RNA–Protein interactions for RNA: YMR019W

STB4, Transcript of Putative transcription factor, yeast

Gene STB4, Length 2,850 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
STB4	YMR019W	ATG1	P53104	897 aa		3.13	□□□□□ -1.91
STB4	YMR019W	DFG5	Q05031	458 aa		3.13	□□□□□ -1.91
STB4	YMR019W	WTM2	Q12206	467 aa		3.12	□□□□□ -1.91
STB4	YMR019W	SRF1	Q12516	437 aa		3.12	□□□□□ -1.91
STB4	YMR019W	ARG82	P07250	355 aa		3.12	□□□□□ -1.91
STB4	YMR019W	SWI5	P08153	709 aa		3.12	□□□□□ -1.91
STB4	YMR019W	STE6	P12866	1290 aa		3.12	□□□□□ -1.91
STB4	YMR019W	HAL5	P38970	855 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
STB4	YMR019W	CST6	P40535	587 aa		3.12	□□□□□ -1.91
STB4	YMR019W	ALA1	P40825	983 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
STB4	YMR019W	THI12	P42883	340 aa		3.12	□□□□□ -1.91
STB4	YMR019W	THI5	P43534	340 aa		3.12	□□□□□ -1.91
STB4	YMR019W	ALD4	P46367	519 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
STB4	YMR019W	ACF4	P47129	309 aa		3.12	□□□□□ -1.91
STB4	YMR019W	THI11	P47183	340 aa		3.12	□□□□□ -1.91
STB4	YMR019W	THI13	Q07748	340 aa		3.12	□□□□□ -1.91
STB4	YMR019W	NAP1	P25293	417 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
STB4	YMR019W	GLO3	P38682	493 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
STB4	YMR019W	ERP5	P38819	212 aa		3.11	□□□□□ -1.91
STB4	YMR019W	YTA6	P40328	754 aa		3.11	□□□□□ -1.91
STB4	YMR019W	MCM1	P11746	286 aa		3.11	□□□□□ -1.91
STB4	YMR019W	NGR1	P32831	672 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
STB4	YMR019W	YBL086C	P38177	466 aa		3.11	□□□□□ -1.91
STB4	YMR019W	MGE1	P38523	228 aa		3.11	□□□□□ -1.91
STB4	YMR019W	ITT1	Q04638	464 aa		3.11	□□□□□ -1.91
STB4	YMR019W	SCD5	P34758	872 aa		3.1	□□□□□ -1.91
STB4	YMR019W	MSC6	Q08818	692 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
STB4	YMR019W	CDC4	P07834	779 aa		3.1	□□□□□ -1.91
STB4	YMR019W	AIM44	Q99299	758 aa		3.1	□□□□□ -1.91
STB4	YMR019W	YHL050C	P38721	697 aa		3.1	□□□□□ -1.91
STB4	YMR019W	YHR219W	P38900	624 aa		3.1	□□□□□ -1.91
STB4	YMR019W	FOX2	Q02207	900 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
STB4	YMR019W	PPX1	P38698	397 aa		3.09	□□□□□ -1.91
STB4	YMR019W	QDR1	P40475	563 aa		3.09	□□□□□ -1.91
STB4	YMR019W	UFD2	P54860	961 aa		3.09	□□□□□ -1.91
STB4	YMR019W	SEN54	Q02825	467 aa	Predicted RBP	3.09	□□□□□ -1.91
STB4	YMR019W	LSO1	Q3E827	93 aa		3.09	□□□□□ -1.91
STB4	YMR019W	AHP1	P38013	176 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.92
STB4	YMR019W	SUM1	P46676	1062 aa		3.09	□□□□□ -1.92
STB4	YMR019W	ISC10	P32645	267 aa		3.08	□□□□□ -1.92
STB4	YMR019W	SMC1	P32908	1225 aa		3.08	□□□□□ -1.92
STB4	YMR019W	FIR1	P40020	876 aa		3.08	□□□□□ -1.92
STB4	YMR019W	MSB3	P48566	633 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
STB4	YMR019W	SDH2	P21801	266 aa		3.07	□□□□□ -1.92
STB4	YMR019W	AFT1	P22149	690 aa		3.07	□□□□□ -1.92
STB4	YMR019W	RGA1	P39083	1007 aa		3.07	□□□□□ -1.92
STB4	YMR019W	MET10	P39692	1035 aa		3.07	□□□□□ -1.92
STB4	YMR019W	UTP7	P40055	554 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
