RNA–Protein interactions for RNA: YBL008W-A

YBL008W-A, Transcript of Putative protein of unknown function, yeastyeast

Gene YBL008W-A, Length 240 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YBL008W-AYBL008W-A CWC23P52868 283 aaPredicted RBP0.24□□□□□ -2.37
YBL008W-AYBL008W-A YMR099CQ03161 297 aaKnown RBP0.24□□□□□ -2.37
YBL008W-AYBL008W-A YHP1Q04116 353 aa0.24□□□□□ -2.37
YBL008W-AYBL008W-A RUD3Q12234 484 aaKnown RBP0.24□□□□□ -2.37
YBL008W-AYBL008W-A SPS18P32572 300 aa0.23□□□□□ -2.37
YBL008W-AYBL008W-A NSG1P38837 291 aa0.23□□□□□ -2.37
YBL008W-AYBL008W-A NSA2P40078 261 aaKnown RBP0.23□□□□□ -2.37
YBL008W-AYBL008W-A MPM1P40364 252 aa0.23□□□□□ -2.37
YBL008W-AYBL008W-A NSE4P43124 402 aa0.23□□□□□ -2.37
YBL008W-AYBL008W-A APS3P47064 194 aa0.23□□□□□ -2.37
YBL008W-AYBL008W-A PIR1Q03178 341 aa0.23□□□□□ -2.37
YBL008W-AYBL008W-A DML1Q03652 475 aa0.23□□□□□ -2.37
YBL008W-AYBL008W-A NAT3Q06504 195 aa0.23□□□□□ -2.37
YBL008W-AYBL008W-A DAS2Q12084 232 aa0.23□□□□□ -2.37
YBL008W-AYBL008W-A PST2Q12335 198 aaKnown RBP0.23□□□□□ -2.37
YBL008W-AYBL008W-A YDL085C-AQ3E7B7 68 aaKnown RBP0.23□□□□□ -2.37
YBL008W-AYBL008W-A TAO3P40468 2376 aa0.22□□□□□ -2.37
YBL008W-AYBL008W-A CDC33P07260 213 aaKnown RBP0.22□□□□□ -2.37
YBL008W-AYBL008W-A GCY1P14065 312 aaKnown RBP RIP-Chip data0.22□□□□□ -2.37not detected
YBL008W-AYBL008W-A CCS1P40202 249 aaKnown RBP0.22□□□□□ -2.37
YBL008W-AYBL008W-A MSS2P40990 351 aa0.22□□□□□ -2.37
YBL008W-AYBL008W-A YGL235WP53071 178 aa0.22□□□□□ -2.37
YBL008W-AYBL008W-A RTC4P53850 401 aa0.22□□□□□ -2.37
YBL008W-AYBL008W-A YOR072WQ08486 104 aa0.22□□□□□ -2.37
YBL008W-AYBL008W-A YOR342CQ12182 319 aa0.22□□□□□ -2.37
YBL008W-AYBL008W-A YPR014CQ6B0W2 109 aa0.22□□□□□ -2.37
YBL008W-AYBL008W-A YML100W-AQ8TGT0 57 aa0.22□□□□□ -2.37
YBL008W-AYBL008W-A RIF1P29539 1916 aa0.22□□□□□ -2.37
YBL008W-AYBL008W-A YDR157WA0A023PZE8 133 aa0.21□□□□□ -2.38
YBL008W-AYBL008W-A MRS1P07266 363 aa0.21□□□□□ -2.38
YBL008W-AYBL008W-A CBT1P36038 271 aaPredicted RBP0.21□□□□□ -2.38
YBL008W-AYBL008W-A SHB17P36136 271 aaKnown RBP0.21□□□□□ -2.38
YBL008W-AYBL008W-A YFL019CP43576 117 aa0.21□□□□□ -2.38
YBL008W-AYBL008W-A PGA2P53903 129 aa0.21□□□□□ -2.38
YBL008W-AYBL008W-A MRPS17Q03246 237 aaPredicted RBP0.21□□□□□ -2.38
YBL008W-AYBL008W-A GPI17Q04080 534 aa0.21□□□□□ -2.38
YBL008W-AYBL008W-A YOL014WQ08110 124 aa0.21□□□□□ -2.38
YBL008W-AYBL008W-A YLR422WQ06409 1932 aa0.21□□□□□ -2.38
YBL008W-AYBL008W-A DUR1,2P32528 1835 aaKnown RBP0.2□□□□□ -2.38
YBL008W-AYBL008W-A KIN28P06242 306 aa0.2□□□□□ -2.38
YBL008W-AYBL008W-A YOL013W-AP0C272 63 aaPredicted RBP0.2□□□□□ -2.38
YBL008W-AYBL008W-A YCR001WP25347 104 aa0.2□□□□□ -2.38
YBL008W-AYBL008W-A RFA3P26755 122 aaKnown RBP0.2□□□□□ -2.38
YBL008W-AYBL008W-A HHY1P39982 102 aa0.2□□□□□ -2.38
YBL008W-AYBL008W-A MMS2P53152 137 aa0.2□□□□□ -2.38
YBL008W-AYBL008W-A YNL184CP53876 108 aa0.2□□□□□ -2.38
YBL008W-AYBL008W-A ATG41Q12048 136 aa0.2□□□□□ -2.38
YBL008W-AYBL008W-A HTB1P02293 131 aaKnown RBP0.19□□□□□ -2.38
