RNA–Protein interactions for RNA: YOR054C

VHS3, Transcript of Negative regulatory subunit of protein phosphatase 1 Ppz1p, yeast

Gene VHS3, Length 2,025 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VHS3	YOR054C	YGL230C	P53074	147 aa		3.59	□□□□□ -1.83
VHS3	YOR054C	YPL162C	Q12042	273 aa		3.59	□□□□□ -1.83
VHS3	YOR054C	YIR021W-A	Q3E739	70 aa		3.59	□□□□□ -1.83
VHS3	YOR054C	YAR066W	P0CX18	203 aa		3.58	□□□□□ -1.84
VHS3	YOR054C	YHR214W	P0CX19	203 aa		3.58	□□□□□ -1.84
VHS3	YOR054C	INO4	P13902	151 aa		3.58	□□□□□ -1.84
VHS3	YOR054C	MDH3	P32419	343 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.58	□□□□□ -1.84	not detected
VHS3	YOR054C	HOG1	P32485	435 aa		3.58	□□□□□ -1.84
VHS3	YOR054C	YHR130C	P38834	111 aa		3.58	□□□□□ -1.84
VHS3	YOR054C	TEM1	P38987	245 aa		3.58	□□□□□ -1.84
VHS3	YOR054C	COX15	P40086	486 aa		3.58	□□□□□ -1.84
VHS3	YOR054C	BTT1	P40314	149 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
VHS3	YOR054C	SEC24	P40482	926 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
VHS3	YOR054C	SNO3	P43544	222 aa		3.58	□□□□□ -1.84
VHS3	YOR054C	XPT1	P47165	209 aa		3.58	□□□□□ -1.84
VHS3	YOR054C	BXI1	P48558	297 aa		3.58	□□□□□ -1.84
VHS3	YOR054C	SNO2	P53823	222 aa		3.58	□□□□□ -1.84
VHS3	YOR054C	ALG9	P53868	555 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
VHS3	YOR054C	YNL143C	P53908	130 aa		3.58	□□□□□ -1.84
VHS3	YOR054C	DAD3	P69850	94 aa		3.58	□□□□□ -1.84
VHS3	YOR054C	RPL21A	Q02753	160 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
VHS3	YOR054C	COQ11	Q05892	277 aa		3.58	□□□□□ -1.84
VHS3	YOR054C	YDL242W	Q07746	117 aa		3.58	□□□□□ -1.84
VHS3	YOR054C	FCY22	Q12119	530 aa		3.58	□□□□□ -1.84
VHS3	YOR054C	YDL177C	Q12257	170 aa		3.58	□□□□□ -1.84
VHS3	YOR054C	ORT1	Q12375	292 aa		3.58	□□□□□ -1.84
VHS3	YOR054C	GEP5	Q12393	293 aa		3.58	□□□□□ -1.84
VHS3	YOR054C	RPL21B	Q12672	160 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
VHS3	YOR054C	YLR363W-A	Q3E747	85 aa		3.58	□□□□□ -1.84
VHS3	YOR054C	DET1	Q99288	334 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
VHS3	YOR054C	SAC7	P17121	654 aa		3.58	□□□□□ -1.84
VHS3	YOR054C	GLN3	P18494	730 aa		3.58	□□□□□ -1.84
VHS3	YOR054C	ATP10	P18496	279 aa		3.58	□□□□□ -1.84
VHS3	YOR054C	SAG1	P20840	650 aa		3.58	□□□□□ -1.84
VHS3	YOR054C	RNQ1	P25367	405 aa		3.58	□□□□□ -1.84
VHS3	YOR054C	HXT4	P32467	576 aa		3.58	□□□□□ -1.84
VHS3	YOR054C	SPC29	P33419	253 aa		3.58	□□□□□ -1.84
VHS3	YOR054C	BAT1	P38891	393 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
VHS3	YOR054C	YEL068C	P39977	110 aa		3.58	□□□□□ -1.84
VHS3	YOR054C	GPP2	P40106	250 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
VHS3	YOR054C	MSL1	P40567	111 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
VHS3	YOR054C	HAC1	P41546	238 aa		3.58	□□□□□ -1.84
VHS3	YOR054C	SFH5	P47008	294 aa		3.58	□□□□□ -1.84
VHS3	YOR054C	DUO1	P53168	247 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
VHS3	YOR054C	ERG26	P53199	349 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
VHS3	YOR054C	YMR082C	Q04276	118 aa		3.58	□□□□□ -1.84
VHS3	YOR054C	SCS22	Q6Q595	175 aa		3.58	□□□□□ -1.84
VHS3	YOR054C	YPT1	P01123	206 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
