RNA–Protein interactions for RNA: YJR003C

YJR003C, Transcript of Putative protein of unknown function, yeastyeast

Gene YJR003C, Length 1,560 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YJR003CYJR003C YPR170W-BP0C5R9 85 aa0.64□□□□□ -2.31
YJR003CYJR003C CDC10P25342 322 aaKnown RBP0.64□□□□□ -2.31
YJR003CYJR003C YNL217WP40152 326 aa0.64□□□□□ -2.31
YJR003CYJR003C PEX17P40155 199 aa0.64□□□□□ -2.31
YJR003CYJR003C PGD1P40356 397 aa0.64□□□□□ -2.31
YJR003CYJR003C NSA1P53136 463 aaPredicted RBP0.64□□□□□ -2.31
YJR003CYJR003C LSM3P57743 89 aaKnown RBP0.64□□□□□ -2.31
YJR003CYJR003C RRN5Q02983 363 aa0.64□□□□□ -2.31
YJR003CYJR003C YLR283WQ05867 314 aa0.64□□□□□ -2.31
YJR003CYJR003C YLR162WQ06235 118 aa0.64□□□□□ -2.31
YJR003CYJR003C PRP11Q07350 266 aaPredicted RBP0.64□□□□□ -2.31
YJR003CYJR003C YDL180WQ12301 547 aa0.64□□□□□ -2.31
YJR003CYJR003C LSO2Q3E772 92 aaKnown RBP0.64□□□□□ -2.31
YJR003CYJR003C RHO1P06780 209 aaKnown RBP0.63□□□□□ -2.31
YJR003CYJR003C SPT3P06844 337 aa0.63□□□□□ -2.31
YJR003CYJR003C CDC33P07260 213 aaKnown RBP0.63□□□□□ -2.31
YJR003CYJR003C RPL27BP0C2H7 136 aaKnown RBP0.63□□□□□ -2.31
YJR003CYJR003C RPL2AP0CX45 254 aaKnown RBP0.63□□□□□ -2.31
YJR003CYJR003C RPL2BP0CX46 254 aaKnown RBP0.63□□□□□ -2.31
YJR003CYJR003C MRPS28P21771 286 aa0.63□□□□□ -2.31
YJR003CYJR003C RAD51P25454 400 aa0.63□□□□□ -2.31
YJR003CYJR003C YCR016WP25617 290 aaKnown RBP0.63□□□□□ -2.31
YJR003CYJR003C NTF2P33331 125 aaKnown RBP0.63□□□□□ -2.31
YJR003CYJR003C UPS2P35200 230 aa0.63□□□□□ -2.31
YJR003CYJR003C VPS21P36017 210 aaKnown RBP0.63□□□□□ -2.31
YJR003CYJR003C DOG2P38773 246 aa0.63□□□□□ -2.31
YJR003CYJR003C IRC22P40006 225 aa0.63□□□□□ -2.31
YJR003CYJR003C RPL13BP40212 199 aaKnown RBP0.63□□□□□ -2.31
YJR003CYJR003C YRB2P40517 327 aa0.63□□□□□ -2.31
YJR003CYJR003C APQ12P40532 138 aa0.63□□□□□ -2.31
YJR003CYJR003C SIP18P50263 79 aa0.63□□□□□ -2.31
YJR003CYJR003C AIF1P52923 378 aa0.63□□□□□ -2.31
YJR003CYJR003C YNL247WP53852 767 aaKnown RBP0.63□□□□□ -2.31
YJR003CYJR003C PET117Q02771 107 aa0.63□□□□□ -2.31
YJR003CYJR003C YDR249CQ03787 373 aa0.63□□□□□ -2.31
YJR003CYJR003C LPP1Q04396 274 aa0.63□□□□□ -2.31
YJR003CYJR003C RPL13AQ12690 199 aaPredicted RBP0.63□□□□□ -2.31
YJR003CYJR003C REP2P03872 296 aa0.62□□□□□ -2.31
YJR003CYJR003C RPL35AP0CX84 120 aaKnown RBP0.62□□□□□ -2.31
YJR003CYJR003C RPL35BP0CX85 120 aaKnown RBP0.62□□□□□ -2.31
YJR003CYJR003C YHR212W-AP0CX91 67 aa0.62□□□□□ -2.31
YJR003CYJR003C GPA2P10823 449 aa0.62□□□□□ -2.31
YJR003CYJR003C URA6P15700 204 aa0.62□□□□□ -2.31
YJR003CYJR003C ATG22P25568 528 aa0.62□□□□□ -2.31
YJR003CYJR003C FZF1P32805 299 aa0.62□□□□□ -2.31
YJR003CYJR003C YET1P35723 206 aa0.62□□□□□ -2.31
YJR003CYJR003C MRPL28P36527 147 aa0.62□□□□□ -2.31
YJR003CYJR003C APS3P47064 194 aa0.62□□□□□ -2.31
