RNA–Protein interactions for RNA: Q0143

Q0143, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene Q0143, Length 153 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
Q0143	Q0143	WTM2	Q12206	467 aa		5.13	□□□□□ -1.59
Q0143	Q0143	ARG8	P18544	423 aa		5.12	□□□□□ -1.59
Q0143	Q0143	TY1A-DR2	Q03964	440 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
Q0143	Q0143	MED7	Q08278	222 aa		5.12	□□□□□ -1.59
Q0143	Q0143	FRA1	Q07825	749 aa		5.11	□□□□□ -1.59
Q0143	Q0143	UBP5	P39944	805 aa		5.1	□□□□□ -1.59
Q0143	Q0143	STB3	Q12427	513 aa		5.1	□□□□□ -1.59
Q0143	Q0143	ALA1	P40825	983 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
Q0143	Q0143	PKH3	Q03306	898 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
Q0143	Q0143	DAT1	P13483	248 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
Q0143	Q0143	IRE1	P32361	1115 aa		5.08	□□□□□ -1.6
Q0143	Q0143	YKR073C	P36153	106 aa		5.08	□□□□□ -1.6
Q0143	Q0143	NHA1	Q99271	985 aa		5.08	□□□□□ -1.6
Q0143	Q0143	TRP3	P00937	484 aa		5.07	□□□□□ -1.6
Q0143	Q0143	PGM1	P33401	570 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
Q0143	Q0143	GUT2	P32191	649 aa		5.05	□□□□□ -1.6
Q0143	Q0143	UTP7	P40055	554 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
Q0143	Q0143	SPR3	P41901	512 aa		5.05	□□□□□ -1.6
Q0143	Q0143	JJJ2	P46997	583 aa		5.05	□□□□□ -1.6
Q0143	Q0143	KAE1	P36132	386 aa		5.04	□□□□□ -1.6
Q0143	Q0143	AI3	P03877	415 aa		5.03	□□□□□ -1.6
Q0143	Q0143	ALG14	P38242	237 aa		5.03	□□□□□ -1.6
Q0143	Q0143	TOS1	P38288	455 aa		5.03	□□□□□ -1.6
Q0143	Q0143	COQ2	P32378	372 aa		5.02	□□□□□ -1.61
Q0143	Q0143	PUB1	P32588	453 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.02	□□□□□ -1.61	not detected
Q0143	Q0143	PGM2	P37012	569 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
Q0143	Q0143	SAC7	P17121	654 aa		5.01	□□□□□ -1.61
Q0143	Q0143	CTH1	P47976	325 aa		5.01	□□□□□ -1.61
Q0143	Q0143	PSH1	Q12161	406 aa		5.01	□□□□□ -1.61
Q0143	Q0143	UTR2	P32623	467 aa		5	□□□□□ -1.61
Q0143	Q0143	YKL222C	P35995	705 aa		5	□□□□□ -1.61
Q0143	Q0143	SHM1	P37292	490 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
Q0143	Q0143	PDC6	P26263	563 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
Q0143	Q0143	BRE4	Q07660	1125 aa		4.99	□□□□□ -1.61
Q0143	Q0143	SPT2	P06843	333 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
Q0143	Q0143	TBS1	P38114	1094 aa		4.98	□□□□□ -1.61
Q0143	Q0143	SUM1	P46676	1062 aa		4.98	□□□□□ -1.61
Q0143	Q0143	ARI1	P53111	347 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
Q0143	Q0143	GAS5	Q08193	484 aa		4.98	□□□□□ -1.61
Q0143	Q0143	RNQ1	P25367	405 aa		4.97	□□□□□ -1.61
Q0143	Q0143	MSC7	P38694	644 aa		4.97	□□□□□ -1.61
Q0143	Q0143	ATF2	P53296	535 aa		4.97	□□□□□ -1.61
Q0143	Q0143	YCR015C	P25616	317 aa		4.96	□□□□□ -1.62
Q0143	Q0143	STE20	Q03497	939 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
Q0143	Q0143	YLR122C	Q12312	125 aa		4.96	□□□□□ -1.62
Q0143	Q0143	NAB2	P32505	525 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.95	□□□□□ -1.62	not detected
Q0143	Q0143	ISR1	Q06098	443 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
Q0143	Q0143	RPP1A	P05318	106 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
