RNA–Protein interactions for RNA: YDL069C

CBS1, Mitochondrial translational activator of the COB mRNA, yeast

Gene CBS1, Length 690 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CBS1	YDL069C	DIG2	Q03373	323 aa	Known RBP	0.26	□□□□□ -2.37
CBS1	YDL069C	FAS1	P07149	2051 aa	Known RBP	0.25	□□□□□ -2.37
CBS1	YDL069C	RPB3	P16370	318 aa	Known RBP	0.25	□□□□□ -2.37
CBS1	YDL069C	YUH1	P35127	236 aa		0.25	□□□□□ -2.37
CBS1	YDL069C	TVP23	P38962	199 aa		0.25	□□□□□ -2.37
CBS1	YDL069C	YEL008W	P40001	126 aa		0.25	□□□□□ -2.37
CBS1	YDL069C	COX15	P40086	486 aa		0.25	□□□□□ -2.37
CBS1	YDL069C	RRT8	Q08219	342 aa		0.25	□□□□□ -2.37
CBS1	YDL069C	FMP49	A0A023PZB3	126 aa		0.24	□□□□□ -2.37
CBS1	YDL069C	ATP15	P21306	62 aa		0.24	□□□□□ -2.37
CBS1	YDL069C	PRX1	P34227	261 aa	Known RBP	0.24	□□□□□ -2.37
CBS1	YDL069C	RPC17	P47076	161 aa		0.24	□□□□□ -2.37
CBS1	YDL069C	YLR460C	P54007	376 aa		0.24	□□□□□ -2.37
CBS1	YDL069C	RRP36	Q12481	300 aa	Predicted RBP	0.24	□□□□□ -2.37
CBS1	YDL069C	COA3	Q3E7B2	85 aa		0.24	□□□□□ -2.37
CBS1	YDL069C	SPO13	P23624	291 aa		0.23	□□□□□ -2.37
CBS1	YDL069C	MGM101	P32787	269 aa	Known RBP	0.23	□□□□□ -2.37
CBS1	YDL069C	MIC26	P50087	233 aa		0.23	□□□□□ -2.37
CBS1	YDL069C	RRN5	Q02983	363 aa		0.23	□□□□□ -2.37
CBS1	YDL069C	YLR283W	Q05867	314 aa		0.23	□□□□□ -2.37
CBS1	YDL069C	DGA1	Q08650	418 aa		0.23	□□□□□ -2.37
CBS1	YDL069C	CKS1	P20486	150 aa	Known RBP	0.22	□□□□□ -2.37
CBS1	YDL069C	RPB7	P34087	171 aa		0.22	□□□□□ -2.37
CBS1	YDL069C	MRPL15	P36523	253 aa		0.22	□□□□□ -2.37
CBS1	YDL069C	YGR050C	P53231	118 aa		0.22	□□□□□ -2.37
CBS1	YDL069C	DAD4	P69851	72 aa		0.22	□□□□□ -2.37
CBS1	YDL069C	YFR032C-B	Q8TGU2	87 aa		0.22	□□□□□ -2.37
CBS1	YDL069C	YCR016W	P25617	290 aa	Known RBP	0.21	□□□□□ -2.38
CBS1	YDL069C	AIM25	P47140	327 aa		0.21	□□□□□ -2.38
CBS1	YDL069C	UBC12	P52491	188 aa		0.21	□□□□□ -2.38
CBS1	YDL069C	MPC3	P53311	146 aa		0.21	□□□□□ -2.38
CBS1	YDL069C	UPS3	Q04006	179 aa		0.21	□□□□□ -2.38
CBS1	YDL069C	YDR391C	Q04170	232 aa		0.21	□□□□□ -2.38
CBS1	YDL069C	ODC2	Q99297	307 aa		0.21	□□□□□ -2.38
CBS1	YDL069C	IKI3	Q06706	1349 aa	Known RBP	0.2	□□□□□ -2.38
CBS1	YDL069C	YHL018W	P38744	120 aa	Predicted RBP	0.2	□□□□□ -2.38
CBS1	YDL069C	ALG13	P53178	202 aa		0.2	□□□□□ -2.38
CBS1	YDL069C	YMR226C	Q05016	267 aa	Known RBP	0.2	□□□□□ -2.38
CBS1	YDL069C	PRP11	Q07350	266 aa	Predicted RBP	0.2	□□□□□ -2.38
CBS1	YDL069C	POR1	P04840	283 aa	Known RBP	0.19	□□□□□ -2.38
CBS1	YDL069C	SEC4	P07560	215 aa	Known RBP	0.19	□□□□□ -2.38
CBS1	YDL069C	MAG1	P22134	296 aa	Known RBP	0.19	□□□□□ -2.38
CBS1	YDL069C	UBC8	P28263	218 aa		0.19	□□□□□ -2.38
CBS1	YDL069C	YIL102C	P40488	101 aa		0.19	□□□□□ -2.38
CBS1	YDL069C	GET1	P53192	235 aa		0.19	□□□□□ -2.38
CBS1	YDL069C	COG5	P53951	403 aa		0.19	□□□□□ -2.38
CBS1	YDL069C	PET117	Q02771	107 aa		0.19	□□□□□ -2.38
CBS1	YDL069C	YPR203W	Q08994	102 aa		0.19	□□□□□ -2.38
CBS1	YDL069C	YHR214C-E	Q8TGK0	99 aa		0.19	□□□□□ -2.38