YJR003CYJR003C LIA1P47120 325 aaKnown RBP0.62□□□□□ -2.31
YJR003CYJR003C SOL1P50278 321 aa0.62□□□□□ -2.31
YJR003CYJR003C BOL2P53082 120 aa0.62□□□□□ -2.31
YJR003CYJR003C FYV6P53913 173 aa0.62□□□□□ -2.31
YJR003CYJR003C SNZ1Q03148 297 aa0.62□□□□□ -2.31
YJR003CYJR003C RCE1Q03530 315 aa0.62□□□□□ -2.31
YJR003CYJR003C TIM9O74700 87 aa0.62□□□□□ -2.31
YJR003CYJR003C YLR156WP0CE96 114 aa0.62□□□□□ -2.31
YJR003CYJR003C YLR159WP0CE97 114 aa0.62□□□□□ -2.31
YJR003CYJR003C YLR161WP0CE98 114 aa0.62□□□□□ -2.31
YJR003CYJR003C MATALPHA1P0CY06 175 aa0.62□□□□□ -2.31
YJR003CYJR003C HMLALPHA1P0CY07 175 aa0.62□□□□□ -2.31
YJR003CYJR003C NSP1P14907 823 aaKnown RBP0.62□□□□□ -2.31
YJR003CYJR003C SEC14P24280 304 aaKnown RBP0.62□□□□□ -2.31
YJR003CYJR003C YCR099CP25657 155 aa0.62□□□□□ -2.31
YJR003CYJR003C SSO1P32867 290 aa0.62□□□□□ -2.31
YJR003CYJR003C MAK5P38112 773 aaPredicted RBP0.62□□□□□ -2.31
YJR003CYJR003C FES1P38260 290 aa0.62□□□□□ -2.31
YJR003CYJR003C TRS20P38334 175 aa0.62□□□□□ -2.31
YJR003CYJR003C POP4P38336 279 aa0.62□□□□□ -2.31
YJR003CYJR003C YFR035CP43608 114 aa0.62□□□□□ -2.31
YJR003CYJR003C DOC1P53068 250 aa0.62□□□□□ -2.31
YJR003CYJR003C SAY1P53324 424 aa0.62□□□□□ -2.31
YJR003CYJR003C TDA8Q6B2U8 126 aa0.62□□□□□ -2.31
YJR003CYJR003C CDC28P00546 298 aaKnown RBP0.61□□□□□ -2.31
YJR003CYJR003C QCR8P08525 94 aa0.61□□□□□ -2.31
YJR003CYJR003C GCY1P14065 312 aaKnown RBP RIP-Chip data0.61□□□□□ -2.31not detected
YJR003CYJR003C ROX3P25046 220 aa0.61□□□□□ -2.31
YJR003CYJR003C SUA7P29055 345 aaPredicted RBP0.61□□□□□ -2.31
YJR003CYJR003C TMA19P35691 167 aaKnown RBP0.61□□□□□ -2.31
YJR003CYJR003C SRY1P36007 326 aa0.61□□□□□ -2.31
YJR003CYJR003C VPS51P36116 164 aa0.61□□□□□ -2.31
YJR003CYJR003C SKG1P36169 355 aa0.61□□□□□ -2.31
YJR003CYJR003C UMP1P38293 148 aa0.61□□□□□ -2.31
YJR003CYJR003C FAR7P43592 221 aa0.61□□□□□ -2.31
YJR003CYJR003C CCC1P47818 322 aa0.61□□□□□ -2.31
YJR003CYJR003C MIC26P50087 233 aa0.61□□□□□ -2.31
YJR003CYJR003C YNR064CP53750 290 aa0.61□□□□□ -2.31
YJR003CYJR003C SWP1Q02795 286 aa0.61□□□□□ -2.31
YJR003CYJR003C YDR248CQ03786 193 aa0.61□□□□□ -2.31
YJR003CYJR003C CDC123Q05791 360 aa0.61□□□□□ -2.31
YJR003CYJR003C GRE1Q08969 168 aa0.61□□□□□ -2.31
YJR003CYJR003C RIO1Q12196 484 aaKnown RBP0.61□□□□□ -2.31
YJR003CYJR003C RPL39P04650 51 aa0.6□□□□□ -2.31
YJR003CYJR003C RPL24BP24000 155 aaKnown RBP0.6□□□□□ -2.31
YJR003CYJR003C SNC2P33328 115 aa0.6□□□□□ -2.31
YJR003CYJR003C MSN4P33749 630 aa0.6□□□□□ -2.31
YJR003CYJR003C MRPL17P36528 281 aa0.6□□□□□ -2.31
YJR003CYJR003C YBR209WP38311 105 aa0.6□□□□□ -2.31
YJR003CYJR003C YER085CP40058 173 aa0.6□□□□□ -2.31
YJR003CYJR003C COX15P40086 486 aa0.6□□□□□ -2.31
YJR003CYJR003C BXI1P48558 297 aa0.6□□□□□ -2.31
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