Q0143	Q0143	KTR1	P27810	393 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
Q0143	Q0143	RRM3	P38766	723 aa		4.92	□□□□□ -1.62
Q0143	Q0143	YGR130C	P53278	816 aa		4.91	□□□□□ -1.62
Q0143	Q0143	SFA1	P32771	386 aa		4.89	□□□□□ -1.63
Q0143	Q0143	NAR1	P23503	491 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
Q0143	Q0143	SPB4	P25808	606 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
Q0143	Q0143	MAG2	Q06436	670 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
Q0143	Q0143	RAD59	Q12223	238 aa		4.88	□□□□□ -1.63
Q0143	Q0143	RPS31	P05759	152 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
Q0143	Q0143	CHS2	P14180	963 aa		4.86	□□□□□ -1.63
Q0143	Q0143	GIS4	Q04233	774 aa		4.86	□□□□□ -1.63
Q0143	Q0143	LEU1	P07264	779 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
Q0143	Q0143	SAF1	P38352	637 aa		4.84	□□□□□ -1.63
Q0143	Q0143	RGP1	P16664	663 aa		4.83	□□□□□ -1.64
Q0143	Q0143	MCM16	Q12262	181 aa		4.83	□□□□□ -1.64
Q0143	Q0143	CYC7	P00045	113 aa		4.82	□□□□□ -1.64
Q0143	Q0143	RSC6	P25632	483 aa		4.82	□□□□□ -1.64
Q0143	Q0143	NGR1	P32831	672 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
Q0143	Q0143	SLX8	P40072	274 aa		4.82	□□□□□ -1.64
Q0143	Q0143	HEH2	Q03281	663 aa		4.82	□□□□□ -1.64
Q0143	Q0143	MAK16	P10962	306 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
Q0143	Q0143	PRK1	P40494	810 aa		4.81	□□□□□ -1.64
Q0143	Q0143	SEG2	P34250	1132 aa		4.8	□□□□□ -1.64
Q0143	Q0143	ALD2	P47771	506 aa		4.8	□□□□□ -1.64
Q0143	Q0143	ESC8	Q08119	714 aa		4.8	□□□□□ -1.64
Q0143	Q0143	HAL5	P38970	855 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
Q0143	Q0143	NIT1	P40447	199 aa		4.78	□□□□□ -1.64
Q0143	Q0143	MRX12	P47084	519 aa		4.77	□□□□□ -1.65
Q0143	Q0143	CSN12	P47130	423 aa		4.77	□□□□□ -1.65
Q0143	Q0143	SPO74	P45819	413 aa		4.76	□□□□□ -1.65
Q0143	Q0143	APL6	P46682	809 aa		4.76	□□□□□ -1.65
Q0143	Q0143	EMP47	P43555	445 aa		4.75	□□□□□ -1.65
Q0143	Q0143	TAF1	P46677	1066 aa		4.75	□□□□□ -1.65
Q0143	Q0143	AKR1	P39010	764 aa		4.74	□□□□□ -1.65
Q0143	Q0143	GIP4	P39732	760 aa		4.74	□□□□□ -1.65
Q0143	Q0143	YTA6	P40328	754 aa		4.74	□□□□□ -1.65
Q0143	Q0143	NAM7	P30771	971 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
Q0143	Q0143	LRG1	P35688	1017 aa		4.73	□□□□□ -1.65
Q0143	Q0143	ISF1	P32488	338 aa		4.72	□□□□□ -1.65
Q0143	Q0143	HPC2	Q01448	625 aa		4.72	□□□□□ -1.65
Q0143	Q0143	HDA3	Q06623	655 aa		4.72	□□□□□ -1.65
Q0143	Q0143	PUF3	Q07807	879 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.72	□□□□□ -1.65	not detected
Q0143	Q0143	YPQ2	Q06328	317 aa		4.7	□□□□□ -1.66
Q0143	Q0143	PRP43	P53131	767 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
Q0143	Q0143	YNL165W	P53891	406 aa		4.69	□□□□□ -1.66
Q0143	Q0143	NCL1	P38205	684 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
Q0143	Q0143	ECL1	P48235	211 aa		4.68	□□□□□ -1.66
Q0143	Q0143	GLC3	P32775	704 aa		4.67	□□□□□ -1.66
Q0143	Q0143	POL12	P38121	705 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
Q0143	Q0143	SEA4	P38164	1038 aa		4.67	□□□□□ -1.66
Q0143	Q0143	TFB3	Q03290	321 aa		4.66	□□□□□ -1.66
Q0143	Q0143	TY1A-NL1	Q12391	440 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 73.2 ms