CBS1	YDL069C	SEY1	Q99287	776 aa		0.19	□□□□□ -2.38
CBS1	YDL069C	RPL28	P02406	149 aa	Known RBP	0.18	□□□□□ -2.38
CBS1	YDL069C	RPL25	P04456	142 aa	Known RBP	0.18	□□□□□ -2.38
CBS1	YDL069C	MATALPHA1	P0CY06	175 aa		0.18	□□□□□ -2.38
CBS1	YDL069C	HMLALPHA1	P0CY07	175 aa		0.18	□□□□□ -2.38
CBS1	YDL069C	GCN3	P14741	305 aa		0.18	□□□□□ -2.38
CBS1	YDL069C	BNA7	Q04066	261 aa		0.18	□□□□□ -2.38
CBS1	YDL069C	HNT1	Q04344	158 aa	Known RBP	0.18	□□□□□ -2.38
CBS1	YDL069C	YIL177C	P40434	1758 aa		0.17	□□□□□ -2.38
CBS1	YDL069C	YJL225C	P40889	1758 aa		0.17	□□□□□ -2.38
CBS1	YDL069C	COX8	P04039	78 aa		0.17	□□□□□ -2.38
CBS1	YDL069C	AHT1	P29589	182 aa		0.17	□□□□□ -2.38
CBS1	YDL069C	VMA6	P32366	345 aa	Known RBP	0.17	□□□□□ -2.38
CBS1	YDL069C	MSN4	P33749	630 aa		0.17	□□□□□ -2.38
CBS1	YDL069C	FIT2	Q08906	153 aa		0.17	□□□□□ -2.38
CBS1	YDL069C	YMR31	P19955	123 aa		0.16	□□□□□ -2.38
CBS1	YDL069C	RPL24B	P24000	155 aa	Known RBP	0.16	□□□□□ -2.38
CBS1	YDL069C	YCR090C	P25654	182 aa	Known RBP	0.16	□□□□□ -2.38
CBS1	YDL069C	PAN3	P36102	679 aa	Predicted RBP	0.16	□□□□□ -2.38
CBS1	YDL069C	YBR242W	P38331	238 aa		0.16	□□□□□ -2.38
CBS1	YDL069C	YHL037C	P38733	133 aa		0.16	□□□□□ -2.38
CBS1	YDL069C	ALB1	P47019	175 aa	Predicted RBP	0.16	□□□□□ -2.38
CBS1	YDL069C	MET31	Q03081	177 aa		0.16	□□□□□ -2.38
CBS1	YDL069C	IRC23	Q08416	157 aa		0.16	□□□□□ -2.38
CBS1	YDL069C	YNG1	Q08465	219 aa		0.16	□□□□□ -2.38
CBS1	YDL069C	YPR013C	Q12145	317 aa		0.16	□□□□□ -2.38
CBS1	YDL069C	ARO7	P32178	256 aa		0.15	□□□□□ -2.39
CBS1	YDL069C	SFK1	P35735	353 aa		0.15	□□□□□ -2.39
CBS1	YDL069C	THG1	P53215	237 aa	Known RBP	0.15	□□□□□ -2.39
CBS1	YDL069C	PDR17	P53844	350 aa		0.15	□□□□□ -2.39
CBS1	YDL069C	LSM7	P53905	115 aa	Known RBP	0.15	□□□□□ -2.39
CBS1	YDL069C	PET191	Q02772	108 aa		0.15	□□□□□ -2.39
CBS1	YDL069C	RNH202	Q05635	350 aa		0.15	□□□□□ -2.39
CBS1	YDL069C	CCW12	Q12127	133 aa		0.15	□□□□□ -2.39
CBS1	YDL069C	CFT1	Q06632	1357 aa	Known RBP	0.15	□□□□□ -2.39
CBS1	YDL069C	HFA1	P32874	2273 aa		0.15	□□□□□ -2.39
CBS1	YDL069C	THP2	O13539	261 aa	Known RBP	0.14	□□□□□ -2.39
CBS1	YDL069C	RHO1	P06780	209 aa	Known RBP	0.14	□□□□□ -2.39
CBS1	YDL069C	OCH1	P31755	480 aa		0.14	□□□□□ -2.39
CBS1	YDL069C	MIC12	P38341	106 aa		0.14	□□□□□ -2.39
CBS1	YDL069C	YAR064W	P39563	99 aa		0.14	□□□□□ -2.39
CBS1	YDL069C	HMF1	P40037	129 aa	Known RBP	0.14	□□□□□ -2.39
CBS1	YDL069C	YFL051C	P43552	160 aa		0.14	□□□□□ -2.39
CBS1	YDL069C	IRC18	P47056	224 aa		0.14	□□□□□ -2.39
CBS1	YDL069C	SED1	Q01589	338 aa		0.14	□□□□□ -2.39
CBS1	YDL069C	YMR295C	Q03559	197 aa		0.14	□□□□□ -2.39
CBS1	YDL069C	PHO85	P17157	305 aa		0.13	□□□□□ -2.39
CBS1	YDL069C	TRM5	P38793	499 aa		0.13	□□□□□ -2.39
CBS1	YDL069C	DYN3	Q04949	312 aa		0.13	□□□□□ -2.39
CBS1	YDL069C	FYV12	Q08559	129 aa		0.13	□□□□□ -2.39
CBS1	YDL069C	MDM32	Q12171	622 aa		0.13	□□□□□ -2.39

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