RNA–Protein interactions for RNA: YKL125W

RRN3, Transcript of Protein required for transcription of rDNA by RNA polymerase I, yeast

Gene RRN3, Length 1,884 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RRN3	YKL125W	PGA1	P53896	198 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RRN3	YKL125W	TRI1	Q05024	226 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RRN3	YKL125W	CPT1	P17898	393 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RRN3	YKL125W	CMC1	P36064	111 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RRN3	YKL125W	YKR070W	P36151	352 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RRN3	YKL125W	ATX1	P38636	73 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RRN3	YKL125W	MET31	Q03081	177 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RRN3	YKL125W	BET5	Q03630	159 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RRN3	YKL125W	DGA1	Q08650	418 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RRN3	YKL125W	YDR215C	Q12240	137 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RRN3	YKL125W	RPL7A	P05737	244 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RRN3	YKL125W	CTA1	P15202	515 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RRN3	YKL125W	UBC5	P15732	148 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RRN3	YKL125W	TRR1	P29509	319 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RRN3	YKL125W	FYV4	P38783	130 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RRN3	YKL125W	RPB11	P38902	120 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RRN3	YKL125W	OST2	P46964	130 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RRN3	YKL125W	YJL118W	P47022	219 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RRN3	YKL125W	UBC11	P52492	156 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RRN3	YKL125W	ALG13	P53178	202 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RRN3	YKL125W	RPL21A	Q02753	160 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RRN3	YKL125W	SYM1	Q06563	197 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RRN3	YKL125W	RPL21B	Q12672	160 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RRN3	YKL125W	YBR182C-A	Q8TGU6	64 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RRN3	YKL125W	YOR338W	Q99326	363 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RRN3	YKL125W	MRS1	P07266	363 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RRN3	YKL125W	MRPL20	P22354	195 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RRN3	YKL125W	TIF34	P40217	347 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RRN3	YKL125W	CIN2	P46670	268 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RRN3	YKL125W	PRY1	P47032	299 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RRN3	YKL125W	XPT1	P47165	209 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RRN3	YKL125W	YIP5	P53108	310 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RRN3	YKL125W	ARC18	Q05933	178 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RRN3	YKL125W	STP3	Q05937	343 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RRN3	YKL125W	HRT1	Q08273	121 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RRN3	YKL125W	YCR024C-B	Q3E7Z8	88 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RRN3	YKL125W	FIG2	P25653	1609 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RRN3	YKL125W	COX9	P07255	59 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRN3	YKL125W	PAU1	P0CE88	120 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRN3	YKL125W	PAU14	P0CE89	120 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRN3	YKL125W	PAU6	P0CE90	120 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRN3	YKL125W	PAU18	P0CE91	120 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRN3	YKL125W	PAU8	P0CE92	120 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRN3	YKL125W	PAU11	P0CE93	120 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRN3	YKL125W	YAR066W	P0CX18	203 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRN3	YKL125W	YHR214W	P0CX19	203 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRN3	YKL125W	MSI1	P13712	422 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRN3	YKL125W	YGL010W	P25338	174 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRN3	YKL125W	PAU13	P38725	120 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRN3	YKL125W	YIL169C	P40442	995 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRN3	YKL125W	UBC9	P50623	157 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RRN3	YKL125W	PAU4	P53427	120 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRN3	YKL125W	PAU10	Q03050	120 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRN3	YKL125W	FCF1	Q05498	189 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RRN3	YKL125W	LIP2	Q06005	328 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRN3	YKL125W	XYL2	Q07993	356 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRN3	YKL125W	PAU20	Q08322	120 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRN3	YKL125W	PAU9	Q3E770	120 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRN3	YKL125W	ODC2	Q99297	307 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRN3	YKL125W	ATG40	Q99325	256 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRN3	YKL125W	VPS63	O13549	108 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRN3	YKL125W	DIF1	O13577	133 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRN3	YKL125W	COX5A	P00424	153 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRN3	YKL125W	SGE1	P33335	543 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRN3	YKL125W	KTI12	P34253	313 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RRN3	YKL125W	YBR292C	P38357	123 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRN3	YKL125W	VBA2	P38358	474 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RRN3	YKL125W	ECM14	P38836	430 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRN3	YKL125W	SDP1	P40479	209 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRN3	YKL125W	YIL059C	P40520	121 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRN3	YKL125W	YGR039W	P53225	103 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRN3	YKL125W	YMR082C	Q04276	118 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRN3	YKL125W	NAT3	Q06504	195 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRN3	YKL125W	YOR376W	Q08900	122 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRN3	YKL125W	YPQ1	Q12010	308 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRN3	YKL125W	SME1	Q12330	94 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RRN3	YKL125W	PEX11	Q12462	236 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRN3	YKL125W	CCH1	P50077	2039 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRN3	YKL125W	RPL12A	P0CX53	165 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RRN3	YKL125W	RPL12B	P0CX54	165 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RRN3	YKL125W	STE18	P18852	110 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RRN3	YKL125W	HXT4	P32467	576 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RRN3	YKL125W	MKK1	P32490	508 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RRN3	YKL125W	GPX1	P36014	167 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RRN3	YKL125W	CWP2	P43497	92 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RRN3	YKL125W	RPS10B	P46784	105 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RRN3	YKL125W	WSC2	P53832	503 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RRN3	YKL125W	ALG9	P53868	555 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RRN3	YKL125W	SLG1	P54867	378 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RRN3	YKL125W	RPS10A	Q08745	105 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RRN3	YKL125W	CHO1	P08456	276 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RRN3	YKL125W	CDC26	P14724	124 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RRN3	YKL125W	KRE1	P17260	313 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RRN3	YKL125W	SRP21	P32342	167 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RRN3	YKL125W	SPS18	P32572	300 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RRN3	YKL125W	SWD2	P36104	329 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RRN3	YKL125W	YEL068C	P39977	110 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RRN3	YKL125W	YFR057W	P43625	151 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RRN3	YKL125W	YDL186W	P48568	277 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RRN3	YKL125W	IES4	Q08561	116 aa		4.54	□□□□□ -1.68

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