RNA–Protein interactions for RNA: YMR068W

AVO2, Transcript of Component of a complex containing the Tor2p kinase and other proteins, yeast

Gene AVO2, Length 1,281 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AVO2	YMR068W	YMR31	P19955	123 aa		4.72	□□□□□ -1.65
AVO2	YMR068W	ZRT3	P34240	503 aa		4.72	□□□□□ -1.65
AVO2	YMR068W	CBT1	P36038	271 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
AVO2	YMR068W	ECM31	P38122	312 aa		4.72	□□□□□ -1.65
AVO2	YMR068W	MCH1	Q07376	486 aa		4.72	□□□□□ -1.65
AVO2	YMR068W	RFU1	Q08003	200 aa		4.72	□□□□□ -1.65
AVO2	YMR068W	TPI1	P00942	248 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
AVO2	YMR068W	FUS3	P16892	353 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
AVO2	YMR068W	RPC19	P28000	142 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
AVO2	YMR068W	POP8	P38208	133 aa		4.71	□□□□□ -1.66
AVO2	YMR068W	EDC2	P40023	145 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
AVO2	YMR068W	YGL118C	P53132	145 aa		4.71	□□□□□ -1.66
AVO2	YMR068W	CAB4	P53332	305 aa		4.71	□□□□□ -1.66
AVO2	YMR068W	YPL067C	Q02754	198 aa		4.71	□□□□□ -1.66
AVO2	YMR068W	YMR226C	Q05016	267 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
AVO2	YMR068W	DXO1	Q06349	442 aa		4.71	□□□□□ -1.66
AVO2	YMR068W	DFM1	Q12743	341 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
AVO2	YMR068W	SRP102	P36057	244 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
AVO2	YMR068W	ERG28	P40030	148 aa		4.7	□□□□□ -1.66
AVO2	YMR068W	YFR035C	P43608	114 aa		4.7	□□□□□ -1.66
AVO2	YMR068W	YJR056C	P47115	236 aa		4.7	□□□□□ -1.66
AVO2	YMR068W	SOL1	P50278	321 aa		4.7	□□□□□ -1.66
AVO2	YMR068W	SLX9	P53251	210 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
AVO2	YMR068W	FMP41	P53889	259 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
AVO2	YMR068W	CTF19	Q02732	369 aa		4.7	□□□□□ -1.66
AVO2	YMR068W	YKL183C-A	Q3E765	70 aa		4.7	□□□□□ -1.66
AVO2	YMR068W	YAL063C-A	Q3E791	96 aa		4.7	□□□□□ -1.66
AVO2	YMR068W	YAL067W-A	Q8TGK6	75 aa		4.7	□□□□□ -1.66
AVO2	YMR068W	RPL30	P14120	105 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
AVO2	YMR068W	DPB2	P24482	689 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
AVO2	YMR068W	ROX3	P25046	220 aa		4.69	□□□□□ -1.66
AVO2	YMR068W	FAR8	Q05040	523 aa		4.69	□□□□□ -1.66
AVO2	YMR068W	BBP1	Q12365	385 aa		4.69	□□□□□ -1.66
AVO2	YMR068W	MHF2	Q3E829	80 aa		4.69	□□□□□ -1.66
AVO2	YMR068W	NUF2	P33895	451 aa		4.68	□□□□□ -1.66
AVO2	YMR068W	GOS1	P38736	223 aa		4.68	□□□□□ -1.66
AVO2	YMR068W	ASP1	P38986	381 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
AVO2	YMR068W	AVT6	P40074	448 aa		4.68	□□□□□ -1.66
AVO2	YMR068W	HAM1	P47119	197 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
AVO2	YMR068W	PEX12	Q04370	399 aa		4.68	□□□□□ -1.66
AVO2	YMR068W	MPD1	Q12404	318 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
AVO2	YMR068W	STF2	P16965	84 aa		4.67	□□□□□ -1.66
AVO2	YMR068W	PHO80	P20052	293 aa		4.67	□□□□□ -1.66
AVO2	YMR068W	TMA19	P35691	167 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
AVO2	YMR068W	YKL075C	P36083	450 aa		4.67	□□□□□ -1.66
AVO2	YMR068W	SKG1	P36169	355 aa		4.67	□□□□□ -1.66
AVO2	YMR068W	YNL194C	P40169	301 aa		4.67	□□□□□ -1.66
AVO2	YMR068W	PRE5	P40302	234 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
