RNA–Protein interactions for RNA: YEL070W

DSF1, Transcript of Putative mannitol dehydrogenase, yeast

Gene DSF1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DSF1	YEL070W	MRPS16	Q02608	121 aa		4.73	□□□□□ -1.65
DSF1	YEL070W	GEP3	Q08622	556 aa		4.73	□□□□□ -1.65
DSF1	YEL070W	TIM18	Q08749	192 aa		4.73	□□□□□ -1.65
DSF1	YEL070W	YPL264C	Q08980	353 aa		4.73	□□□□□ -1.65
DSF1	YEL070W	USV1	Q12132	391 aa		4.73	□□□□□ -1.65
DSF1	YEL070W	AIM45	Q12480	344 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
DSF1	YEL070W	COA2	Q3E823	68 aa		4.73	□□□□□ -1.65
DSF1	YEL070W	SEC22	P22214	214 aa		4.72	□□□□□ -1.65
DSF1	YEL070W	YCR022C	P25620	114 aa		4.72	□□□□□ -1.65
DSF1	YEL070W	RTC3	P38804	111 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
DSF1	YEL070W	BDH1	P39714	382 aa		4.72	□□□□□ -1.65
DSF1	YEL070W	SIM1	P40472	476 aa		4.72	□□□□□ -1.65
DSF1	YEL070W	POR2	P40478	281 aa		4.72	□□□□□ -1.65
DSF1	YEL070W	HXT14	P42833	540 aa		4.72	□□□□□ -1.65
DSF1	YEL070W	AGX1	P43567	385 aa		4.72	□□□□□ -1.65
DSF1	YEL070W	YAP1802	P53309	568 aa		4.72	□□□□□ -1.65
DSF1	YEL070W	TRI1	Q05024	226 aa		4.72	□□□□□ -1.65
DSF1	YEL070W	ORM2	Q06144	216 aa		4.72	□□□□□ -1.65
DSF1	YEL070W	DCS1	Q06151	350 aa		4.72	□□□□□ -1.65
DSF1	YEL070W	NRG2	P38082	220 aa		4.72	□□□□□ -1.65
DSF1	YEL070W	AVT5	P38176	459 aa		4.72	□□□□□ -1.65
DSF1	YEL070W	MST28	P39552	234 aa		4.72	□□□□□ -1.65
DSF1	YEL070W	YJL027C	P47063	138 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
DSF1	YEL070W	MST27	P53176	234 aa		4.72	□□□□□ -1.65
DSF1	YEL070W	YMR090W	Q04304	227 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
DSF1	YEL070W	RRG8	Q06109	277 aa		4.72	□□□□□ -1.65
DSF1	YEL070W	RRT7	Q07829	113 aa		4.72	□□□□□ -1.65
DSF1	YEL070W	FCY2	P17064	533 aa		4.71	□□□□□ -1.66
DSF1	YEL070W	TIP1	P27654	210 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
DSF1	YEL070W	POP5	P28005	173 aa		4.71	□□□□□ -1.66
DSF1	YEL070W	SRL3	P36167	246 aa		4.71	□□□□□ -1.66
DSF1	YEL070W	CSH1	P38287	376 aa		4.71	□□□□□ -1.66
DSF1	YEL070W	RPL13B	P40212	199 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
DSF1	YEL070W	TDA4	P47153	279 aa		4.71	□□□□□ -1.66
DSF1	YEL070W	OCA2	P53949	197 aa		4.71	□□□□□ -1.66
DSF1	YEL070W	GPI15	P53961	229 aa		4.71	□□□□□ -1.66
DSF1	YEL070W	POS5	Q06892	414 aa		4.71	□□□□□ -1.66
DSF1	YEL070W	RPL13A	Q12690	199 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
DSF1	YEL070W	PIS1	P06197	220 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
DSF1	YEL070W	GLE2	P40066	365 aa		4.7	□□□□□ -1.66
DSF1	YEL070W	ALG13	P53178	202 aa		4.7	□□□□□ -1.66
DSF1	YEL070W	LST7	P53237	242 aa		4.7	□□□□□ -1.66
DSF1	YEL070W	PDR17	P53844	350 aa		4.7	□□□□□ -1.66
DSF1	YEL070W	AGC1	Q12482	902 aa		4.7	□□□□□ -1.66
DSF1	YEL070W	RPS25B	P0C0T4	108 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
DSF1	YEL070W	YHR213W	P0CI67	198 aa		4.69	□□□□□ -1.66
DSF1	YEL070W	FPR2	P32472	135 aa		4.69	□□□□□ -1.66
DSF1	YEL070W	SLM6	P38343	150 aa		4.69	□□□□□ -1.66
DSF1	YEL070W	RTS2	P40962	232 aa		4.69	□□□□□ -1.66
