RNA–Protein interactions for RNA: YHR116W

COX23, Transcript of Protein that functions in mitochondrial copper homeostasis, yeast

Gene COX23, Length 456 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
COX23	YHR116W	MIX17	Q03667	156 aa		2.6	□□□□□ -1.99
COX23	YHR116W	YMR166C	Q03829	368 aa		2.6	□□□□□ -1.99
COX23	YHR116W	RRG8	Q06109	277 aa		2.6	□□□□□ -1.99
COX23	YHR116W	NOC4	Q06512	552 aa	Predicted RBP	2.6	□□□□□ -1.99
COX23	YHR116W	MRPL35	Q06678	367 aa		2.6	□□□□□ -1.99
COX23	YHR116W	LDS2	Q08218	356 aa		2.6	□□□□□ -1.99
COX23	YHR116W	TIR4	Q12218	487 aa	Predicted RBP	2.6	□□□□□ -1.99
COX23	YHR116W	DGK1	Q12382	290 aa		2.6	□□□□□ -1.99
COX23	YHR116W	TDH1	P00360	332 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
COX23	YHR116W	RPS18A	P0CX55	146 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
COX23	YHR116W	RPS18B	P0CX56	146 aa	Predicted RBP	2.59	□□□□□ -1.99
COX23	YHR116W	PET54	P10834	293 aa		2.59	□□□□□ -1.99
COX23	YHR116W	URA6	P15700	204 aa		2.59	□□□□□ -1.99
COX23	YHR116W	FUS3	P16892	353 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
COX23	YHR116W	LSB5	P25369	354 aa		2.59	□□□□□ -1.99
COX23	YHR116W	VMA5	P31412	392 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
COX23	YHR116W	SWD3	P38123	315 aa		2.59	□□□□□ -1.99
COX23	YHR116W	FIG1	P38224	298 aa		2.59	□□□□□ -1.99
COX23	YHR116W	CUE1	P38428	203 aa		2.59	□□□□□ -1.99
COX23	YHR116W	BFR1	P38934	470 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.59	□□□□□ -1.99	not detected
COX23	YHR116W	BMT5	P40493	336 aa		2.59	□□□□□ -1.99
COX23	YHR116W	YJL118W	P47022	219 aa		2.59	□□□□□ -1.99
COX23	YHR116W	SOL1	P50278	321 aa		2.59	□□□□□ -1.99
COX23	YHR116W	VHT1	P53241	593 aa		2.59	□□□□□ -1.99
COX23	YHR116W	BUD25	P85052	153 aa		2.59	□□□□□ -1.99
COX23	YHR116W	BET5	Q03630	159 aa		2.59	□□□□□ -1.99
COX23	YHR116W	FIT1	Q04433	528 aa		2.59	□□□□□ -1.99
COX23	YHR116W	ATG41	Q12048	136 aa		2.59	□□□□□ -1.99
COX23	YHR116W	FMP16	Q12497	93 aa		2.59	□□□□□ -1.99
COX23	YHR116W	ODC2	Q99297	307 aa		2.59	□□□□□ -1.99
COX23	YHR116W	YLL053C	P0CD98	152 aa		2.58	□□□□□ -2
COX23	YHR116W	SAR1	P20606	190 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
COX23	YHR116W	RPL24B	P24000	155 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
COX23	YHR116W	DPB2	P24482	689 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
COX23	YHR116W	BUD23	P25627	275 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
COX23	YHR116W	TIP1	P27654	210 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
COX23	YHR116W	OCH1	P31755	480 aa		2.58	□□□□□ -2
COX23	YHR116W	RPB7	P34087	171 aa		2.58	□□□□□ -2
COX23	YHR116W	SRY1	P36007	326 aa		2.58	□□□□□ -2
COX23	YHR116W	YKL162C	P36052	402 aa		2.58	□□□□□ -2
COX23	YHR116W	PMU1	P36069	295 aa		2.58	□□□□□ -2
COX23	YHR116W	UTP30	P36144	274 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
COX23	YHR116W	JLP2	P40206	208 aa		2.58	□□□□□ -2
COX23	YHR116W	YIL024C	P40543	189 aa		2.58	□□□□□ -2
COX23	YHR116W	ATG18	P43601	500 aa		2.58	□□□□□ -2
COX23	YHR116W	YJR056C	P47115	236 aa		2.58	□□□□□ -2
COX23	YHR116W	DIE2	P50076	525 aa		2.58	□□□□□ -2