YBL008W-AYBL008W-A HTB2P02294 131 aa0.19□□□□□ -2.38
YBL008W-AYBL008W-A RRT1P38192 103 aa0.19□□□□□ -2.38
YBL008W-AYBL008W-A MOB1P40484 314 aa0.19□□□□□ -2.38
YBL008W-AYBL008W-A PGA1P53896 198 aa0.19□□□□□ -2.38
YBL008W-AYBL008W-A YML079WQ03629 201 aa0.19□□□□□ -2.38
YBL008W-AYBL008W-A ATP20Q12233 115 aa0.19□□□□□ -2.38
YBL008W-AYBL008W-A YOR381W-AQ3E804 55 aa0.19□□□□□ -2.38
YBL008W-AYBL008W-A HSP30P25619 332 aa0.18□□□□□ -2.38
YBL008W-AYBL008W-A RFC2P40348 353 aa0.18□□□□□ -2.38
YBL008W-AYBL008W-A CIN5P40917 295 aa0.18□□□□□ -2.38
YBL008W-AYBL008W-A FMP32P43557 207 aa0.18□□□□□ -2.38
YBL008W-AYBL008W-A GPI14P47088 403 aaKnown RBP0.18□□□□□ -2.38
YBL008W-AYBL008W-A PAC10P48363 199 aa0.18□□□□□ -2.38
YBL008W-AYBL008W-A NQM1P53228 333 aaPredicted RBP0.18□□□□□ -2.38
YBL008W-AYBL008W-A BLM10P43583 2143 aa0.17□□□□□ -2.38
YBL008W-AYBL008W-A RPL43AP0CX25 92 aaKnown RBP0.17□□□□□ -2.38
YBL008W-AYBL008W-A RPL43BP0CX26 92 aa0.17□□□□□ -2.38
YBL008W-AYBL008W-A GLC8P41818 229 aa0.17□□□□□ -2.38
YBL008W-AYBL008W-A VPS28Q02767 242 aa0.17□□□□□ -2.38
YBL008W-AYBL008W-A YPR127WQ06494 345 aa0.17□□□□□ -2.38
YBL008W-AYBL008W-A VAM10Q08474 114 aa0.17□□□□□ -2.38
YBL008W-AYBL008W-A FCY1Q12178 158 aa0.17□□□□□ -2.38
YBL008W-AYBL008W-A MPD1Q12404 318 aaKnown RBP0.17□□□□□ -2.38
YBL008W-AYBL008W-A IGO2Q9P305 131 aa0.17□□□□□ -2.38
YBL008W-AYBL008W-A CDC39P25655 2108 aaKnown RBP0.16□□□□□ -2.38
YBL008W-AYBL008W-A HAP2P06774 265 aa0.16□□□□□ -2.38
YBL008W-AYBL008W-A RPS25BP0C0T4 108 aaKnown RBP0.16□□□□□ -2.38
YBL008W-AYBL008W-A RPS22AP0C0W1 130 aaKnown RBP0.16□□□□□ -2.38
YBL008W-AYBL008W-A SEC14P24280 304 aaKnown RBP0.16□□□□□ -2.38
YBL008W-AYBL008W-A ADE1P27616 306 aa0.16□□□□□ -2.38
YBL008W-AYBL008W-A NUF2P33895 451 aa0.16□□□□□ -2.38
YBL008W-AYBL008W-A CLG1P35190 452 aa0.16□□□□□ -2.38
YBL008W-AYBL008W-A YMR141CP40211 102 aa0.16□□□□□ -2.38
YBL008W-AYBL008W-A YGR269WP40326 108 aa0.16□□□□□ -2.38
YBL008W-AYBL008W-A POG1P40473 351 aa0.16□□□□□ -2.38
YBL008W-AYBL008W-A XPT1P47165 209 aa0.16□□□□□ -2.38
YBL008W-AYBL008W-A YKR005CQ02203 525 aa0.16□□□□□ -2.38
YBL008W-AYBL008W-A SEN15Q04675 128 aa0.16□□□□□ -2.38
YBL008W-AYBL008W-A YOL024WQ08172 172 aa0.16□□□□□ -2.38
YBL008W-AYBL008W-A YDL157CQ12082 118 aa0.16□□□□□ -2.38
YBL008W-AYBL008W-A RPS25AQ3E792 108 aaPredicted RBP0.16□□□□□ -2.38
YBL008W-AYBL008W-A RPS22BQ3E7Y3 130 aaKnown RBP0.16□□□□□ -2.38
YBL008W-AYBL008W-A RPB4P20433 221 aaPredicted RBP0.15□□□□□ -2.39
YBL008W-AYBL008W-A CAF4P36130 643 aa0.15□□□□□ -2.39
YBL008W-AYBL008W-A GLR1P41921 483 aaKnown RBP0.15□□□□□ -2.39
YBL008W-AYBL008W-A CCC1P47818 322 aa0.15□□□□□ -2.39
YBL008W-AYBL008W-A TIM13P53299 105 aa0.15□□□□□ -2.39
YBL008W-AYBL008W-A ARO80Q04052 950 aa0.15□□□□□ -2.39
YBL008W-AYBL008W-A HPT1Q04178 221 aaKnown RBP0.15□□□□□ -2.39
YBL008W-AYBL008W-A YOR214CQ12282 236 aa0.15□□□□□ -2.39
YBL008W-AYBL008W-A RAD9P14737 1309 aa0.14□□□□□ -2.39
YBL008W-AYBL008W-A SPS2P08459 502 aa0.14□□□□□ -2.39
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 29.5 ms