RNA–Protein interactions for RNA: YKL050C

YKL050C, Transcript of Protein of unknown function, yeast

Gene YKL050C, Length 2,769 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YKL050C	YKL050C	YHR219W	P38900	624 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YKL050C	YKL050C	YLR326W	Q06170	240 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YKL050C	YKL050C	YEL077C	Q3E7X8	1277 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YKL050C	YKL050C	MPE1	P35728	441 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YKL050C	YKL050C	TGL4	P36165	910 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YKL050C	YKL050C	APP1	P53933	587 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YKL050C	YKL050C	GRE2	Q12068	342 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YKL050C	YKL050C	STB3	Q12427	513 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YKL050C	YKL050C	IML1	P47170	1584 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YKL050C	YKL050C	CLB5	P30283	435 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YKL050C	YKL050C	IOC3	P43596	787 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YKL050C	YKL050C	YGR161W-C	Q3E744	92 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YKL050C	YKL050C	SUP45	P12385	437 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YKL050C	YKL050C	MGE1	P38523	228 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YKL050C	YKL050C	VAC8	P39968	578 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YKL050C	YKL050C	YJL049W	P47048	450 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YKL050C	YKL050C	SLX5	P32828	619 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
YKL050C	YKL050C	ENO1	P00924	437 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
YKL050C	YKL050C	GRX7	P38068	203 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YKL050C	YKL050C	POL5	P39985	1022 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
YKL050C	YKL050C	CWC22	P53333	577 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
YKL050C	YKL050C	RPN4	Q03465	531 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YKL050C	YKL050C	RAD59	Q12223	238 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YKL050C	YKL050C	NKP1	Q12493	238 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YKL050C	YKL050C	ESF2	P53743	316 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
YKL050C	YKL050C	VMR1	P38735	1592 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YKL050C	YKL050C	DPB3	P27344	201 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YKL050C	YKL050C	IES1	P43579	692 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YKL050C	YKL050C	DNM1	P54861	757 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YKL050C	YKL050C	KAR5	Q04746	504 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YKL050C	YKL050C	MMP1	Q12372	583 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YKL050C	YKL050C	ARG8	P18544	423 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YKL050C	YKL050C	GUT1	P32190	709 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YKL050C	YKL050C	YJR107W	P47145	328 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YKL050C	YKL050C	ALD3	P54114	506 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YKL050C	YKL050C	NSE3	Q05541	303 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YKL050C	YKL050C	COG4	Q06096	861 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YKL050C	YKL050C	PIB1	Q06651	286 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YKL050C	YKL050C	WHI5	Q12416	295 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YKL050C	YKL050C	STI1	P15705	589 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.53	□□□□□ -1.68	not detected
YKL050C	YKL050C	PWP2	P25635	923 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
YKL050C	YKL050C	UTP14	Q04500	899 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
YKL050C	YKL050C	MRX10	Q05648	414 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YKL050C	YKL050C	RLP24	Q07915	199 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
YKL050C	YKL050C	TRL1	P09880	827 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
YKL050C	YKL050C	SSD1	P24276	1250 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.53	□□□□□ -1.68	not detected
YKL050C	YKL050C	SEC6	P32844	805 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YKL050C	YKL050C	GRS1	P38088	690 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
YKL050C	YKL050C	MAP2	P38174	421 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
YKL050C	YKL050C	SPT5	P27692	1063 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
YKL050C	YKL050C	VPS24	P36095	224 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
YKL050C	YKL050C	MET1	P36150	593 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YKL050C	YKL050C	MPP10	P47083	593 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
YKL050C	YKL050C	ALD6	P54115	500 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
YKL050C	YKL050C	ESS1	P22696	170 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YKL050C	YKL050C	MNN1	P39106	762 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YKL050C	YKL050C	MDJ2	P42834	146 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YKL050C	YKL050C	YGR273C	P53329	174 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YKL050C	YKL050C	UBP10	P53874	792 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
YKL050C	YKL050C	YOR131C	Q12486	218 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YKL050C	YKL050C	ENO2	P00925	437 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
YKL050C	YKL050C	PCS60	P38137	543 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.51	□□□□□ -1.69	not detected
YKL050C	YKL050C	VMS1	Q04311	632 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
YKL050C	YKL050C	BCK1	Q01389	1478 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YKL050C	YKL050C	BUD31	P25337	157 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
YKL050C	YKL050C	BUD6	P41697	788 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YKL050C	YKL050C	HST2	P53686	357 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YKL050C	YKL050C	ENT2	Q05785	613 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YKL050C	YKL050C	RPP1B	P10622	106 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
YKL050C	YKL050C	ORC6	P38826	435 aa		4.5	□□□□□ -1.69
YKL050C	YKL050C	MAD1	P40957	749 aa		4.5	□□□□□ -1.69
YKL050C	YKL050C	YJR142W	P47173	342 aa		4.5	□□□□□ -1.69
YKL050C	YKL050C	RIM21	P48565	533 aa		4.5	□□□□□ -1.69
YKL050C	YKL050C	FPK1	P53739	893 aa		4.5	□□□□□ -1.69
YKL050C	YKL050C	CDC53	Q12018	815 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
YKL050C	YKL050C	WRS1	Q12109	432 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
YKL050C	YKL050C	SSF2	Q12153	453 aa	Predicted RBP	4.5	□□□□□ -1.69
YKL050C	YKL050C	BLI1	P35727	113 aa		4.5	□□□□□ -1.69
YKL050C	YKL050C	PBP2	P38151	413 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.5	□□□□□ -1.69	not detected
YKL050C	YKL050C	ENP1	P38333	483 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
YKL050C	YKL050C	UBP12	P39538	1254 aa		4.5	□□□□□ -1.69
YKL050C	YKL050C	MSH4	P40965	878 aa	Predicted RBP	4.5	□□□□□ -1.69
YKL050C	YKL050C	ECM23	Q02710	187 aa		4.5	□□□□□ -1.69
YKL050C	YKL050C	MNL2	Q12205	849 aa		4.5	□□□□□ -1.69
YKL050C	YKL050C	THS1	P04801	734 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
YKL050C	YKL050C	MET6	P05694	767 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
YKL050C	YKL050C	VMA1	P17255	1071 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
YKL050C	YKL050C	RPN12	P32496	274 aa		4.49	□□□□□ -1.69
YKL050C	YKL050C	FUI1	P38196	639 aa		4.49	□□□□□ -1.69
YKL050C	YKL050C	KTR7	P40504	517 aa		4.49	□□□□□ -1.69
YKL050C	YKL050C	EBP2	P36049	427 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
YKL050C	YKL050C	ITC1	P53125	1264 aa		4.49	□□□□□ -1.69
YKL050C	YKL050C	NIS1	P53939	407 aa		4.49	□□□□□ -1.69
YKL050C	YKL050C	CLN2	P20438	545 aa		4.48	□□□□□ -1.69
YKL050C	YKL050C	TRX2	P22803	104 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
YKL050C	YKL050C	VPS16	Q03308	798 aa		4.48	□□□□□ -1.69
YKL050C	YKL050C	PIN2	Q12057	282 aa		4.48	□□□□□ -1.69
YKL050C	YKL050C	ERP4	Q12450	207 aa		4.48	□□□□□ -1.69
YKL050C	YKL050C	RGR1	P19263	1082 aa		4.48	□□□□□ -1.69
YKL050C	YKL050C	SCJ1	P25303	377 aa		4.48	□□□□□ -1.69

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