RNA–Protein interactions for RNA: YHR139C

SPS100, Transcript of Protein required for spore wall maturation, yeast

Gene SPS100, Length 981 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SPS100	YHR139C	YGL117W	P53133	265 aa		7.05	□□□□□ -1.28
SPS100	YHR139C	TIM44	Q01852	431 aa		7.05	□□□□□ -1.28
SPS100	YHR139C	YPL264C	Q08980	353 aa		7.05	□□□□□ -1.28
SPS100	YHR139C	FCF2	Q12035	217 aa	Predicted RBP	7.05	□□□□□ -1.28
SPS100	YHR139C	TOM40	P23644	387 aa	Known RBP	7.04	□□□□□ -1.28
SPS100	YHR139C	YBR184W	P38299	523 aa		7.04	□□□□□ -1.28
SPS100	YHR139C	EST3	Q03096	181 aa		7.04	□□□□□ -1.28
SPS100	YHR139C	COA4	Q05809	96 aa		7.04	□□□□□ -1.28
SPS100	YHR139C	BER1	Q06688	274 aa	Known RBP	7.04	□□□□□ -1.28
SPS100	YHR139C	MCH1	Q07376	486 aa		7.04	□□□□□ -1.28
SPS100	YHR139C	YBR298C-A	Q8TGK4	73 aa		7.04	□□□□□ -1.28
SPS100	YHR139C	YKR045C	P36138	183 aa		7.03	□□□□□ -1.28
SPS100	YHR139C	RTC3	P38804	111 aa	Predicted RBP	7.03	□□□□□ -1.28
SPS100	YHR139C	ASP1	P38986	381 aa	Predicted RBP	7.03	□□□□□ -1.28
SPS100	YHR139C	COX15	P40086	486 aa		7.03	□□□□□ -1.28
SPS100	YHR139C	SSU72	P53538	206 aa	Predicted RBP	7.03	□□□□□ -1.28
SPS100	YHR139C	PDR17	P53844	350 aa		7.03	□□□□□ -1.28
SPS100	YHR139C	DYN2	Q02647	92 aa		7.03	□□□□□ -1.28
SPS100	YHR139C	YMR082C	Q04276	118 aa		7.03	□□□□□ -1.28
SPS100	YHR139C	NDE2	Q07500	545 aa		7.03	□□□□□ -1.28
SPS100	YHR139C	YHR213W-A	Q8TGT4	77 aa		7.03	□□□□□ -1.28
SPS100	YHR139C	TRP4	P07285	380 aa	Predicted RBP	7.02	□□□□□ -1.29
SPS100	YHR139C	GCV3	P39726	170 aa	Predicted RBP	7.02	□□□□□ -1.29
SPS100	YHR139C	DCS1	Q06151	350 aa		7.02	□□□□□ -1.29
SPS100	YHR139C	AGC1	Q12482	902 aa		7.02	□□□□□ -1.29
SPS100	YHR139C	FEN2	P25621	512 aa	Known RBP	7.01	□□□□□ -1.29
SPS100	YHR139C	RPD3	P32561	433 aa		7.01	□□□□□ -1.29
SPS100	YHR139C	YEA4	P40004	342 aa		7.01	□□□□□ -1.29
SPS100	YHR139C	NSA2	P40078	261 aa	Known RBP	7.01	□□□□□ -1.29
SPS100	YHR139C	YJL213W	P40896	331 aa		7.01	□□□□□ -1.29
SPS100	YHR139C	LST8	P41318	303 aa		7.01	□□□□□ -1.29
SPS100	YHR139C	SRB7	P47822	140 aa		7.01	□□□□□ -1.29
SPS100	YHR139C	HCH1	P53834	153 aa		7.01	□□□□□ -1.29
SPS100	YHR139C	DUG3	P53871	357 aa		7.01	□□□□□ -1.29
SPS100	YHR139C	MOT3	P54785	490 aa	Known RBP	7.01	□□□□□ -1.29
SPS100	YHR139C	YPS3	Q12303	508 aa		7.01	□□□□□ -1.29
SPS100	YHR139C	FCY2	P17064	533 aa		7	□□□□□ -1.29
SPS100	YHR139C	YCR025C	P25352	136 aa		7	□□□□□ -1.29
SPS100	YHR139C	EMP24	P32803	203 aa	Known RBP	7	□□□□□ -1.29
SPS100	YHR139C	PSD1	P39006	500 aa		7	□□□□□ -1.29
SPS100	YHR139C	YJL163C	P46996	555 aa		7	□□□□□ -1.29
SPS100	YHR139C	BUL1	P48524	976 aa		7	□□□□□ -1.29
SPS100	YHR139C	UBI4	P0CG63	381 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
SPS100	YHR139C	UPS2	P35200	230 aa		6.99	□□□□□ -1.29
SPS100	YHR139C	YPT31	P38555	223 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
SPS100	YHR139C	WSS1	P38838	269 aa		6.99	□□□□□ -1.29
SPS100	YHR139C	WWM1	P43582	211 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
SPS100	YHR139C	ERG25	P53045	309 aa		6.99	□□□□□ -1.29
SPS100	YHR139C	FRQ1	Q06389	190 aa		6.99	□□□□□ -1.29
SPS100	YHR139C	PRR2	Q12310	699 aa		6.99	□□□□□ -1.29
