RNA–Protein interactions for RNA: YMR317W

YMR317W, Transcript of Putative protein of unknown function, yeastyeast

Gene YMR317W, Length 3,423 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMR317WYMR317W ALE1Q08548 619 aa3.92□□□□□ -1.78
YMR317WYMR317W SWI1P09547 1314 aa3.92□□□□□ -1.78
YMR317WYMR317W SSK22P25390 1331 aaPredicted RBP3.92□□□□□ -1.78
YMR317WYMR317W QCR6P00127 147 aa3.92□□□□□ -1.78
YMR317WYMR317W SSP1P38871 571 aa3.92□□□□□ -1.78
YMR317WYMR317W BOI2P39969 1040 aa3.92□□□□□ -1.78
YMR317WYMR317W UBP10P53874 792 aaPredicted RBP3.92□□□□□ -1.78
YMR317WYMR317W ECM16Q04217 1267 aaKnown RBP3.92□□□□□ -1.78
YMR317WYMR317W AIM44Q99299 758 aa3.92□□□□□ -1.78
YMR317WYMR317W FIG2P25653 1609 aa3.92□□□□□ -1.78
YMR317WYMR317W MRP7P12687 371 aa3.92□□□□□ -1.78
YMR317WYMR317W DAL5P15365 543 aa3.92□□□□□ -1.78
YMR317WYMR317W SAC3P46674 1301 aa3.92□□□□□ -1.78
YMR317WYMR317W TRP5P00931 707 aaKnown RBP3.91□□□□□ -1.78
YMR317WYMR317W GTT3P39996 337 aa3.91□□□□□ -1.78
YMR317WYMR317W GLN1P32288 370 aaKnown RBP3.91□□□□□ -1.78
YMR317WYMR317W PRP40P33203 583 aaKnown RBP3.91□□□□□ -1.78
YMR317WYMR317W CTR9P89105 1077 aa3.91□□□□□ -1.78
YMR317WYMR317W CSI1Q04368 295 aa3.91□□□□□ -1.78
YMR317WYMR317W NPR2P39923 615 aa3.91□□□□□ -1.78
YMR317WYMR317W KRI1P42846 591 aaKnown RBP3.91□□□□□ -1.78
YMR317WYMR317W YPR204WQ08995 1032 aa3.91□□□□□ -1.78
YMR317WYMR317W MSB4Q12317 492 aa3.91□□□□□ -1.78
YMR317WYMR317W ARG8P18544 423 aa3.9□□□□□ -1.78
YMR317WYMR317W TUM1Q08686 304 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.78
YMR317WYMR317W CDC16P09798 840 aa3.9□□□□□ -1.79
YMR317WYMR317W UTP22P53254 1237 aaPredicted RBP3.9□□□□□ -1.79
YMR317WYMR317W MTC5Q03897 1148 aa3.9□□□□□ -1.79
YMR317WYMR317W UBP1P25037 809 aa3.89□□□□□ -1.79
YMR317WYMR317W RAD24P32641 659 aa3.89□□□□□ -1.79
YMR317WYMR317W MAP2P38174 421 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
YMR317WYMR317W BDF1P35817 686 aa3.89□□□□□ -1.79
YMR317WYMR317W RPN11P43588 306 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
YMR317WYMR317W HKR1P41809 1802 aa3.89□□□□□ -1.79
YMR317WYMR317W RAD50P12753 1312 aa3.89□□□□□ -1.79
YMR317WYMR317W BUD31P25337 157 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
YMR317WYMR317W YGL015CP33199 130 aa3.89□□□□□ -1.79
YMR317WYMR317W YNG2P38806 282 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
YMR317WYMR317W RSM7P47150 247 aa3.89□□□□□ -1.79
YMR317WYMR317W GRE2Q12068 342 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
YMR317WYMR317W SSF1P38789 453 aaPredicted RBP3.88□□□□□ -1.79
YMR317WYMR317W PUF6Q04373 656 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
YMR317WYMR317W NYV1Q12255 253 aa3.88□□□□□ -1.79
YMR317WYMR317W KNS1P32350 737 aaPredicted RBP3.88□□□□□ -1.79
YMR317WYMR317W UBP12P39538 1254 aa3.88□□□□□ -1.79
YMR317WYMR317W ILV3P39522 585 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
YMR317WYMR317W YBR287WP38355 427 aa3.87□□□□□ -1.79
YMR317WYMR317W SPO1P53541 631 aa3.87□□□□□ -1.79
YMR317WYMR317W ZDS2P54786 942 aa3.87□□□□□ -1.79
