RNA–Protein interactions for RNA: YKR047W

YKR047W, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YKR047W, Length 306 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKR047WYKR047W SAY1P53324 424 aa2.84□□□□□ -1.95
YKR047WYKR047W CUE4Q04201 117 aaPredicted RBP2.84□□□□□ -1.95
YKR047WYKR047W GAL83Q04739 417 aa2.84□□□□□ -1.95
YKR047WYKR047W YPR202WQ08993 238 aa2.84□□□□□ -1.95
YKR047WYKR047W UBI4P0CG63 381 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
YKR047WYKR047W STP22P25604 385 aa2.83□□□□□ -1.96
YKR047WYKR047W DSE2P38844 325 aa2.83□□□□□ -1.96
YKR047WYKR047W LSM3P57743 89 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
YKR047WYKR047W SML1Q04964 104 aa2.83□□□□□ -1.96
YKR047WYKR047W YOR214CQ12282 236 aa2.83□□□□□ -1.96
YKR047WYKR047W PET54P10834 293 aa2.82□□□□□ -1.96
YKR047WYKR047W IDP1P21954 428 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
YKR047WYKR047W PEX34P25584 144 aa2.82□□□□□ -1.96
YKR047WYKR047W TFC1P32367 649 aa2.82□□□□□ -1.96
YKR047WYKR047W NRG2P38082 220 aa2.82□□□□□ -1.96
YKR047WYKR047W LSM1P47017 172 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
YKR047WYKR047W VPS28Q02767 242 aa2.82□□□□□ -1.96
YKR047WYKR047W RAD28Q12021 506 aa2.82□□□□□ -1.96
YKR047WYKR047W ATP20Q12233 115 aa2.82□□□□□ -1.96
YKR047WYKR047W YHR086W-AQ3E746 53 aa2.82□□□□□ -1.96
YKR047WYKR047W PBI2P0CT04 75 aaKnown RBP2.81□□□□□ -1.96
YKR047WYKR047W RPL2AP0CX45 254 aaKnown RBP2.81□□□□□ -1.96
YKR047WYKR047W RPL2BP0CX46 254 aaKnown RBP2.81□□□□□ -1.96
YKR047WYKR047W MDH2P22133 377 aa2.81□□□□□ -1.96
YKR047WYKR047W NUF2P33895 451 aa2.81□□□□□ -1.96
YKR047WYKR047W FYV4P38783 130 aaPredicted RBP2.81□□□□□ -1.96
YKR047WYKR047W YNL200CP40165 246 aaKnown RBP2.81□□□□□ -1.96
YKR047WYKR047W KNH1P50112 268 aa2.81□□□□□ -1.96
YKR047WYKR047W YNL033WP53964 284 aa2.81□□□□□ -1.96
YKR047WYKR047W RRP17Q04031 235 aaPredicted RBP2.81□□□□□ -1.96
YKR047WYKR047W YLR046CQ12253 270 aa2.81□□□□□ -1.96
YKR047WYKR047W YBR220CP38318 560 aa2.8□□□□□ -1.96
YKR047WYKR047W VMA22P38784 181 aa2.8□□□□□ -1.96
YKR047WYKR047W ORM1P53224 222 aa2.8□□□□□ -1.96
YKR047WYKR047W POP3P53833 195 aaPredicted RBP2.8□□□□□ -1.96
YKR047WYKR047W YDC1Q02896 317 aa2.8□□□□□ -1.96
YKR047WYKR047W SEC11P15367 167 aa2.79□□□□□ -1.96
YKR047WYKR047W APQ12P40532 138 aa2.79□□□□□ -1.96
YKR047WYKR047W GLR1P41921 483 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
YKR047WYKR047W YKR005CQ02203 525 aa2.79□□□□□ -1.96
YKR047WYKR047W BOL1Q3E793 110 aa2.79□□□□□ -1.96
YKR047WYKR047W PHO85P17157 305 aa2.78□□□□□ -1.96
YKR047WYKR047W HSP30P25619 332 aa2.78□□□□□ -1.96
YKR047WYKR047W PEP8P40335 379 aa2.78□□□□□ -1.96
YKR047WYKR047W DLS1P40366 167 aa2.78□□□□□ -1.96
YKR047WYKR047W MOG1P47123 218 aa2.78□□□□□ -1.96
YKR047WYKR047W HHT1P61830 136 aa2.78□□□□□ -1.96
YKR047WYKR047W BUD25P85052 153 aa2.78□□□□□ -1.96
YKR047WYKR047W ANT1Q06497 328 aa2.78□□□□□ -1.96
YKR047WYKR047W YOR1P53049 1477 aa2.77□□□□□ -1.97
