RNA–Protein interactions for RNA: YEL009C

GCN4, Transcript of bZIP transcriptional activator of amino acid biosynthetic genes, yeastyeast

Gene GCN4, Length 846 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GCN4YEL009C ATG40Q99325 256 aa1.84□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C TDH2P00358 332 aaKnown RBP1.83□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C SPS2P08459 502 aa1.83□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C YLL053CP0CD98 152 aa1.83□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C PET54P10834 293 aa1.83□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C IFM1P25038 676 aa1.83□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C RNA14P25298 677 aaKnown RBP1.83□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C YCR101CP25607 182 aa1.83□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C OCH1P31755 480 aa1.83□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C ERG3P32353 365 aa1.83□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C FMT1P32785 401 aa1.83□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C RIB7P33312 244 aa1.83□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C MRPL3P36516 390 aa1.83□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C MRPL27P36526 146 aaPredicted RBP1.83□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C SWD3P38123 315 aa1.83□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C YBR242WP38331 238 aa1.83□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C PRS2P38620 318 aaKnown RBP1.83□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C YHL044WP38727 235 aa1.83□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C CTR2P38865 189 aa1.83□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C RMD6P39975 231 aa1.83□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C CCS1P40202 249 aaKnown RBP1.83□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C SLM1P40485 686 aa1.83□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C YKE4P40544 346 aa1.83□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C YIL012WP40551 113 aa1.83□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C RPS0BP46654 252 aaKnown RBP1.83□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C NCA3P46955 337 aa1.83□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C GON7P46984 123 aa1.83□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C MRX5P47007 382 aa1.83□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C LSM1P47017 172 aaKnown RBP1.83□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C YJR011CP47086 261 aaPredicted RBP1.83□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C AIM25P47140 327 aa1.83□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C RSM27P53305 110 aa1.83□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C PRM15Q03262 622 aa1.83□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C YML018CQ03730 393 aa1.83□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C UPS1Q05776 175 aa1.83□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C LIP2Q06005 328 aa1.83□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C SYM1Q06563 197 aa1.83□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C YOR385WQ08909 290 aa1.83□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C CSF1Q12150 2958 aa1.83□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C FRE8Q12209 686 aa1.83□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C RTR2Q12378 196 aa1.83□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C GEP5Q12393 293 aa1.83□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C SPO24Q3E752 67 aa1.83□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C YCL021W-AQ96VH3 125 aa1.83□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C UBA3Q99344 299 aa1.83□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C PET20Q99373 253 aa1.83□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C Q0297Q9ZZV8 51 aa1.83□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C IRA2P19158 3079 aa1.82□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C YLR302CO13544 120 aa1.82□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C NHP6BP11633 99 aaKnown RBP1.82□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C SEN2P16658 377 aa1.82□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C APA2P22108 325 aa1.82□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C CPR4P25334 318 aa1.82□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C ATG22P25568 528 aa1.82□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C YCL042WP25572 119 aa1.82□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C BUD23P25627 275 aaPredicted RBP1.82□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C RPB7P34087 171 aa1.82□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C NTC20P38302 140 aaPredicted RBP1.82□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C SGN1P40561 250 aaKnown RBP RIP-Chip data1.82□□□□□ -2.12 RIP-Chip
GCN4YEL009C YIR020CP40575 100 aa1.82□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C PIR5P46999 287 aa1.82□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C YHC3P47040 408 aa1.82□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C XPT1P47165 209 aa1.82□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C DIE2P50076 525 aa1.82□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C SOL1P50278 321 aa1.82□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C GEP7P53171 287 aa1.82□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C OKP1P53298 406 aa1.82□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C SMM1P53720 384 aaKnown RBP1.82□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C YNR064CP53750 290 aa1.82□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C ALG9P53868 555 aaKnown RBP1.82□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C INN1P53901 409 aa1.82□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C RPL21AQ02753 160 aaKnown RBP1.82□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C FIT1Q04433 528 aa1.82□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C YDR286CQ05530 114 aa1.82□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C YOL118CQ08259 102 aa1.82□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C SCP1Q08873 200 aa1.82□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C RFM1Q12192 310 aa1.82□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C VAM3Q12241 283 aa1.82□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C MED4Q12343 284 aa1.82□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C RDI1Q12434 202 aa1.82□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C RPL21BQ12672 160 aaKnown RBP1.82□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C YCL048W-AQ2V2Q2 79 aa1.82□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C YOR192C-CQ3E736 78 aa1.82□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C YLR365WQ7LIF2 110 aa1.82□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C YMR105W-AQ8TGS8 64 aa1.82□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C RAD52P06778 471 aaKnown RBP1.81□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C CKA1P15790 372 aa1.81□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C FUS3P16892 353 aaKnown RBP1.81□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C ATP10P18496 279 aa1.81□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C MIR1P23641 311 aaKnown RBP1.81□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C YCR022CP25620 114 aa1.81□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C IES6P32617 166 aa1.81□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C YUH1P35127 236 aa1.81□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C PAN3P36102 679 aaPredicted RBP1.81□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C SWD2P36104 329 aaPredicted RBP1.81□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C UTP30P36144 274 aaKnown RBP1.81□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C POP8P38208 133 aa1.81□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C GPI18P38211 433 aa1.81□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C COS8P38723 381 aa1.81□□□□□ -2.12
GCN4YEL009C POP2P39008 433 aa1.81□□□□□ -2.12
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