RNA–Protein interactions for RNA: Q0140

VAR1, Transcript of Mitochondrial ribosomal protein of the small subunit, yeast

Gene VAR1, Length 1,197 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VAR1	Q0140	SHH3	Q04487	196 aa		-1.02	□□□□□ -2.57
VAR1	Q0140	YLR307C-A	Q3E825	87 aa		-1.02	□□□□□ -2.57
VAR1	Q0140	YKR070W	P36151	352 aa	Known RBP	-1.03	□□□□□ -2.57
VAR1	Q0140	YNL033W	P53964	284 aa		-1.03	□□□□□ -2.57
VAR1	Q0140	DUR1,2	P32528	1835 aa	Known RBP	-1.03	□□□□□ -2.57
VAR1	Q0140	ARP3	P47117	449 aa	Known RBP	-1.04	□□□□□ -2.58
VAR1	Q0140	YGL235W	P53071	178 aa		-1.04	□□□□□ -2.58
VAR1	Q0140	YKR005C	Q02203	525 aa		-1.04	□□□□□ -2.58
VAR1	Q0140	YMR099C	Q03161	297 aa	Known RBP	-1.04	□□□□□ -2.58
VAR1	Q0140	RRP17	Q04031	235 aa	Predicted RBP	-1.04	□□□□□ -2.58
VAR1	Q0140	RPL25	P04456	142 aa	Known RBP	-1.05	□□□□□ -2.58
VAR1	Q0140	STF2	P16965	84 aa		-1.05	□□□□□ -2.58
VAR1	Q0140	PTC1	P35182	281 aa		-1.05	□□□□□ -2.58
VAR1	Q0140	PAM17	P36147	197 aa		-1.05	□□□□□ -2.58
VAR1	Q0140	COX15	P40086	486 aa		-1.05	□□□□□ -2.58
VAR1	Q0140	LSM7	P53905	115 aa	Known RBP	-1.05	□□□□□ -2.58
VAR1	Q0140	DYN3	Q04949	312 aa		-1.05	□□□□□ -2.58
VAR1	Q0140	GGA1	Q06336	557 aa		-1.05	□□□□□ -2.58
VAR1	Q0140	GCN3	P14741	305 aa		-1.06	□□□□□ -2.58
VAR1	Q0140	YCR023C	P25351	611 aa		-1.06	□□□□□ -2.58
VAR1	Q0140	YBL010C	P32788	280 aa		-1.06	□□□□□ -2.58
VAR1	Q0140	YAR023C	D6VPM8	179 aa		-1.07	□□□□□ -2.58
VAR1	Q0140	ERG10	P41338	398 aa	Known RBP	-1.07	□□□□□ -2.58
VAR1	Q0140	PDR17	P53844	350 aa		-1.07	□□□□□ -2.58
VAR1	Q0140	SRL4	Q03085	281 aa		-1.07	□□□□□ -2.58
VAR1	Q0140	RPL43A	P0CX25	92 aa	Known RBP	-1.08	□□□□□ -2.58
VAR1	Q0140	RPL43B	P0CX26	92 aa		-1.08	□□□□□ -2.58
VAR1	Q0140	YPK2	P18961	677 aa		-1.08	□□□□□ -2.58
VAR1	Q0140	YER134C	P40081	178 aa		-1.08	□□□□□ -2.58
VAR1	Q0140	MPM1	P40364	252 aa		-1.08	□□□□□ -2.58
VAR1	Q0140	BMH2	P34730	273 aa	Known RBP	-1.09	□□□□□ -2.58
VAR1	Q0140	HMF1	P40037	129 aa	Known RBP	-1.1	□□□□□ -2.59
VAR1	Q0140	FMC1	P40491	155 aa		-1.1	□□□□□ -2.59
VAR1	Q0140	YLR283W	Q05867	314 aa		-1.1	□□□□□ -2.59
VAR1	Q0140	YLR157W-E	P0CF00	54 aa		-1.11	□□□□□ -2.59
VAR1	Q0140	SER2	P42941	309 aa		-1.12	□□□□□ -2.59
VAR1	Q0140	YMR253C	Q04835	414 aa		-1.12	□□□□□ -2.59
VAR1	Q0140	ADF1	Q2V2Q1	113 aa		-1.12	□□□□□ -2.59
VAR1	Q0140	RPL28	P02406	149 aa	Known RBP	-1.13	□□□□□ -2.59
VAR1	Q0140	SNF4	P12904	322 aa		-1.13	□□□□□ -2.59
VAR1	Q0140	SHB17	P36136	271 aa	Known RBP	-1.13	□□□□□ -2.59
VAR1	Q0140	AIM2	P39721	246 aa		-1.13	□□□□□ -2.59
VAR1	Q0140	MATALPHA1	P0CY06	175 aa		-1.14	□□□□□ -2.59
VAR1	Q0140	HMLALPHA1	P0CY07	175 aa		-1.14	□□□□□ -2.59
VAR1	Q0140	TIR1	P10863	254 aa		-1.14	□□□□□ -2.59
VAR1	Q0140	MTW1	P39731	289 aa		-1.14	□□□□□ -2.59
VAR1	Q0140	CUP9	P41817	306 aa		-1.14	□□□□□ -2.59
VAR1	Q0140	RRT8	Q08219	342 aa		-1.14	□□□□□ -2.59