YKR047WYKR047W RAD6P06104 172 aa2.77□□□□□ -1.97
YKR047WYKR047W RPL30P14120 105 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
YKR047WYKR047W RRT1P38192 103 aa2.77□□□□□ -1.97
YKR047WYKR047W YAP3P38749 330 aa2.77□□□□□ -1.97
YKR047WYKR047W SOK1P40317 901 aa2.77□□□□□ -1.97
YKR047WYKR047W AYR1P40471 297 aa2.77□□□□□ -1.97
YKR047WYKR047W YPR013CQ12145 317 aa2.77□□□□□ -1.97
YKR047WYKR047W FLO9P39712 1322 aa2.76□□□□□ -1.97
YKR047WYKR047W UBC8P28263 218 aa2.76□□□□□ -1.97
YKR047WYKR047W YPL073CP40323 161 aa2.76□□□□□ -1.97
YKR047WYKR047W RNH202Q05635 350 aa2.76□□□□□ -1.97
YKR047WYKR047W YPR174CQ06616 221 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
YKR047WYKR047W TRM3Q07527 1436 aa2.76□□□□□ -1.97
YKR047WYKR047W ATP5P09457 212 aa2.75□□□□□ -1.97
YKR047WYKR047W PTC1P35182 281 aa2.75□□□□□ -1.97
YKR047WYKR047W RIO2P40160 425 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
YKR047WYKR047W PKR1Q03880 122 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
YKR047WYKR047W RAV2Q03956 351 aa2.75□□□□□ -1.97
YKR047WYKR047W PRP11Q07350 266 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
YKR047WYKR047W YER135CP40082 130 aa2.74□□□□□ -1.97
YKR047WYKR047W GRX5Q02784 150 aa2.74□□□□□ -1.97
YKR047WYKR047W SPA2P23201 1466 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
YKR047WYKR047W TMA19P35691 167 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
YKR047WYKR047W SFK1P35735 353 aa2.73□□□□□ -1.97
YKR047WYKR047W IPI1P38803 334 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
YKR047WYKR047W YEL028WP39989 153 aa2.73□□□□□ -1.97
YKR047WYKR047W PIR1Q03178 341 aa2.73□□□□□ -1.97
YKR047WYKR047W SYM1Q06563 197 aa2.73□□□□□ -1.97
YKR047WYKR047W YLR422WQ06409 1932 aa2.73□□□□□ -1.97
YKR047WYKR047W YKR045CP36138 183 aa2.72□□□□□ -1.97
YKR047WYKR047W YHL018WP38744 120 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
YKR047WYKR047W FIP1P45976 327 aa2.72□□□□□ -1.97
YKR047WYKR047W MSB2P32334 1306 aa2.71□□□□□ -1.98
YKR047WYKR047W SSN2P38931 1420 aa2.71□□□□□ -1.98
YKR047WYKR047W GSP2P32836 220 aaKnown RBP2.71□□□□□ -1.98
YKR047WYKR047W YJR015WP47090 510 aa2.71□□□□□ -1.98
YKR047WYKR047W YGL193CP53097 103 aa2.71□□□□□ -1.98
YKR047WYKR047W YOR381W-AQ3E804 55 aa2.71□□□□□ -1.98
YKR047WYKR047W DUR1,2P32528 1835 aaKnown RBP2.7□□□□□ -1.98
YKR047WYKR047W COX8P04039 78 aa2.7□□□□□ -1.98
YKR047WYKR047W ACP1P32463 125 aa2.7□□□□□ -1.98
YKR047WYKR047W HTD2P38790 280 aaKnown RBP2.7□□□□□ -1.98
YKR047WYKR047W DAD4P69851 72 aa2.7□□□□□ -1.98
YKR047WYKR047W YOR015WQ12169 119 aa2.7□□□□□ -1.98
YKR047WYKR047W UPS2P35200 230 aa2.69□□□□□ -1.98
YKR047WYKR047W YBR219CP38317 127 aa2.69□□□□□ -1.98
YKR047WYKR047W YEL073CP39974 107 aa2.69□□□□□ -1.98
YKR047WYKR047W THG1P53215 237 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
YKR047WYKR047W YDR391CQ04170 232 aa2.69□□□□□ -1.98
YKR047WYKR047W RIM9Q04734 239 aa2.69□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 54.2 ms