RNA–Protein interactions for RNA: YER103W

SSA4, Transcript of Heat shock protein that is highly induced upon stress, yeastyeast

Gene SSA4, Length 1,929 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSA4YER103W NUG1P40010 520 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
SSA4YER103W BMS1Q08965 1183 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
SSA4YER103W TRS33Q99394 268 aa14.74□□□□□ -0.05
SSA4YER103W FRS2P15625 503 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
SSA4YER103W MBR1P23493 339 aa14.74□□□□□ -0.05
SSA4YER103W RNT1Q02555 471 aa14.74□□□□□ -0.05
SSA4YER103W RPS24AP0CX31 135 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
SSA4YER103W RPS24BP0CX32 135 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
SSA4YER103W MED8P38304 223 aa14.72□□□□□ -0.05
SSA4YER103W PRX1P34227 261 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
SSA4YER103W ECM1P39715 212 aa14.72□□□□□ -0.05
SSA4YER103W DSN1P40568 576 aa14.72□□□□□ -0.05
SSA4YER103W RIA1P53893 1110 aa14.72□□□□□ -0.05
SSA4YER103W PEX14P53112 341 aa14.71□□□□□ -0.05
SSA4YER103W YGR122WP53272 402 aa14.71□□□□□ -0.05
SSA4YER103W NOP8Q08287 484 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
SSA4YER103W COQ4O13525 335 aa14.7□□□□□ -0.06
SSA4YER103W MRS2Q01926 470 aa14.7□□□□□ -0.06
SSA4YER103W MRC1P25588 1096 aa14.69□□□□□ -0.06
SSA4YER103W SGD1Q06132 899 aa14.69□□□□□ -0.06
SSA4YER103W MSB4Q12317 492 aa14.69□□□□□ -0.06
SSA4YER103W PRP31P49704 494 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
SSA4YER103W AIM9P40053 627 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
SSA4YER103W JSN1P47135 1091 aaKnown RBP RIP-Chip data14.66□□□□□ -0.06not detected
SSA4YER103W YRF1-2P40105 1681 aa14.66□□□□□ -0.06
SSA4YER103W RPS0BP46654 252 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
SSA4YER103W YGL140CP53120 1219 aa14.66□□□□□ -0.06
SSA4YER103W YGL082WP53155 381 aa14.66□□□□□ -0.06
SSA4YER103W SML1Q04964 104 aa14.66□□□□□ -0.06
SSA4YER103W SPC110P32380 944 aa14.65□□□□□ -0.06
SSA4YER103W SWE1P32944 819 aa14.65□□□□□ -0.06
SSA4YER103W RRP5Q05022 1729 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SSA4YER103W AAP1P37898 856 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SSA4YER103W PRP43P53131 767 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SSA4YER103W RIM20Q12033 661 aa14.64□□□□□ -0.07
SSA4YER103W TTI1P36097 1038 aa14.64□□□□□ -0.07
SSA4YER103W HGH1P48362 394 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SSA4YER103W YOL087CQ99247 1116 aa14.64□□□□□ -0.07
SSA4YER103W PET111P08468 800 aa14.63□□□□□ -0.07
SSA4YER103W CTH1P47976 325 aa14.63□□□□□ -0.07
SSA4YER103W CTF18P49956 741 aa14.63□□□□□ -0.07
SSA4YER103W RMD1Q03441 430 aa14.63□□□□□ -0.07
SSA4YER103W DDP1Q99321 188 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SSA4YER103W BOI2P39969 1040 aa14.62□□□□□ -0.07
SSA4YER103W COG4Q06096 861 aa14.62□□□□□ -0.07
SSA4YER103W TSR3Q12094 313 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
SSA4YER103W VPS41P38959 992 aa14.62□□□□□ -0.07
