RNA–Protein interactions for RNA: YDL117W

CYK3, Transcript of SH3-domain protein located in the bud neck and cytokinetic actin ring, yeast

Gene CYK3, Length 2,658 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CYK3	YDL117W	YBL112C	Q3E7Y4	105 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	HMRA1	P0CY11	126 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	UBC5	P15732	148 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	GLN3	P18494	730 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	FUB1	P25659	250 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	ZRT1	P32804	376 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	YGP1	P38616	354 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	IRC22	P40006	225 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	YIL059C	P40520	121 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	CAT5	P41735	233 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	SNO3	P43544	222 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	GLO1	P50107	326 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	SMM1	P53720	384 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	SNO2	P53823	222 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	CDC14	Q00684	551 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	IZH1	Q03419	316 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	YOR376W	Q08900	122 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	RPL12A	P0CX53	165 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	RPL12B	P0CX54	165 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	COX10	P21592	462 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	MCR1	P36060	302 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	NSA2	P40078	261 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	YNL198C	P40166	100 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	TTI2	P47168	421 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	UBC11	P52492	156 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	YGL230C	P53074	147 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	WSC2	P53832	503 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	RAV2	Q03956	351 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	TAZ1	Q06510	381 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	CTR3	Q06686	241 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	YDL157C	Q12082	118 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	HTA2	P04912	132 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	LRE1	P25579	583 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	PMI40	P29952	429 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	REC104	P33323	182 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	SHB17	P36136	271 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	ECM33	P38248	429 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	RTC2	P38279	296 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	BTT1	P40314	149 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	YFR020W	P43600	232 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	ATG27	P46989	271 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	MSO1	P53604	210 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	PDR17	P53844	350 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	IRC15	Q02733	499 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	TY2A-LR1	P0C2J4	438 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	TY2A-C	P25383	438 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	YSC83	P32792	385 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	COX13	P32799	129 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	MIX23	P38162	196 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	MSL1	P40567	111 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	YIR016W	P40572	265 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	HXT10	P43581	546 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	AIM25	P47140	327 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	AIM11	P87275	137 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	TY2A-DR2	Q03483	438 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	PLB3	Q08108	686 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	TY2A-B	Q12260	438 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	ERV2	Q12284	196 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	TY2A-OR2	Q12293	438 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	TY2A-DR1	Q12392	438 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	TY2A-OR1	Q12439	438 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	YJR112W-A	Q3E743	109 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	TY2A-DR3	Q99303	438 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	UBA3	Q99344	299 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	FLO11	P08640	1367 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	GAS1	P22146	559 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	PDE1	P22434	369 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	DCW1	P36091	449 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	YKR041W	P36134	250 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	ISC1	P40015	477 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	RNH201	P53942	307 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	YMR178W	Q03219	274 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	MSS11	Q03825	758 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	YOL073C	Q08232	322 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	YLR049C	Q12110	428 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	COX17	Q12287	69 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	RAD6	P06104	172 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	RPL40A	P0CH08	128 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	RPL40B	P0CH09	128 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	PHO85	P17157	305 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	PAD1	P33751	242 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.53	□□□□□ -1.68	not detected
CYK3	YDL117W	SGN1	P40561	250 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.53	□□□□□ -1.68	not detected
CYK3	YDL117W	PRY1	P47032	299 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	SBH1	P52870	82 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	ELP4	Q02884	456 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	TIR4	Q12218	487 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	RPL7A	P05737	244 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	SDH2	P21801	266 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	MRPL20	P22354	195 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	MTR2	P34232	184 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	EMC3	P36039	253 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	MRPS9	P38120	278 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	YDL186W	P48568	277 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	BNS1	P50084	137 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	GAS3	Q03655	524 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	HNT1	Q04344	158 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	YML053C	Q04978	212 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	GRX8	Q05926	109 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	YPQ1	Q12010	308 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	SIR2	P06700	562 aa		4.52	□□□□□ -1.69

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