RNA–Protein interactions for RNA: YML061C

PIF1, Transcript of DNA helicase, potent G-quadruplex DNA binder/unwinder, yeast

Gene PIF1, Length 2,580 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PIF1	YML061C	SDC1	Q03323	175 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PIF1	YML061C	ASM4	Q05166	528 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PIF1	YML061C	YOL118C	Q08259	102 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PIF1	YML061C	YOR192C-C	Q3E736	78 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PIF1	YML061C	VMA9	Q3E7B6	73 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PIF1	YML061C	YHR213W-A	Q8TGT4	77 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PIF1	YML061C	REC114	P32841	428 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PIF1	YML061C	PGD1	P40356	397 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PIF1	YML061C	EMC5	P40540	141 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PIF1	YML061C	HNT2	P49775	206 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PIF1	YML061C	AVT4	P50944	713 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PIF1	YML061C	POM33	Q12164	279 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PIF1	YML061C	YOR015W	Q12169	119 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PIF1	YML061C	RPL25	P04456	142 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
PIF1	YML061C	YML003W	P0CF16	290 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PIF1	YML061C	UBI4	P0CG63	381 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
PIF1	YML061C	RPL40A	P0CH08	128 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
PIF1	YML061C	RPL40B	P0CH09	128 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
PIF1	YML061C	TRR1	P29509	319 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
PIF1	YML061C	SLM6	P38343	150 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PIF1	YML061C	CGI121	Q03705	181 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
PIF1	YML061C	YMR320W	Q04897	101 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PIF1	YML061C	YLR179C	Q06252	201 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
PIF1	YML061C	THI72	Q08579	599 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PIF1	YML061C	HNT3	Q08702	217 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PIF1	YML061C	MRP2	P10663	115 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PIF1	YML061C	DAL82	P21705	255 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PIF1	YML061C	COX15	P40086	486 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PIF1	YML061C	MID1	P41821	548 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PIF1	YML061C	MSY1	P48527	492 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PIF1	YML061C	HCH1	P53834	153 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PIF1	YML061C	GMC1	Q04399	608 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PIF1	YML061C	POS5	Q06892	414 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PIF1	YML061C	SHG1	P38337	142 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PIF1	YML061C	IMD2	P38697	523 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PIF1	YML061C	FLO5	P38894	1075 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PIF1	YML061C	SWM2	P40342	146 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PIF1	YML061C	FMP41	P53889	259 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PIF1	YML061C	YMR279C	Q03263	540 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PIF1	YML061C	TDA6	Q06466	467 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PIF1	YML061C	YHR214C-D	P0CX93	97 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PIF1	YML061C	MSI1	P13712	422 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PIF1	YML061C	TIR2	P33890	251 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PIF1	YML061C	PRY1	P47032	299 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PIF1	YML061C	CRZ1	P53968	678 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PIF1	YML061C	THI74	Q04083	370 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PIF1	YML061C	YDR114C	Q04597	100 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PIF1	YML061C	COQ11	Q05892	277 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PIF1	YML061C	ZEO1	Q08245	113 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PIF1	YML061C	YPR145C-A	Q2V2P0	78 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PIF1	YML061C	RPL30	P14120	105 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PIF1	YML061C	SWD2	P36104	329 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PIF1	YML061C	RPL14A	P36105	138 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PIF1	YML061C	RPL14B	P38754	138 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PIF1	YML061C	SOK2	P53438	785 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PIF1	YML061C	YPL039W	Q03080	316 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PIF1	YML061C	ERP1	Q05359	219 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PIF1	YML061C	GLC7	P32598	312 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
PIF1	YML061C	NTF2	P33331	125 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
PIF1	YML061C	YER079W	P40052	210 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
PIF1	YML061C	SMX3	P54999	86 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
PIF1	YML061C	DAD3	P69850	94 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PIF1	YML061C	CAC2	Q04199	468 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PIF1	YML061C	RKI1	Q12189	258 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PIF1	YML061C	RNH203	Q12338	110 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PIF1	YML061C	DCN1	Q12395	269 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PIF1	YML061C	COX1	P00401	534 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PIF1	YML061C	MSK1	P32048	576 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PIF1	YML061C	SPS18	P32572	300 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PIF1	YML061C	MTC6	P38849	526 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PIF1	YML061C	YEA6	P39953	335 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PIF1	YML061C	YER076C	P40049	302 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PIF1	YML061C	FLX1	P40464	311 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PIF1	YML061C	IKS1	P47042	667 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PIF1	YML061C	LSM8	P47093	109 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
PIF1	YML061C	ALG13	P53178	202 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PIF1	YML061C	YNR040W	P53736	256 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PIF1	YML061C	YMR166C	Q03829	368 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PIF1	YML061C	POM34	Q12445	299 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PIF1	YML061C	CDC28	P00546	298 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
PIF1	YML061C	YFR010W-A	P0C5N0	62 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PIF1	YML061C	MOB2	P43563	287 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PIF1	YML061C	YDR415C	Q04033	374 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
PIF1	YML061C	ADH6	Q04894	360 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
PIF1	YML061C	HRI1	Q05905	244 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
PIF1	YML061C	UTP23	Q12339	254 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
PIF1	YML061C	FOL3	Q12676	427 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
PIF1	YML061C	COA2	Q3E823	68 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PIF1	YML061C	HUG1	Q6Q5K6	68 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PIF1	YML061C	FLO9	P39712	1322 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PIF1	YML061C	RPB3	P16370	318 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
PIF1	YML061C	ERG2	P32352	222 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PIF1	YML061C	IES6	P32617	166 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PIF1	YML061C	ECO1	P43605	281 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PIF1	YML061C	HSK3	P69852	69 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PIF1	YML061C	SAE3	P89114	91 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PIF1	YML061C	YOR186W	Q08560	144 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PIF1	YML061C	ATG5	Q12380	294 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PIF1	YML061C	RAX2	Q12465	1220 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PIF1	YML061C	OCH1	P31755	480 aa		4.71	□□□□□ -1.65

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