
VBA1	YMR088C	SRP21	P32342	167 aa		4.77	□□□□□ -1.65
VBA1	YMR088C	MSN2	P33748	704 aa		4.77	□□□□□ -1.65
VBA1	YMR088C	YKR070W	P36151	352 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
VBA1	YMR088C	MIX23	P38162	196 aa		4.77	□□□□□ -1.65
VBA1	YMR088C	BUD8	P41698	603 aa		4.77	□□□□□ -1.65
VBA1	YMR088C	BAT2	P47176	376 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
VBA1	YMR088C	BET5	Q03630	159 aa		4.77	□□□□□ -1.65
VBA1	YMR088C	COX5A	P00424	153 aa		4.76	□□□□□ -1.65
VBA1	YMR088C	KAR4	P25583	335 aa		4.76	□□□□□ -1.65
VBA1	YMR088C	ATS1	P31386	333 aa		4.76	□□□□□ -1.65
VBA1	YMR088C	CTP1	P38152	299 aa		4.76	□□□□□ -1.65
VBA1	YMR088C	YHR138C	P38841	114 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
VBA1	YMR088C	YNL198C	P40166	100 aa		4.76	□□□□□ -1.65
VBA1	YMR088C	RRT5	P43607	289 aa		4.76	□□□□□ -1.65
VBA1	YMR088C	TEX1	P53851	422 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
VBA1	YMR088C	LSM3	P57743	89 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
VBA1	YMR088C	YPL039W	Q03080	316 aa		4.76	□□□□□ -1.65
VBA1	YMR088C	YLR149C	Q99296	730 aa		4.76	□□□□□ -1.65
VBA1	YMR088C	OPI3	P05375	206 aa		4.75	□□□□□ -1.65
VBA1	YMR088C	RPL20A	P0CX23	172 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
VBA1	YMR088C	RPL20B	P0CX24	172 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
VBA1	YMR088C	PUP3	P25451	205 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
VBA1	YMR088C	FMP46	P36141	133 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
VBA1	YMR088C	ASP1	P38986	381 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
VBA1	YMR088C	ATG27	P46989	271 aa		4.75	□□□□□ -1.65
VBA1	YMR088C	SCW4	P53334	386 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
VBA1	YMR088C	RNH201	P53942	307 aa		4.75	□□□□□ -1.65
VBA1	YMR088C	YNL033W	P53964	284 aa		4.75	□□□□□ -1.65
VBA1	YMR088C	YNL019C	P53975	284 aa		4.75	□□□□□ -1.65
VBA1	YMR088C	YMR090W	Q04304	227 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
VBA1	YMR088C	HRT1	Q08273	121 aa		4.75	□□□□□ -1.65
VBA1	YMR088C	IZH2	Q12442	317 aa		4.75	□□□□□ -1.65
VBA1	YMR088C	YDL007C-A	Q2V2Q0	85 aa		4.75	□□□□□ -1.65
VBA1	YMR088C	MSI1	P13712	422 aa		4.74	□□□□□ -1.65
VBA1	YMR088C	ERG24	P32462	438 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
VBA1	YMR088C	CCS1	P40202	249 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
VBA1	YMR088C	TVP15	Q03860	143 aa		4.74	□□□□□ -1.65
VBA1	YMR088C	YDL157C	Q12082	118 aa		4.74	□□□□□ -1.65
VBA1	YMR088C	YOR097C	Q12274	175 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
VBA1	YMR088C	ILV1	P00927	576 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
VBA1	YMR088C	RPS13	P05756	151 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
VBA1	YMR088C	YAR066W	P0CX18	203 aa		4.73	□□□□□ -1.65
VBA1	YMR088C	YHR214W	P0CX19	203 aa		4.73	□□□□□ -1.65
VBA1	YMR088C	SWD2	P36104	329 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
VBA1	YMR088C	MST28	P39552	234 aa		4.73	□□□□□ -1.65
VBA1	YMR088C	CYB5	P40312	120 aa		4.73	□□□□□ -1.65
VBA1	YMR088C	YJL218W	P40892	196 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
VBA1	YMR088C	TIS11	P47977	285 aa		4.73	□□□□□ -1.65
VBA1	YMR088C	NUP100	Q02629	959 aa		4.73	□□□□□ -1.65
VBA1	YMR088C	YMR166C	Q03829	368 aa		4.73	□□□□□ -1.65
VBA1	YMR088C	NMA1	Q06178	401 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
VBA1	YMR088C	RPS10A	Q08745	105 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
VBA1	YMR088C	YPS3	Q12303	508 aa		4.73	□□□□□ -1.65
VBA1	YMR088C	YPL119C-A	Q3E751	87 aa		4.73	□□□□□ -1.65
VBA1	YMR088C	DNF3	Q12674	1656 aa		4.73	□□□□□ -1.65
VBA1	YMR088C	POR1	P04840	283 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
VBA1	YMR088C	CDC43	P18898	376 aa		4.73	□□□□□ -1.65
VBA1	YMR088C	MTR2	P34232	184 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
VBA1	YMR088C	NSA2	P40078	261 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
VBA1	YMR088C	EMC5	P40540	141 aa		4.73	□□□□□ -1.65
VBA1	YMR088C	EMC4	P53073	190 aa		4.73	□□□□□ -1.65
VBA1	YMR088C	CAX4	P53223	239 aa		4.73	□□□□□ -1.65
VBA1	YMR088C	YMR087W	Q04299	284 aa		4.73	□□□□□ -1.65
VBA1	YMR088C	YMR317W	Q04893	1140 aa		4.73	□□□□□ -1.65
VBA1	YMR088C	YPL162C	Q12042	273 aa		4.73	□□□□□ -1.65
VBA1	YMR088C	JID1	Q12350	301 aa		4.73	□□□□□ -1.65
VBA1	YMR088C	YPL229W	Q99395	206 aa		4.73	□□□□□ -1.65
VBA1	YMR088C	MRS3	P10566	314 aa		4.72	□□□□□ -1.65
VBA1	YMR088C	TOM40	P23644	387 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
VBA1	YMR088C	YGL010W	P25338	174 aa		4.72	□□□□□ -1.65
VBA1	YMR088C	YJL213W	P40896	331 aa		4.72	□□□□□ -1.65

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 16.5 ms