RNA–Protein interactions for RNA: YKL217W

JEN1, Transcript of Monocarboxylate/proton symporter of the plasma membrane, yeast

Gene JEN1, Length 1,851 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
JEN1	YKL217W	ATG20	Q07528	640 aa		4.62	□□□□□ -1.67
JEN1	YKL217W	MAM3	Q12296	706 aa		4.62	□□□□□ -1.67
JEN1	YKL217W	ETP1	P38748	585 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
JEN1	YKL217W	RAT1	Q02792	1006 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
JEN1	YKL217W	ERO1	Q03103	563 aa		4.61	□□□□□ -1.67
JEN1	YKL217W	PHM7	Q12252	991 aa		4.61	□□□□□ -1.67
JEN1	YKL217W	YLR278C	Q05854	1341 aa		4.61	□□□□□ -1.67
JEN1	YKL217W	RSM7	P47150	247 aa		4.6	□□□□□ -1.67
JEN1	YKL217W	FAP1	P53971	965 aa		4.6	□□□□□ -1.67
JEN1	YKL217W	GAP1	P19145	602 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
JEN1	YKL217W	RTG2	P32608	588 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
JEN1	YKL217W	GUA1	P38625	525 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
JEN1	YKL217W	SHC1	P39000	512 aa		4.6	□□□□□ -1.67
JEN1	YKL217W	MDG1	P53885	366 aa		4.6	□□□□□ -1.67
JEN1	YKL217W	DCD1	P06773	312 aa		4.59	□□□□□ -1.67
JEN1	YKL217W	APL2	P36000	726 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
JEN1	YKL217W	VHR2	P40041	505 aa		4.59	□□□□□ -1.67
JEN1	YKL217W	YNR021W	P53723	404 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
JEN1	YKL217W	VPS13	Q07878	3144 aa		4.58	□□□□□ -1.68
JEN1	YKL217W	SIT4	P20604	311 aa		4.58	□□□□□ -1.68
JEN1	YKL217W	FRD1	P32614	470 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
JEN1	YKL217W	THI22	Q06490	572 aa		4.58	□□□□□ -1.68
JEN1	YKL217W	PIB1	Q06651	286 aa		4.58	□□□□□ -1.68
JEN1	YKL217W	SSP2	Q08646	371 aa		4.58	□□□□□ -1.68
JEN1	YKL217W	YPR117W	Q06116	2489 aa		4.58	□□□□□ -1.68
JEN1	YKL217W	ARG8	P18544	423 aa		4.58	□□□□□ -1.68
JEN1	YKL217W	PRD1	P25375	712 aa		4.58	□□□□□ -1.68
JEN1	YKL217W	GLC3	P32775	704 aa		4.58	□□□□□ -1.68
JEN1	YKL217W	SLX8	P40072	274 aa		4.58	□□□□□ -1.68
JEN1	YKL217W	RTR1	P40084	226 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
JEN1	YKL217W	MPP10	P47083	593 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
JEN1	YKL217W	ZDS2	P54786	942 aa		4.58	□□□□□ -1.68
JEN1	YKL217W	NUM1	Q00402	2748 aa		4.58	□□□□□ -1.68
JEN1	YKL217W	FET4	P40988	552 aa		4.57	□□□□□ -1.68
JEN1	YKL217W	VPS64	Q03944	604 aa		4.57	□□□□□ -1.68
JEN1	YKL217W	SAS4	Q04003	481 aa		4.57	□□□□□ -1.68
JEN1	YKL217W	DIB1	Q06819	143 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
JEN1	YKL217W	SUB2	Q07478	446 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
JEN1	YKL217W	AIM7	Q12156	149 aa		4.57	□□□□□ -1.68
JEN1	YKL217W	MSM1	P22438	575 aa		4.56	□□□□□ -1.68
JEN1	YKL217W	UGA3	P26370	528 aa		4.56	□□□□□ -1.68
JEN1	YKL217W	YBR287W	P38355	427 aa		4.56	□□□□□ -1.68
JEN1	YKL217W	RTT109	Q07794	436 aa		4.56	□□□□□ -1.68
JEN1	YKL217W	YPR204W	Q08995	1032 aa		4.56	□□□□□ -1.68
JEN1	YKL217W	GRX6	Q12438	231 aa		4.56	□□□□□ -1.68
JEN1	YKL217W	HKR1	P41809	1802 aa		4.56	□□□□□ -1.68
JEN1	YKL217W	COQ4	O13525	335 aa		4.56	□□□□□ -1.68
JEN1	YKL217W	RPS9B	P05755	195 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
JEN1	YKL217W	NUP42	P49686	430 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
