RNA–Protein interactions for RNA: YLR165C

PUS5, Transcript of Pseudouridine synthase, yeast

Gene PUS5, Length 765 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PUS5	YLR165C	BOL2	P53082	120 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PUS5	YLR165C	PRM8	P53174	237 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PUS5	YLR165C	NHP10	Q03435	203 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PUS5	YLR165C	FEX1	Q08913	375 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PUS5	YLR165C	FEX2	Q08991	375 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PUS5	YLR165C	RIF1	P29539	1916 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PUS5	YLR165C	YCR099C	P25657	155 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PUS5	YLR165C	YBR063C	P38083	404 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PUS5	YLR165C	MAK5	P38112	773 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PUS5	YLR165C	YAR068W	P39564	161 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PUS5	YLR165C	YER084W	P40057	128 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PUS5	YLR165C	ARC15	P40518	154 aa	RIP-Chip data	4.61	□□□□□ -1.67	not detected
PUS5	YLR165C	RPA43	P46669	326 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PUS5	YLR165C	DID2	P69771	204 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PUS5	YLR165C	SAS5	Q99314	248 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PUS5	YLR165C	NOP1	P15646	327 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PUS5	YLR165C	CCA1	P21269	546 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PUS5	YLR165C	ATP7	P30902	174 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PUS5	YLR165C	YHR125W	P38831	101 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PUS5	YLR165C	CYC2	P38909	366 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PUS5	YLR165C	FMP32	P43557	207 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PUS5	YLR165C	MMS2	P53152	137 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PUS5	YLR165C	EFM5	P53200	248 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PUS5	YLR165C	YMR279C	Q03263	540 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PUS5	YLR165C	GAS3	Q03655	524 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PUS5	YLR165C	ATG39	Q06159	398 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PUS5	YLR165C	PRM7	Q12459	698 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PUS5	YLR165C	KRE1	P17260	313 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PUS5	YLR165C	BUB2	P26448	306 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PUS5	YLR165C	MRPL28	P36527	147 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PUS5	YLR165C	YJL016W	P47072	561 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PUS5	YLR165C	YJR056C	P47115	236 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PUS5	YLR165C	YGL088W	P53151	121 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PUS5	YLR165C	NSL1	Q12143	216 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PUS5	YLR165C	SNF4	P12904	322 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PUS5	YLR165C	YKR032W	P36127	104 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PUS5	YLR165C	YER034W	P40022	185 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PUS5	YLR165C	YNL033W	P53964	284 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PUS5	YLR165C	YNL019C	P53975	284 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PUS5	YLR165C	PEX12	Q04370	399 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PUS5	YLR165C	MDM32	Q12171	622 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PUS5	YLR165C	YOR342C	Q12182	319 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PUS5	YLR165C	Q0255	P03881	472 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUS5	YLR165C	YPR170W-B	P0C5R9	85 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUS5	YLR165C	YER188W	P40103	239 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUS5	YLR165C	GGA1	Q06336	557 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUS5	YLR165C	PEX11	Q12462	236 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUS5	YLR165C	UBR2	Q07963	1872 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PUS5	YLR165C	RPS1A	P33442	255 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PUS5	YLR165C	SKG1	P36169	355 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PUS5	YLR165C	MRPL17	P36528	281 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PUS5	YLR165C	ECM33	P38248	429 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PUS5	YLR165C	IRC22	P40006	225 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PUS5	YLR165C	TIF34	P40217	347 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PUS5	YLR165C	LPP1	Q04396	274 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PUS5	YLR165C	DPM1	P14020	267 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PUS5	YLR165C	MIG1	P27705	504 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PUS5	YLR165C	CAF4	P36130	643 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PUS5	YLR165C	ECM4	P36156	370 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PUS5	YLR165C	SEC72	P39742	193 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PUS5	YLR165C	RMD6	P39975	231 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PUS5	YLR165C	DIA1	P54005	336 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PUS5	YLR165C	TMA20	P89886	181 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PUS5	YLR165C	PET191	Q02772	108 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PUS5	YLR165C	TRM12	Q04235	462 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PUS5	YLR165C	CLP1	Q08685	445 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PUS5	YLR165C	YLR046C	Q12253	270 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PUS5	YLR165C	TDA8	Q6B2U8	126 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PUS5	YLR165C	SEC4	P07560	215 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PUS5	YLR165C	YHR032W-A	P0C5N6	59 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PUS5	YLR165C	YGR026W	P53217	278 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PUS5	YLR165C	SSU72	P53538	206 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PUS5	YLR165C	YPR114W	Q06107	315 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PUS5	YLR165C	YKL018C-A	Q3E7A7	99 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PUS5	YLR165C	FBA1	P14540	359 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PUS5	YLR165C	ATG22	P25568	528 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PUS5	YLR165C	TCA17	P32613	152 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PUS5	YLR165C	VMA11	P32842	164 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PUS5	YLR165C	YBR285W	P38354	144 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PUS5	YLR165C	RGI1	P40043	161 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PUS5	YLR165C	COG3	P40094	801 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PUS5	YLR165C	AYR1	P40471	297 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PUS5	YLR165C	LSM7	P53905	115 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PUS5	YLR165C	PIR1	Q03178	341 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PUS5	YLR165C	YHR214C-E	Q8TGK0	99 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PUS5	YLR165C	RPL25	P04456	142 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
PUS5	YLR165C	UBC8	P28263	218 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PUS5	YLR165C	EGD2	P38879	174 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
PUS5	YLR165C	MTW1	P39731	289 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PUS5	YLR165C	GPI11	Q06636	219 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PUS5	YLR165C	YNG1	Q08465	219 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PUS5	YLR165C	MHT1	Q12525	324 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PUS5	YLR165C	FAB1	P34756	2278 aa		4.51	□□□□□ -1.69
PUS5	YLR165C	YPR096C	O13587	100 aa		4.51	□□□□□ -1.69
PUS5	YLR165C	RAS2	P01120	322 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
PUS5	YLR165C	KSS1	P14681	368 aa		4.51	□□□□□ -1.69
PUS5	YLR165C	AIM25	P47140	327 aa		4.51	□□□□□ -1.69
PUS5	YLR165C	EMC4	P53073	190 aa		4.51	□□□□□ -1.69
PUS5	YLR165C	MET31	Q03081	177 aa		4.51	□□□□□ -1.69
PUS5	YLR165C	YMR099C	Q03161	297 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69

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