DSF1	YEL070W	POM34	Q12445	299 aa		4.69	□□□□□ -1.66
DSF1	YEL070W	RPS25A	Q3E792	108 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
DSF1	YEL070W	PPQ1	P32945	549 aa		4.68	□□□□□ -1.66
DSF1	YEL070W	SNF11	P38956	169 aa		4.68	□□□□□ -1.66
DSF1	YEL070W	YEA6	P39953	335 aa		4.68	□□□□□ -1.66
DSF1	YEL070W	CAF16	P43569	289 aa		4.68	□□□□□ -1.66
DSF1	YEL070W	YJR015W	P47090	510 aa		4.68	□□□□□ -1.66
DSF1	YEL070W	MIC26	P50087	233 aa		4.68	□□□□□ -1.66
DSF1	YEL070W	FYV6	P53913	173 aa		4.68	□□□□□ -1.66
DSF1	YEL070W	ERP1	Q05359	219 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
DSF1	YEL070W	LDS2	Q08218	356 aa		4.68	□□□□□ -1.66
DSF1	YEL070W	YLR146W-A	Q2V2P1	62 aa		4.68	□□□□□ -1.66
DSF1	YEL070W	YMR316C-A	I2HB70	103 aa		4.67	□□□□□ -1.66
DSF1	YEL070W	CDC7	P06243	507 aa		4.67	□□□□□ -1.66
DSF1	YEL070W	YCR025C	P25352	136 aa		4.67	□□□□□ -1.66
DSF1	YEL070W	SIP1	P32578	815 aa		4.67	□□□□□ -1.66
DSF1	YEL070W	RRF1	P38771	230 aa		4.67	□□□□□ -1.66
DSF1	YEL070W	PKP2	P53170	491 aa		4.67	□□□□□ -1.66
DSF1	YEL070W	YGR025W	P53216	100 aa		4.67	□□□□□ -1.66
DSF1	YEL070W	TIM44	Q01852	431 aa		4.67	□□□□□ -1.66
DSF1	YEL070W	YMR082C	Q04276	118 aa		4.67	□□□□□ -1.66
DSF1	YEL070W	RDS3	Q06835	107 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
DSF1	YEL070W	ISN1	Q99312	450 aa		4.67	□□□□□ -1.66
DSF1	YEL070W	MLF3	P32047	452 aa		4.67	□□□□□ -1.66
DSF1	YEL070W	YGR269W	P40326	108 aa		4.67	□□□□□ -1.66
DSF1	YEL070W	SDH7	Q04401	133 aa		4.67	□□□□□ -1.66
DSF1	YEL070W	YOR011W-A	Q3E807	68 aa		4.67	□□□□□ -1.66
DSF1	YEL070W	YHR213W-A	Q8TGT4	77 aa		4.67	□□□□□ -1.66
DSF1	YEL070W	ERS1	P17261	260 aa		4.66	□□□□□ -1.66
DSF1	YEL070W	PRE9	P23638	258 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
DSF1	YEL070W	IMP2	P46972	177 aa		4.66	□□□□□ -1.66
DSF1	YEL070W	LCB3	P47013	409 aa		4.66	□□□□□ -1.66
DSF1	YEL070W	HST4	P53688	370 aa		4.66	□□□□□ -1.66
DSF1	YEL070W	COX12	Q01519	83 aa		4.66	□□□□□ -1.66
DSF1	YEL070W	YDR215C	Q12240	137 aa		4.66	□□□□□ -1.66
DSF1	YEL070W	PRR2	Q12310	699 aa		4.66	□□□□□ -1.66
DSF1	YEL070W	CKS1	P20486	150 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
DSF1	YEL070W	UPS2	P35200	230 aa		4.65	□□□□□ -1.67
DSF1	YEL070W	CMC1	P36064	111 aa		4.65	□□□□□ -1.67
DSF1	YEL070W	SHB17	P36136	271 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
DSF1	YEL070W	SIT1	P39980	628 aa		4.65	□□□□□ -1.67
DSF1	YEL070W	SWM2	P40342	146 aa		4.65	□□□□□ -1.67
DSF1	YEL070W	GPI2	P46961	280 aa		4.65	□□□□□ -1.67
DSF1	YEL070W	YJR111C	P47148	283 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
DSF1	YEL070W	PNC1	P53184	216 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
DSF1	YEL070W	BOR1	P53838	576 aa		4.65	□□□□□ -1.67
DSF1	YEL070W	ODC1	Q03028	310 aa		4.65	□□□□□ -1.67
DSF1	YEL070W	ARR3	Q06598	404 aa		4.65	□□□□□ -1.67
DSF1	YEL070W	AYT1	Q12226	474 aa		4.65	□□□□□ -1.67
DSF1	YEL070W	PRM7	Q12459	698 aa		4.65	□□□□□ -1.67
DSF1	YEL070W	DFR1	P07807	211 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.64	□□□□□ -1.67	not detected

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