JEN1	YKL217W	YNL050C	P53952	270 aa		4.56	□□□□□ -1.68
JEN1	YKL217W	NSE3	Q05541	303 aa		4.56	□□□□□ -1.68
JEN1	YKL217W	DPL1	Q05567	589 aa		4.56	□□□□□ -1.68
JEN1	YKL217W	YIL089W	P40500	205 aa		4.55	□□□□□ -1.68
JEN1	YKL217W	HEF3	P53978	1044 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
JEN1	YKL217W	UBP16	Q02863	499 aa		4.55	□□□□□ -1.68
JEN1	YKL217W	PBS2	P08018	668 aa		4.54	□□□□□ -1.68
JEN1	YKL217W	GEF1	P37020	779 aa		4.54	□□□□□ -1.68
JEN1	YKL217W	VPS4	P52917	437 aa		4.54	□□□□□ -1.68
JEN1	YKL217W	TRM44	Q02648	567 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
JEN1	YKL217W	SYF1	Q04048	859 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
JEN1	YKL217W	HAT1	Q12341	374 aa		4.54	□□□□□ -1.68
JEN1	YKL217W	DIT2	P21595	489 aa		4.54	□□□□□ -1.68
JEN1	YKL217W	SET4	P42948	560 aa		4.54	□□□□□ -1.68
JEN1	YKL217W	ZDS1	P50111	915 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
JEN1	YKL217W	YDL144C	Q07589	356 aa		4.54	□□□□□ -1.68
JEN1	YKL217W	FCP1	Q03254	732 aa		4.53	□□□□□ -1.68
JEN1	YKL217W	PKH1	Q03407	766 aa		4.53	□□□□□ -1.68
JEN1	YKL217W	BMS1	Q08965	1183 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
JEN1	YKL217W	DUR1,2	P32528	1835 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
JEN1	YKL217W	LYS2	P07702	1392 aa		4.53	□□□□□ -1.68
JEN1	YKL217W	HPR1	P17629	752 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
JEN1	YKL217W	TPD3	P31383	635 aa		4.52	□□□□□ -1.69
JEN1	YKL217W	AFG2	P32794	780 aa		4.52	□□□□□ -1.69
JEN1	YKL217W	PAM1	P37304	830 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
JEN1	YKL217W	PEA2	P40091	420 aa		4.52	□□□□□ -1.69
JEN1	YKL217W	YGR117C	P53270	476 aa		4.52	□□□□□ -1.69
JEN1	YKL217W	TIM50	Q02776	476 aa		4.52	□□□□□ -1.69
JEN1	YKL217W	GAS5	Q08193	484 aa		4.52	□□□□□ -1.69
JEN1	YKL217W	STV1	P37296	890 aa		4.52	□□□□□ -1.69
JEN1	YKL217W	MAL31	P38156	614 aa		4.52	□□□□□ -1.69
JEN1	YKL217W	FIG2	P25653	1609 aa		4.51	□□□□□ -1.69
JEN1	YKL217W	SUI2	P20459	304 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
JEN1	YKL217W	PNT1	P38969	423 aa		4.51	□□□□□ -1.69
JEN1	YKL217W	GSM1	P42950	618 aa		4.51	□□□□□ -1.69
JEN1	YKL217W	EMP47	P43555	445 aa		4.51	□□□□□ -1.69
JEN1	YKL217W	YGR122W	P53272	402 aa		4.51	□□□□□ -1.69
JEN1	YKL217W	CWC15	Q03772	175 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
JEN1	YKL217W	TOR1	P35169	2470 aa		4.5	□□□□□ -1.69
JEN1	YKL217W	SWI1	P09547	1314 aa		4.5	□□□□□ -1.69
JEN1	YKL217W	AI2	P03876	854 aa		4.5	□□□□□ -1.69
JEN1	YKL217W	NSR1	P27476	414 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.5	□□□□□ -1.69	not detected
JEN1	YKL217W	TIF4632	P39936	914 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
JEN1	YKL217W	ATG36	P46983	293 aa		4.5	□□□□□ -1.69
JEN1	YKL217W	TRP5	P00931	707 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
JEN1	YKL217W	PKC1	P24583	1151 aa		4.49	□□□□□ -1.69
JEN1	YKL217W	KRE2	P27809	442 aa		4.49	□□□□□ -1.69
JEN1	YKL217W	MAM1	P40065	302 aa		4.49	□□□□□ -1.69
JEN1	YKL217W	GYP7	P48365	746 aa		4.49	□□□□□ -1.69
JEN1	YKL217W	SEN54	Q02825	467 aa	Predicted RBP	4.49	□□□□□ -1.69
JEN1	YKL217W	SRT1	Q03175	343 aa		4.49	□□□□□ -1.69

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 30.2 ms