SSA4YER103W ENV11P53246 860 aa14.62□□□□□ -0.07
SSA4YER103W TLG2Q08144 397 aa14.62□□□□□ -0.07
SSA4YER103W YKL068W-AQ3E826 78 aa14.62□□□□□ -0.07
SSA4YER103W MSH1P25846 959 aa14.61□□□□□ -0.07
SSA4YER103W YMR102CQ03177 834 aa14.61□□□□□ -0.07
SSA4YER103W ADE6P38972 1358 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
SSA4YER103W RTT107P38850 1070 aa14.6□□□□□ -0.07
SSA4YER103W SWC3P31376 625 aa14.6□□□□□ -0.07
SSA4YER103W CPA2P03965 1118 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SSA4YER103W HSP104P31539 908 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.07
SSA4YER103W MRP7P12687 371 aa14.58□□□□□ -0.08
SSA4YER103W RDS1P25611 832 aa14.58□□□□□ -0.08
SSA4YER103W SRC1Q03707 834 aa14.58□□□□□ -0.08
SSA4YER103W GDT1P38301 280 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
SSA4YER103W ENT3P47160 408 aa14.57□□□□□ -0.08
SSA4YER103W GIN4Q12263 1142 aa14.57□□□□□ -0.08
SSA4YER103W YIL177CP40434 1758 aa14.57□□□□□ -0.08
SSA4YER103W YJL225CP40889 1758 aa14.57□□□□□ -0.08
SSA4YER103W GPA1P08539 472 aa14.56□□□□□ -0.08
SSA4YER103W TPM1P17536 199 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
SSA4YER103W ECM21P38167 1117 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
SSA4YER103W AOS1Q06624 347 aa14.56□□□□□ -0.08
SSA4YER103W YOL057WQ08225 711 aa14.56□□□□□ -0.08
SSA4YER103W CTI6Q08923 506 aa14.56□□□□□ -0.08
SSA4YER103W RRM3P38766 723 aa14.55□□□□□ -0.08
SSA4YER103W YER130CP39959 443 aa14.54□□□□□ -0.08
SSA4YER103W FYV10P40492 516 aa14.54□□□□□ -0.08
SSA4YER103W PDR18P53756 1333 aa14.54□□□□□ -0.08
SSA4YER103W OSW7P43611 510 aa14.54□□□□□ -0.08
SSA4YER103W YPL150WQ12152 901 aa14.54□□□□□ -0.08
SSA4YER103W MVP1P40959 511 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
SSA4YER103W ELG1Q12050 791 aa14.53□□□□□ -0.08
SSA4YER103W URB1P34241 1764 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
SSA4YER103W SPO22P40511 975 aa14.53□□□□□ -0.08
SSA4YER103W MRPS35P53292 345 aa14.53□□□□□ -0.08
SSA4YER103W VMS1Q04311 632 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
SSA4YER103W NSE3Q05541 303 aa14.53□□□□□ -0.08
SSA4YER103W BRE1Q07457 700 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
SSA4YER103W WAR1Q03631 944 aa14.51□□□□□ -0.09
SSA4YER103W YDR306CQ06640 478 aa14.51□□□□□ -0.09
SSA4YER103W PSH1Q12161 406 aa14.51□□□□□ -0.09
SSA4YER103W TFC8Q12308 588 aa14.51□□□□□ -0.09
SSA4YER103W NCB2Q92317 146 aa14.51□□□□□ -0.09
SSA4YER103W PET123P17558 318 aa14.51□□□□□ -0.09
SSA4YER103W BBC1P47068 1157 aa14.51□□□□□ -0.09
SSA4YER103W GYL1Q04322 720 aa14.51□□□□□ -0.09
SSA4YER103W MAL33P38157 468 aa14.5□□□□□ -0.09
SSA4YER103W RPN7Q06103 429 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
SSA4YER103W RAD4P14736 754 aa14.49□□□□□ -0.09
SSA4YER103W UGA3P26370 528 aa14.49□□□□□ -0.09
SSA4YER103W MSH4P40965 878 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
SSA4YER103W TFG2P41896 400 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
SSA4YER103W YPT11P48559 417 aa14.49□□□□□ -0.09
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