VHS3	YOR054C	SEC11	P15367	167 aa		3.57	□□□□□ -1.84
VHS3	YOR054C	YCR023C	P25351	611 aa		3.57	□□□□□ -1.84
VHS3	YOR054C	NTC20	P38302	140 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
VHS3	YOR054C	VBA2	P38358	474 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
VHS3	YOR054C	YHR097C	P38809	366 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
VHS3	YOR054C	UME6	P39001	836 aa		3.57	□□□□□ -1.84
VHS3	YOR054C	YJL068C	P40363	299 aa		3.57	□□□□□ -1.84
VHS3	YOR054C	BNA1	P47096	177 aa		3.57	□□□□□ -1.84
VHS3	YOR054C	STP3	Q05937	343 aa		3.57	□□□□□ -1.84
VHS3	YOR054C	LDS2	Q08218	356 aa		3.57	□□□□□ -1.84
VHS3	YOR054C	PRM3	Q08931	133 aa		3.57	□□□□□ -1.84
VHS3	YOR054C	ISD11	Q6Q560	94 aa		3.57	□□□□□ -1.84
VHS3	YOR054C	FMP49	A0A023PZB3	126 aa		3.56	□□□□□ -1.84
VHS3	YOR054C	YER190C-B	P0CX94	160 aa		3.56	□□□□□ -1.84
VHS3	YOR054C	YEL077W-A	P0CX95	160 aa		3.56	□□□□□ -1.84
VHS3	YOR054C	YGR296C-B	P0CX96	160 aa		3.56	□□□□□ -1.84
VHS3	YOR054C	YPL283W-B	P0CX97	160 aa		3.56	□□□□□ -1.84
VHS3	YOR054C	YPR204C-A	P0CX98	160 aa		3.56	□□□□□ -1.84
VHS3	YOR054C	CDC43	P18898	376 aa		3.56	□□□□□ -1.84
VHS3	YOR054C	HYP2	P23301	157 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
VHS3	YOR054C	GEX1	P25596	615 aa		3.56	□□□□□ -1.84
VHS3	YOR054C	RAD23	P32628	398 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
VHS3	YOR054C	AGA2	P32781	87 aa		3.56	□□□□□ -1.84
VHS3	YOR054C	MCH2	P36032	473 aa		3.56	□□□□□ -1.84
VHS3	YOR054C	TAE1	P38340	232 aa		3.56	□□□□□ -1.84
VHS3	YOR054C	DOG2	P38773	246 aa		3.56	□□□□□ -1.84
VHS3	YOR054C	YAL037W	P39728	267 aa		3.56	□□□□□ -1.84
VHS3	YOR054C	TOS2	P50078	622 aa		3.56	□□□□□ -1.84
VHS3	YOR054C	CAB4	P53332	305 aa		3.56	□□□□□ -1.84
VHS3	YOR054C	ATG4	P53867	494 aa		3.56	□□□□□ -1.84
VHS3	YOR054C	GIS1	Q03833	894 aa		3.56	□□□□□ -1.84
VHS3	YOR054C	GTO3	Q04806	366 aa		3.56	□□□□□ -1.84
VHS3	YOR054C	RSF1	Q05043	376 aa		3.56	□□□□□ -1.84
VHS3	YOR054C	PFA4	Q12006	378 aa		3.56	□□□□□ -1.84
VHS3	YOR054C	ATO3	Q12359	275 aa		3.56	□□□□□ -1.84
VHS3	YOR054C	NUM1	Q00402	2748 aa		3.56	□□□□□ -1.84
VHS3	YOR054C	GAS1	P22146	559 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
VHS3	YOR054C	SPO13	P23624	291 aa		3.56	□□□□□ -1.84
VHS3	YOR054C	SPS18	P32572	300 aa		3.56	□□□□□ -1.84
VHS3	YOR054C	TOA2	P32774	122 aa		3.56	□□□□□ -1.84
VHS3	YOR054C	AUR1	P36107	401 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
VHS3	YOR054C	YER121W	P40076	114 aa		3.56	□□□□□ -1.84
VHS3	YOR054C	YCH1	P42937	148 aa		3.56	□□□□□ -1.84
VHS3	YOR054C	ERJ5	P43613	295 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
VHS3	YOR054C	TRM112	P53738	135 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
VHS3	YOR054C	SNP1	Q00916	300 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
VHS3	YOR054C	MCP1	Q12106	302 aa		3.56	□□□□□ -1.84
VHS3	YOR054C	UTP23	Q12339	254 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
VHS3	YOR054C	PEX11	Q12462	236 aa		3.56	□□□□□ -1.84
VHS3	YOR054C	COA2	Q3E823	68 aa		3.56	□□□□□ -1.84
VHS3	YOR054C	BEM2	P39960	2167 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
VHS3	YOR054C	STE7	P06784	515 aa		3.55	□□□□□ -1.84

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