RNA–Protein interactions for RNA: YCL028W

RNQ1, Transcript of [PIN(+)] prion, yeastyeast

Gene RNQ1, Length 1,218 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RNQ1YCL028W YPT31P38555 223 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
RNQ1YCL028W YAP1802P53309 568 aa9.04□□□□□ -0.96
RNQ1YCL028W TMA23Q03525 211 aa9.04□□□□□ -0.96
RNQ1YCL028W YMR166CQ03829 368 aa9.04□□□□□ -0.96
RNQ1YCL028W COX19Q3E731 98 aa9.04□□□□□ -0.96
RNQ1YCL028W YER145C-AA0A023PYF4 145 aa9.03□□□□□ -0.96
RNQ1YCL028W SUA7P29055 345 aaPredicted RBP9.03□□□□□ -0.96
RNQ1YCL028W AHT1P29589 182 aa9.03□□□□□ -0.96
RNQ1YCL028W SRB6P32570 121 aa9.03□□□□□ -0.96
RNQ1YCL028W FLO5P38894 1075 aa9.03□□□□□ -0.96
RNQ1YCL028W YJL213WP40896 331 aa9.03□□□□□ -0.96
RNQ1YCL028W YJL163CP46996 555 aa9.03□□□□□ -0.96
RNQ1YCL028W YJR015WP47090 510 aa9.03□□□□□ -0.96
RNQ1YCL028W MCM22P47167 239 aa9.03□□□□□ -0.96
RNQ1YCL028W ISU1Q03020 165 aa9.03□□□□□ -0.96
RNQ1YCL028W ARR3Q06598 404 aa9.03□□□□□ -0.96
RNQ1YCL028W TOM40P23644 387 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
RNQ1YCL028W YHP1Q04116 353 aa9.02□□□□□ -0.97
RNQ1YCL028W RAD28Q12021 506 aa9.02□□□□□ -0.97
RNQ1YCL028W POM34Q12445 299 aa9.02□□□□□ -0.97
RNQ1YCL028W PAA1Q12447 191 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
RNQ1YCL028W SOD1P00445 154 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
RNQ1YCL028W RPL15AP05748 204 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
RNQ1YCL028W QCR9P22289 66 aa9.01□□□□□ -0.97
RNQ1YCL028W YER188WP40103 239 aa9.01□□□□□ -0.97
RNQ1YCL028W RPL15BP54780 204 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
RNQ1YCL028W YPL108WQ02872 168 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
RNQ1YCL028W POS5Q06892 414 aa9.01□□□□□ -0.97
RNQ1YCL028W SDO1Q07953 250 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
RNQ1YCL028W VMA9Q3E7B6 73 aa9.01□□□□□ -0.97
RNQ1YCL028W FEN2P25621 512 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
RNQ1YCL028W LDS1P31379 325 aa9□□□□□ -0.97
RNQ1YCL028W YBL059WP34224 193 aa9□□□□□ -0.97
RNQ1YCL028W SHB17P36136 271 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
RNQ1YCL028W RIB5P38145 238 aa9□□□□□ -0.97
RNQ1YCL028W QDR3P38227 689 aa9□□□□□ -0.97
RNQ1YCL028W BOR1P53838 576 aa9□□□□□ -0.97
RNQ1YCL028W YMR007WQ03675 126 aa9□□□□□ -0.97
RNQ1YCL028W CTR3Q06686 241 aa9□□□□□ -0.97
RNQ1YCL028W SRL1Q08673 210 aa9□□□□□ -0.97
RNQ1YCL028W RKI1Q12189 258 aa9□□□□□ -0.97
RNQ1YCL028W ILV5P06168 395 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
RNQ1YCL028W YBL071CP38185 102 aa8.99□□□□□ -0.97
RNQ1YCL028W SMD3P43321 101 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
RNQ1YCL028W MIC27P50945 234 aa8.99□□□□□ -0.97
RNQ1YCL028W SHH3Q04487 196 aa8.99□□□□□ -0.97
RNQ1YCL028W FPR2P32472 135 aa8.98□□□□□ -0.97
RNQ1YCL028W MRPL38P35996 138 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
RNQ1YCL028W PTC7P38797 343 aa8.98□□□□□ -0.97