COX23	YHR116W	FMP48	P53233	369 aa		2.58	□□□□□ -2
COX23	YHR116W	SLX9	P53251	210 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
COX23	YHR116W	SPG4	Q04438	115 aa		2.58	□□□□□ -2
COX23	YHR116W	MDM36	Q06820	579 aa		2.58	□□□□□ -2
COX23	YHR116W	ATX2	Q12067	313 aa		2.58	□□□□□ -2
COX23	YHR116W	CRC1	Q12289	327 aa		2.58	□□□□□ -2
COX23	YHR116W	YLR365W	Q7LIF2	110 aa		2.58	□□□□□ -2
COX23	YHR116W	RPL5	P26321	297 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
COX23	YHR116W	HOM6	P31116	359 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
COX23	YHR116W	ERG2	P32352	222 aa		2.57	□□□□□ -2
COX23	YHR116W	SPS18	P32572	300 aa		2.57	□□□□□ -2
COX23	YHR116W	PRS4	P38063	326 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
COX23	YHR116W	GPX2	P38143	162 aa		2.57	□□□□□ -2
COX23	YHR116W	FCY21	P40039	528 aa		2.57	□□□□□ -2
COX23	YHR116W	YGL262W	P53054	175 aa		2.57	□□□□□ -2
COX23	YHR116W	GIM3	P53900	129 aa		2.57	□□□□□ -2
COX23	YHR116W	ODC1	Q03028	310 aa		2.57	□□□□□ -2
COX23	YHR116W	ATC1	Q04005	294 aa		2.57	□□□□□ -2
COX23	YHR116W	KEI1	Q06346	221 aa		2.57	□□□□□ -2
COX23	YHR116W	YPD1	Q07688	167 aa		2.57	□□□□□ -2
COX23	YHR116W	MSH5	Q12175	901 aa		2.57	□□□□□ -2
COX23	YHR116W	ATO3	Q12359	275 aa		2.57	□□□□□ -2
COX23	YHR116W	TFC7	Q12415	435 aa		2.57	□□□□□ -2
COX23	YHR116W	YOR192C-C	Q3E736	78 aa		2.57	□□□□□ -2
COX23	YHR116W	SUS1	Q6WNK7	96 aa		2.57	□□□□□ -2
COX23	YHR116W	MDM10	P18409	493 aa		2.56	□□□□□ -2
COX23	YHR116W	INO2	P26798	304 aa		2.56	□□□□□ -2
COX23	YHR116W	YKL075C	P36083	450 aa		2.56	□□□□□ -2
COX23	YHR116W	MBA1	P38300	278 aa		2.56	□□□□□ -2
COX23	YHR116W	MED8	P38304	223 aa		2.56	□□□□□ -2
COX23	YHR116W	YHK8	P38776	514 aa		2.56	□□□□□ -2
COX23	YHR116W	HTD2	P38790	280 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
COX23	YHR116W	IKI1	P38874	309 aa		2.56	□□□□□ -2
COX23	YHR116W	AGE2	P40529	298 aa		2.56	□□□□□ -2
COX23	YHR116W	YGR042W	P53227	271 aa		2.56	□□□□□ -2
COX23	YHR116W	ALG9	P53868	555 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
COX23	YHR116W	YOR292C	Q08743	309 aa		2.56	□□□□□ -2
COX23	YHR116W	YOR283W	Q12040	230 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
COX23	YHR116W	FCY1	Q12178	158 aa		2.56	□□□□□ -2
COX23	YHR116W	YOP1	Q12402	180 aa		2.56	□□□□□ -2
COX23	YHR116W	YPR108W-A	Q3E7B3	70 aa		2.56	□□□□□ -2
COX23	YHR116W	YOS1	Q3E834	85 aa		2.56	□□□□□ -2
COX23	YHR116W	DYN1	P36022	4092 aa		2.56	□□□□□ -2
COX23	YHR116W	RPS8A	P0CX39	200 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
COX23	YHR116W	RPS8B	P0CX40	200 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
COX23	YHR116W	YMR31	P19955	123 aa		2.55	□□□□□ -2
COX23	YHR116W	AGA2	P32781	87 aa		2.55	□□□□□ -2
COX23	YHR116W	TIR2	P33890	251 aa		2.55	□□□□□ -2
COX23	YHR116W	MRPL27	P36526	146 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
COX23	YHR116W	YJL213W	P40896	331 aa		2.55	□□□□□ -2
COX23	YHR116W	CAT5	P41735	233 aa		2.55	□□□□□ -2
COX23	YHR116W	YCH1	P42937	148 aa		2.55	□□□□□ -2
COX23	YHR116W	OTU1	P43558	301 aa		2.55	□□□□□ -2

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