VAR1	Q0140	MGT1	P26188	188 aa		-1.15	□□□□□ -2.59
VAR1	Q0140	YMR030W-A	Q3E760	96 aa		-1.15	□□□□□ -2.59
VAR1	Q0140	IDP1	P21954	428 aa	Known RBP	-1.16	□□□□□ -2.6
VAR1	Q0140	YMR141C	P40211	102 aa		-1.16	□□□□□ -2.6
VAR1	Q0140	PDS1	P40316	373 aa	Predicted RBP	-1.16	□□□□□ -2.6
VAR1	Q0140	MDM32	Q12171	622 aa		-1.16	□□□□□ -2.6
VAR1	Q0140	YMR31	P19955	123 aa		-1.17	□□□□□ -2.6
VAR1	Q0140	SKI6	P46948	246 aa	Predicted RBP	-1.17	□□□□□ -2.6
VAR1	Q0140	YGL230C	P53074	147 aa		-1.17	□□□□□ -2.6
VAR1	Q0140	YOR015W	Q12169	119 aa		-1.17	□□□□□ -2.6
VAR1	Q0140	DGK1	Q12382	290 aa		-1.17	□□□□□ -2.6
VAR1	Q0140	YCR016W	P25617	290 aa	Known RBP	-1.18	□□□□□ -2.6
VAR1	Q0140	RIB7	P33312	244 aa		-1.18	□□□□□ -2.6
VAR1	Q0140	YUH1	P35127	236 aa		-1.18	□□□□□ -2.6
VAR1	Q0140	YLR422W	Q06409	1932 aa		-1.19	□□□□□ -2.6
VAR1	Q0140	MER1	P16523	270 aa		-1.19	□□□□□ -2.6
VAR1	Q0140	PPA2	P28239	310 aa		-1.19	□□□□□ -2.6
VAR1	Q0140	MSN4	P33749	630 aa		-1.19	□□□□□ -2.6
VAR1	Q0140	TRM5	P38793	499 aa		-1.19	□□□□□ -2.6
VAR1	Q0140	SPC25	P40014	221 aa		-1.19	□□□□□ -2.6
VAR1	Q0140	IRC18	P47056	224 aa		-1.19	□□□□□ -2.6
VAR1	Q0140	PIR1	Q03178	341 aa		-1.19	□□□□□ -2.6
VAR1	Q0140	FCY1	Q12178	158 aa		-1.19	□□□□□ -2.6
VAR1	Q0140	ROM2	P51862	1356 aa	Known RBP	-1.2	□□□□□ -2.6
VAR1	Q0140	PRE1	P22141	198 aa	Known RBP	-1.2	□□□□□ -2.6
VAR1	Q0140	VMA6	P32366	345 aa	Known RBP	-1.2	□□□□□ -2.6
VAR1	Q0140	YHP1	Q04116	353 aa		-1.2	□□□□□ -2.6
VAR1	Q0140	YOL014W	Q08110	124 aa		-1.2	□□□□□ -2.6
VAR1	Q0140	CNB1	P25296	175 aa		-1.21	□□□□□ -2.6
VAR1	Q0140	MIC12	P38341	106 aa		-1.21	□□□□□ -2.6
VAR1	Q0140	PET117	Q02771	107 aa		-1.21	□□□□□ -2.6
VAR1	Q0140	POG1	P40473	351 aa		-1.22	□□□□□ -2.6
VAR1	Q0140	GPI14	P47088	403 aa	Known RBP	-1.22	□□□□□ -2.6
VAR1	Q0140	FUS2	Q05670	677 aa		-1.22	□□□□□ -2.6
VAR1	Q0140	NAT3	Q06504	195 aa		-1.22	□□□□□ -2.6
VAR1	Q0140	THP2	O13539	261 aa	Known RBP	-1.23	□□□□□ -2.61
VAR1	Q0140	RHO1	P06780	209 aa	Known RBP	-1.23	□□□□□ -2.61
VAR1	Q0140	NSE4	P43124	402 aa		-1.23	□□□□□ -2.61
VAR1	Q0140	MAK31	P23059	88 aa		-1.24	□□□□□ -2.61
VAR1	Q0140	ERG28	P40030	148 aa		-1.24	□□□□□ -2.61
VAR1	Q0140	CIN5	P40917	295 aa		-1.24	□□□□□ -2.61
VAR1	Q0140	ADO1	P47143	340 aa	Known RBP	-1.24	□□□□□ -2.61
VAR1	Q0140	HHT1	P61830	136 aa		-1.24	□□□□□ -2.61
VAR1	Q0140	YML100W-A	Q8TGT0	57 aa		-1.24	□□□□□ -2.61
VAR1	Q0140	CLG1	P35190	452 aa		-1.25	□□□□□ -2.61
VAR1	Q0140	MGR2	Q02889	113 aa		-1.25	□□□□□ -2.61
VAR1	Q0140	KIN28	P06242	306 aa		-1.26	□□□□□ -2.61
VAR1	Q0140	ASF2	P32448	525 aa	Predicted RBP	-1.26	□□□□□ -2.61
VAR1	Q0140	CCS1	P40202	249 aa	Known RBP	-1.26	□□□□□ -2.61
VAR1	Q0140	SEN15	Q04675	128 aa		-1.26	□□□□□ -2.61
VAR1	Q0140	RPL24B	P24000	155 aa	Known RBP	-1.27	□□□□□ -2.61
VAR1	Q0140	MOB1	P40484	314 aa		-1.27	□□□□□ -2.61

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