STB4	YMR019W	RPP1A	P05318	106 aa	Predicted RBP	3.07	□□□□□ -1.92
STB4	YMR019W	ASH1	P34233	588 aa		3.07	□□□□□ -1.92
STB4	YMR019W	LDH1	P38139	375 aa		3.07	□□□□□ -1.92
STB4	YMR019W	TPS3	P38426	1054 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
STB4	YMR019W	BOL3	P39724	118 aa		3.07	□□□□□ -1.92
STB4	YMR019W	POL32	P47110	350 aa		3.07	□□□□□ -1.92
STB4	YMR019W	YLR346C	Q06139	101 aa		3.07	□□□□□ -1.92
STB4	YMR019W	UTP4	Q06679	776 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
STB4	YMR019W	GCD6	P32501	712 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
STB4	YMR019W	YBR197C	P38306	217 aa		3.06	□□□□□ -1.92
STB4	YMR019W	DYS1	P38791	387 aa		3.06	□□□□□ -1.92
STB4	YMR019W	IPL1	P38991	367 aa		3.06	□□□□□ -1.92
STB4	YMR019W	GCR2	Q01722	534 aa		3.06	□□□□□ -1.92
STB4	YMR019W	SVF1	Q05515	481 aa		3.06	□□□□□ -1.92
STB4	YMR019W	TRL1	P09880	827 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
STB4	YMR019W	MDJ2	P42834	146 aa		3.06	□□□□□ -1.92
STB4	YMR019W	LSC2	P53312	427 aa		3.06	□□□□□ -1.92
STB4	YMR019W	TRS120	Q04183	1289 aa		3.06	□□□□□ -1.92
STB4	YMR019W	SAM37	P50110	327 aa		3.06	□□□□□ -1.92
STB4	YMR019W	NUT2	Q06213	157 aa		3.06	□□□□□ -1.92
STB4	YMR019W	DPS1	P04802	557 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
STB4	YMR019W	AAD14	P42884	376 aa		3.05	□□□□□ -1.92
STB4	YMR019W	MSN5	P52918	1224 aa		3.05	□□□□□ -1.92
STB4	YMR019W	SUT1	P53032	299 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
STB4	YMR019W	OXR1	Q08952	273 aa		3.05	□□□□□ -1.92
STB4	YMR019W	MRPL33	P20084	86 aa		3.05	□□□□□ -1.92
STB4	YMR019W	CIC1	P38779	376 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
STB4	YMR019W	MET32	Q12041	191 aa		3.05	□□□□□ -1.92
STB4	YMR019W	SUV3	P32580	737 aa		3.04	□□□□□ -1.92
STB4	YMR019W	ECM2	P38241	364 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
STB4	YMR019W	NUP85	P46673	744 aa		3.04	□□□□□ -1.92
STB4	YMR019W	ORC1	P54784	914 aa	Predicted RBP	3.04	□□□□□ -1.92
STB4	YMR019W	CAB1	Q04430	367 aa		3.04	□□□□□ -1.92
STB4	YMR019W	Q0182	Q9ZZW1	134 aa		3.04	□□□□□ -1.92
STB4	YMR019W	HXT8	P40886	569 aa		3.04	□□□□□ -1.92
STB4	YMR019W	PTK2	P47116	818 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
STB4	YMR019W	YPQ2	Q06328	317 aa		3.04	□□□□□ -1.92
STB4	YMR019W	RAS1	P01119	309 aa		3.03	□□□□□ -1.92
STB4	YMR019W	HXT5	P38695	592 aa		3.03	□□□□□ -1.92
STB4	YMR019W	UBP2	Q01476	1272 aa		3.03	□□□□□ -1.92
STB4	YMR019W	VMA3	P25515	160 aa		3.02	□□□□□ -1.93
STB4	YMR019W	KAP122	P32767	1081 aa		3.02	□□□□□ -1.93
STB4	YMR019W	JJJ2	P46997	583 aa		3.02	□□□□□ -1.93
STB4	YMR019W	YNL011C	P53980	444 aa		3.02	□□□□□ -1.93
STB4	YMR019W	APC11	Q12157	165 aa		3.02	□□□□□ -1.93
STB4	YMR019W	TRK1	P12685	1235 aa		3.02	□□□□□ -1.93
STB4	YMR019W	IRE1	P32361	1115 aa		3.02	□□□□□ -1.93
STB4	YMR019W	VPS35	P34110	944 aa		3.02	□□□□□ -1.93
STB4	YMR019W	RAD55	P38953	406 aa		3.02	□□□□□ -1.93
STB4	YMR019W	VTC4	P47075	721 aa		3.02	□□□□□ -1.93
STB4	YMR019W	ISW1	P38144	1129 aa		3.02	□□□□□ -1.93
STB4	YMR019W	YJR115W	P47152	169 aa		3.02	□□□□□ -1.93

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 9.3 ms