YMR317WYMR317W NOT3P06102 836 aaKnown RBP3.87□□□□□ -1.79
YMR317WYMR317W NUP133P36161 1157 aa3.87□□□□□ -1.79
YMR317WYMR317W NOP8Q08287 484 aaPredicted RBP3.87□□□□□ -1.79
YMR317WYMR317W LPD1P09624 499 aaKnown RBP3.86□□□□□ -1.79
YMR317WYMR317W PCT1P13259 424 aa3.86□□□□□ -1.79
YMR317WYMR317W DJP1P40564 432 aa3.86□□□□□ -1.79
YMR317WYMR317W YJL181WP46987 611 aa3.86□□□□□ -1.79
YMR317WYMR317W TEA1P47988 759 aa3.86□□□□□ -1.79
YMR317WYMR317W DIB1Q06819 143 aaPredicted RBP3.86□□□□□ -1.79
YMR317WYMR317W BUG1Q12191 341 aa3.86□□□□□ -1.79
YMR317WYMR317W SPC110P32380 944 aa3.86□□□□□ -1.79
YMR317WYMR317W TOS1P38288 455 aa3.86□□□□□ -1.79
YMR317WYMR317W RAD26P40352 1085 aa3.86□□□□□ -1.79
YMR317WYMR317W CTH1P47976 325 aa3.86□□□□□ -1.79
YMR317WYMR317W RAT1Q02792 1006 aaKnown RBP3.86□□□□□ -1.79
YMR317WYMR317W ADR1P07248 1323 aa3.85□□□□□ -1.79
YMR317WYMR317W EPS1P40557 701 aa3.85□□□□□ -1.79
YMR317WYMR317W ITC1P53125 1264 aa3.85□□□□□ -1.79
YMR317WYMR317W YGR122WP53272 402 aa3.85□□□□□ -1.79
YMR317WYMR317W HAT1Q12341 374 aa3.85□□□□□ -1.79
YMR317WYMR317W FAS2P19097 1887 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
YMR317WYMR317W PMD1P32634 1753 aa3.85□□□□□ -1.79
YMR317WYMR317W APL2P36000 726 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
YMR317WYMR317W AI2P03876 854 aa3.84□□□□□ -1.79
YMR317WYMR317W SUP35P05453 685 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.79
YMR317WYMR317W NMD2P38798 1089 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.79
YMR317WYMR317W FPR4Q06205 392 aaPredicted RBP3.84□□□□□ -1.79
YMR317WYMR317W ALD2P47771 506 aa3.84□□□□□ -1.8
YMR317WYMR317W NKP2Q06162 153 aa3.84□□□□□ -1.8
YMR317WYMR317W SWC3P31376 625 aa3.83□□□□□ -1.8
YMR317WYMR317W SIC1P38634 284 aa3.83□□□□□ -1.8
YMR317WYMR317W CST9Q06032 482 aa3.83□□□□□ -1.8
YMR317WYMR317W MSP1P28737 362 aa3.83□□□□□ -1.8
YMR317WYMR317W DEF1P35732 738 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
YMR317WYMR317W GYP5Q12344 894 aa3.83□□□□□ -1.8
YMR317WYMR317W NOP58Q12499 511 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
YMR317WYMR317W LYS4P49367 693 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
YMR317WYMR317W ALD3P54114 506 aa3.83□□□□□ -1.8
YMR317WYMR317W VPS64Q03944 604 aa3.83□□□□□ -1.8
YMR317WYMR317W PSH1Q12161 406 aa3.83□□□□□ -1.8
YMR317WYMR317W NCB2Q92317 146 aa3.83□□□□□ -1.8
YMR317WYMR317W POM152P39685 1337 aa3.83□□□□□ -1.8
YMR317WYMR317W NPL4P33755 580 aa3.82□□□□□ -1.8
YMR317WYMR317W ECM21P38167 1117 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
YMR317WYMR317W VPS4P52917 437 aa3.82□□□□□ -1.8
YMR317WYMR317W GCR2Q01722 534 aa3.82□□□□□ -1.8
YMR317WYMR317W SER1P33330 395 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
YMR317WYMR317W OSH3P38713 996 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
YMR317WYMR317W SCY1P53009 804 aa3.82□□□□□ -1.8
YMR317WYMR317W YGL242CP53066 181 aa3.82□□□□□ -1.8
YMR317WYMR317W MLC1P53141 149 aa3.82□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 28.6 ms