RNQ1YCL028W WWM1P43582 211 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
RNQ1YCL028W GNP1P48813 663 aa8.98□□□□□ -0.97
RNQ1YCL028W RIB4P50861 169 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
RNQ1YCL028W CAF40P53829 373 aa8.98□□□□□ -0.97
RNQ1YCL028W SME1Q12330 94 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
RNQ1YCL028W TY1A-DR3Q12441 440 aa8.98□□□□□ -0.97
RNQ1YCL028W YMR316C-AI2HB70 103 aa8.97□□□□□ -0.97
RNQ1YCL028W CCW14O13547 238 aa8.97□□□□□ -0.97
RNQ1YCL028W PIS1P06197 220 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
RNQ1YCL028W RPL14AP36105 138 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
RNQ1YCL028W RPL14BP38754 138 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
RNQ1YCL028W GPP2P40106 250 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
RNQ1YCL028W AVO2Q04749 426 aa8.97□□□□□ -0.97
RNQ1YCL028W YOR097CQ12274 175 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
RNQ1YCL028W DFR1P07807 211 aaKnown RBP RIP-Chip data8.96□□□□□ -0.98not detected
RNQ1YCL028W DER1P38307 211 aa8.96□□□□□ -0.98
RNQ1YCL028W RTS2P40962 232 aa8.96□□□□□ -0.98
RNQ1YCL028W LST7P53237 242 aa8.96□□□□□ -0.98
RNQ1YCL028W YPS1P32329 569 aa8.95□□□□□ -0.98
RNQ1YCL028W YAR068WP39564 161 aa8.95□□□□□ -0.98
RNQ1YCL028W BDH1P39714 382 aa8.95□□□□□ -0.98
RNQ1YCL028W PAU4P53427 120 aa8.95□□□□□ -0.98
RNQ1YCL028W Q0142Q9ZZW4 58 aa8.95□□□□□ -0.98
RNQ1YCL028W DAL3P32459 195 aa8.94□□□□□ -0.98
RNQ1YCL028W ACP1P32463 125 aa8.94□□□□□ -0.98
RNQ1YCL028W YKL075CP36083 450 aa8.94□□□□□ -0.98
RNQ1YCL028W PRS4P38063 326 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
RNQ1YCL028W CDS1P38221 457 aa8.94□□□□□ -0.98
RNQ1YCL028W CSH1P38287 376 aa8.94□□□□□ -0.98
RNQ1YCL028W SOH1P38633 127 aa8.94□□□□□ -0.98
RNQ1YCL028W DOG2P38773 246 aa8.94□□□□□ -0.98
RNQ1YCL028W DOG1P38774 246 aa8.94□□□□□ -0.98
RNQ1YCL028W YGR018CP53211 109 aa8.94□□□□□ -0.98
RNQ1YCL028W PBP4Q07362 185 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
RNQ1YCL028W IRC23Q08416 157 aa8.94□□□□□ -0.98
RNQ1YCL028W YCR022CP25620 114 aa8.93□□□□□ -0.98
RNQ1YCL028W AVT5P38176 459 aa8.93□□□□□ -0.98
RNQ1YCL028W RRT1P38192 103 aa8.93□□□□□ -0.98
RNQ1YCL028W TAX4P47030 604 aa8.93□□□□□ -0.98
RNQ1YCL028W ATC1Q04005 294 aa8.93□□□□□ -0.98
RNQ1YCL028W RXT3Q07458 294 aa8.93□□□□□ -0.98
RNQ1YCL028W PCC1Q3E833 88 aa8.93□□□□□ -0.98
RNQ1YCL028W URA2P07259 2214 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
RNQ1YCL028W ALK2P32789 676 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
RNQ1YCL028W SAS2P40963 338 aa8.92□□□□□ -0.98
RNQ1YCL028W YOR352WQ08816 343 aa8.92□□□□□ -0.98
RNQ1YCL028W PAU1P0CE88 120 aa8.91□□□□□ -0.98
RNQ1YCL028W PAU14P0CE89 120 aa8.91□□□□□ -0.98
RNQ1YCL028W PAU6P0CE90 120 aa8.91□□□□□ -0.98
RNQ1YCL028W PAU18P0CE91 120 aa8.91□□□□□ -0.98
RNQ1YCL028W PAU8P0CE92 120 aa8.91□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 32.6 ms