AVO2	YMR068W	MRPL49	P40858	161 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
AVO2	YMR068W	MIC26	P50087	233 aa		4.67	□□□□□ -1.66
AVO2	YMR068W	YLR152C	P54072	576 aa		4.67	□□□□□ -1.66
AVO2	YMR068W	HAL1	Q01766	294 aa		4.67	□□□□□ -1.66
AVO2	YMR068W	ECM19	Q06011	112 aa		4.67	□□□□□ -1.66
AVO2	YMR068W	RIB3	Q99258	208 aa		4.67	□□□□□ -1.66
AVO2	YMR068W	CDC10	P25342	322 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
AVO2	YMR068W	ERG2	P32352	222 aa		4.66	□□□□□ -1.66
AVO2	YMR068W	YGL101W	P53144	215 aa		4.66	□□□□□ -1.66
AVO2	YMR068W	YOL085C	Q99345	113 aa		4.66	□□□□□ -1.66
AVO2	YMR068W	MPC2	P38857	129 aa		4.65	□□□□□ -1.67
AVO2	YMR068W	YRB2	P40517	327 aa		4.65	□□□□□ -1.67
AVO2	YMR068W	CWC23	P52868	283 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
AVO2	YMR068W	TOS8	P53147	276 aa		4.65	□□□□□ -1.67
AVO2	YMR068W	CAX4	P53223	239 aa		4.65	□□□□□ -1.67
AVO2	YMR068W	AAH1	P53909	347 aa		4.65	□□□□□ -1.67
AVO2	YMR068W	YKL068W-A	Q3E826	78 aa		4.65	□□□□□ -1.67
AVO2	YMR068W	ASF2	P32448	525 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
AVO2	YMR068W	RIO2	P40160	425 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
AVO2	YMR068W	SWT21	P53873	357 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
AVO2	YMR068W	YKR005C	Q02203	525 aa		4.64	□□□□□ -1.67
AVO2	YMR068W	NSL1	Q12143	216 aa		4.64	□□□□□ -1.67
AVO2	YMR068W	YLR126C	Q12288	251 aa		4.64	□□□□□ -1.67
AVO2	YMR068W	ATG22	P25568	528 aa		4.63	□□□□□ -1.67
AVO2	YMR068W	HPM1	P40481	377 aa		4.63	□□□□□ -1.67
AVO2	YMR068W	TIR3	P40552	269 aa		4.63	□□□□□ -1.67
AVO2	YMR068W	MRH4	P53166	561 aa		4.63	□□□□□ -1.67
AVO2	YMR068W	DCN1	Q12395	269 aa		4.63	□□□□□ -1.67
AVO2	YMR068W	ADH1	P00330	348 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
AVO2	YMR068W	RPL28	P02406	149 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
AVO2	YMR068W	NTF2	P33331	125 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
AVO2	YMR068W	ECM33	P38248	429 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
AVO2	YMR068W	IPT1	P38954	527 aa		4.62	□□□□□ -1.67
AVO2	YMR068W	TSA2	Q04120	196 aa		4.62	□□□□□ -1.67
AVO2	YMR068W	MRX8	Q05473	314 aa		4.62	□□□□□ -1.67
AVO2	YMR068W	COX10	P21592	462 aa		4.61	□□□□□ -1.67
AVO2	YMR068W	SYS1	P41544	203 aa		4.61	□□□□□ -1.67
AVO2	YMR068W	TTI2	P47168	421 aa		4.61	□□□□□ -1.67
AVO2	YMR068W	YGL159W	P53110	370 aa		4.61	□□□□□ -1.67
AVO2	YMR068W	YGR018C	P53211	109 aa		4.61	□□□□□ -1.67
AVO2	YMR068W	SNZ1	Q03148	297 aa		4.61	□□□□□ -1.67
AVO2	YMR068W	TIR4	Q12218	487 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
AVO2	YMR068W	TAR1	Q8TGM6	124 aa		4.61	□□□□□ -1.67
AVO2	YMR068W	YDR157W	A0A023PZE8	133 aa		4.6	□□□□□ -1.67
AVO2	YMR068W	RPL27A	P0C2H6	136 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
AVO2	YMR068W	RPL27B	P0C2H7	136 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
AVO2	YMR068W	GRX2	P17695	143 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
AVO2	YMR068W	SNF6	P18888	332 aa		4.6	□□□□□ -1.67
AVO2	YMR068W	MRS4	P23500	304 aa		4.6	□□□□□ -1.67
AVO2	YMR068W	MCM22	P47167	239 aa		4.6	□□□□□ -1.67
AVO2	YMR068W	MGA1	P53050	456 aa		4.6	□□□□□ -1.67
AVO2	YMR068W	GGA1	Q06336	557 aa		4.6	□□□□□ -1.67

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