SPS100	YHR139C	RPS25B	P0C0T4	108 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
SPS100	YHR139C	MRS3	P10566	314 aa		6.98	□□□□□ -1.29
SPS100	YHR139C	DAL3	P32459	195 aa		6.98	□□□□□ -1.29
SPS100	YHR139C	TIF11	P38912	153 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
SPS100	YHR139C	GPP2	P40106	250 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
SPS100	YHR139C	HXT14	P42833	540 aa		6.98	□□□□□ -1.29
SPS100	YHR139C	SNX4	P47057	423 aa		6.98	□□□□□ -1.29
SPS100	YHR139C	RAD28	Q12021	506 aa		6.98	□□□□□ -1.29
SPS100	YHR139C	USV1	Q12132	391 aa		6.98	□□□□□ -1.29
SPS100	YHR139C	RKI1	Q12189	258 aa		6.98	□□□□□ -1.29
SPS100	YHR139C	POC4	Q12245	148 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
SPS100	YHR139C	FMP16	Q12497	93 aa		6.98	□□□□□ -1.29
SPS100	YHR139C	RPS25A	Q3E792	108 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
SPS100	YHR139C	SOD1	P00445	154 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
SPS100	YHR139C	MSA1	Q08471	629 aa		6.97	□□□□□ -1.29
SPS100	YHR139C	YDR157W	A0A023PZE8	133 aa		6.96	□□□□□ -1.3
SPS100	YHR139C	ILV5	P06168	395 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.3
SPS100	YHR139C	YCR041W	P37265	110 aa		6.96	□□□□□ -1.3
SPS100	YHR139C	PRS4	P38063	326 aa	Predicted RBP	6.96	□□□□□ -1.3
SPS100	YHR139C	PEX7	P39108	375 aa		6.96	□□□□□ -1.3
SPS100	YHR139C	VMA7	P39111	118 aa		6.96	□□□□□ -1.3
SPS100	YHR139C	YNR066C	P53752	436 aa		6.96	□□□□□ -1.3
SPS100	YHR139C	MRPS17	Q03246	237 aa	Predicted RBP	6.96	□□□□□ -1.3
SPS100	YHR139C	SPG4	Q04438	115 aa		6.96	□□□□□ -1.3
SPS100	YHR139C	YLR179C	Q06252	201 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.3
SPS100	YHR139C	TDA6	Q06466	467 aa		6.96	□□□□□ -1.3
SPS100	YHR139C	YDL242W	Q07746	117 aa		6.96	□□□□□ -1.3
SPS100	YHR139C	YBR085C-A	O43137	85 aa		6.95	□□□□□ -1.3
SPS100	YHR139C	RPP1A	P05318	106 aa	Predicted RBP	6.95	□□□□□ -1.3
SPS100	YHR139C	INO2	P26798	304 aa		6.95	□□□□□ -1.3
SPS100	YHR139C	MRPL38	P35996	138 aa	Predicted RBP	6.95	□□□□□ -1.3
SPS100	YHR139C	YGR269W	P40326	108 aa		6.95	□□□□□ -1.3
SPS100	YHR139C	EMC5	P40540	141 aa		6.95	□□□□□ -1.3
SPS100	YHR139C	PHO23	P50947	330 aa		6.95	□□□□□ -1.3
SPS100	YHR139C	SIP1	P32578	815 aa		6.94	□□□□□ -1.3
SPS100	YHR139C	YKL075C	P36083	450 aa		6.94	□□□□□ -1.3
SPS100	YHR139C	YBL071C	P38185	102 aa		6.94	□□□□□ -1.3
SPS100	YHR139C	YJR015W	P47090	510 aa		6.94	□□□□□ -1.3
SPS100	YHR139C	ORM1	P53224	222 aa		6.94	□□□□□ -1.3
SPS100	YHR139C	YAP1802	P53309	568 aa		6.94	□□□□□ -1.3
SPS100	YHR139C	PBP4	Q07362	185 aa	Known RBP	6.94	□□□□□ -1.3
SPS100	YHR139C	PAA1	Q12447	191 aa	Known RBP	6.94	□□□□□ -1.3
SPS100	YHR139C	YPS1	P32329	569 aa		6.93	□□□□□ -1.3
SPS100	YHR139C	FPR2	P32472	135 aa		6.93	□□□□□ -1.3
SPS100	YHR139C	QDR3	P38227	689 aa		6.93	□□□□□ -1.3
SPS100	YHR139C	SYG1	P40528	902 aa		6.93	□□□□□ -1.3
SPS100	YHR139C	YHP1	Q04116	353 aa		6.93	□□□□□ -1.3
SPS100	YHR139C	ARR3	Q06598	404 aa		6.93	□□□□□ -1.3
SPS100	YHR139C	POS5	Q06892	414 aa		6.93	□□□□□ -1.3
SPS100	YHR139C	IRC23	Q08416	157 aa		6.93	□□□□□ -1.3

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 25.6 ms