RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640511.1

SPIN3-241, Transcript of spindlin family member 3, humanhuman

TSL 5

Gene SPIN3, Length 3,102 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN3-241ENST00000640511 FMN1Q68DA7 1419 aa14.75□□□□□ -0.05
SPIN3-241ENST00000640511 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
SPIN3-241ENST00000640511 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
SPIN3-241ENST00000640511 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa14.74□□□□□ -0.05
SPIN3-241ENST00000640511 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
SPIN3-241ENST00000640511 NLRP1Q9C000 1473 aa14.74□□□□□ -0.05
SPIN3-241ENST00000640511 ATP2B3Q16720 1220 aa14.74□□□□□ -0.05
SPIN3-241ENST00000640511 KCNG1Q9UIX4 513 aa14.74□□□□□ -0.05
SPIN3-241ENST00000640511 IGSF3O75054 1194 aa14.73□□□□□ -0.05
SPIN3-241ENST00000640511 KCNJ4P48050 445 aa14.73□□□□□ -0.05
SPIN3-241ENST00000640511 SLC20A2Q08357 652 aa14.73□□□□□ -0.05
SPIN3-241ENST00000640511 NBPF8Q3BBV2 869 aa14.73□□□□□ -0.05
SPIN3-241ENST00000640511 PTMSP20962 102 aa14.73□□□□□ -0.05
SPIN3-241ENST00000640511 RALBP1Q15311 655 aa14.72□□□□□ -0.05
SPIN3-241ENST00000640511 CNPY4Q8N129 248 aa14.72□□□□□ -0.05
SPIN3-241ENST00000640511 PTPN23Q9H3S7 1636 aa14.72□□□□□ -0.05
SPIN3-241ENST00000640511 FHOD3Q2V2M9 1422 aa14.72□□□□□ -0.05
SPIN3-241ENST00000640511 KIF15Q9NS87 1388 aa14.71□□□□□ -0.05
SPIN3-241ENST00000640511 MCM5P33992 734 aa14.71□□□□□ -0.05
SPIN3-241ENST00000640511 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
SPIN3-241ENST00000640511 GBP4Q96PP9 640 aa14.71□□□□□ -0.05
SPIN3-241ENST00000640511 IQGAP2Q13576 1575 aa14.71□□□□□ -0.05
SPIN3-241ENST00000640511 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa14.7□□□□□ -0.06
SPIN3-241ENST00000640511 PANK3Q9H999 370 aa14.7□□□□□ -0.06
SPIN3-241ENST00000640511 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
SPIN3-241ENST00000640511 NAIPQ13075 1403 aa14.7□□□□□ -0.06
SPIN3-241ENST00000640511 MIA2Q96PC5 1412 aa14.7□□□□□ -0.06
SPIN3-241ENST00000640511 HDAC5Q9UQL6 1122 aa14.7□□□□□ -0.06
SPIN3-241ENST00000640511 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
SPIN3-241ENST00000640511 MYRIPQ8NFW9 859 aa14.69□□□□□ -0.06
SPIN3-241ENST00000640511 SLC52A1Q9NWF4 448 aa14.68□□□□□ -0.06
SPIN3-241ENST00000640511 MMP14P50281 582 aa14.68□□□□□ -0.06
SPIN3-241ENST00000640511 ZNF710Q8N1W2 664 aa14.68□□□□□ -0.06
SPIN3-241ENST00000640511 EFCAB5A4FU69 1503 aa14.67□□□□□ -0.06
SPIN3-241ENST00000640511 SPDYE4A6NLX3 237 aa14.67□□□□□ -0.06
SPIN3-241ENST00000640511 WWC1Q8IX03 1113 aa14.67□□□□□ -0.06
SPIN3-241ENST00000640511 CHD1O14646 1710 aa14.66□□□□□ -0.06
SPIN3-241ENST00000640511 NBPF1Q3BBV0 1214 aa14.66□□□□□ -0.06
SPIN3-241ENST00000640511 NLRP13Q86W25 1043 aa14.66□□□□□ -0.06
SPIN3-241ENST00000640511 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SPIN3-241ENST00000640511 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
SPIN3-241ENST00000640511 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa14.65□□□□□ -0.06
SPIN3-241ENST00000640511 PTPRKQ15262 1439 aa14.65□□□□□ -0.06
SPIN3-241ENST00000640511 CEP170Q5SW79 1584 aa14.65□□□□□ -0.06
SPIN3-241ENST00000640511 NGEFQ8N5V2 710 aa14.65□□□□□ -0.06
SPIN3-241ENST00000640511 CLGNO14967 610 aa14.65□□□□□ -0.06
SPIN3-241ENST00000640511 TSC1Q92574 1164 aa14.65□□□□□ -0.06
SPIN3-241ENST00000640511 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SPIN3-241ENST00000640511 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SPIN3-241ENST00000640511 APPP05067 770 aa14.64□□□□□ -0.07
SPIN3-241ENST00000640511 HSCBQ8IWL3 235 aa14.64□□□□□ -0.07
SPIN3-241ENST00000640511 HOMEZQ8IX15 550 aa14.64□□□□□ -0.07
SPIN3-241ENST00000640511 ZBTB9Q96C00 473 aa14.64□□□□□ -0.07
SPIN3-241ENST00000640511 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SPIN3-241ENST00000640511 IGHDP01880 384 aa14.64□□□□□ -0.07
SPIN3-241ENST00000640511 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SPIN3-241ENST00000640511 CHMP4CQ96CF2 233 aa14.64□□□□□ -0.07
SPIN3-241ENST00000640511 PDLIM2Q96JY6 352 aa14.64□□□□□ -0.07
SPIN3-241ENST00000640511 FGD6Q6ZV73 1430 aa14.64□□□□□ -0.07
SPIN3-241ENST00000640511 PRIMPOLQ96LW4 560 aa14.63□□□□□ -0.07
SPIN3-241ENST00000640511 PSEN1P49768 467 aa14.62□□□□□ -0.07
SPIN3-241ENST00000640511 SOX12O15370 315 aa14.62□□□□□ -0.07
SPIN3-241ENST00000640511 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
SPIN3-241ENST00000640511 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa14.61□□□□□ -0.07
SPIN3-241ENST00000640511 TRIM34Q9BYJ4 488 aa14.61□□□□□ -0.07
SPIN3-241ENST00000640511 RBM25P49756 843 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
SPIN3-241ENST00000640511 CCDC39Q9UFE4 941 aa14.61□□□□□ -0.07
SPIN3-241ENST00000640511 GOLGA6L22H0YM25 854 aa14.61□□□□□ -0.07
SPIN3-241ENST00000640511 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
SPIN3-241ENST00000640511 CCDC66A2RUB6 948 aa14.6□□□□□ -0.07
SPIN3-241ENST00000640511 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP14.6□□□□□ -0.07
SPIN3-241ENST00000640511 JPH4Q96JJ6 628 aa14.6□□□□□ -0.07
SPIN3-241ENST00000640511 SAMD9Q5K651 1589 aa14.6□□□□□ -0.07
SPIN3-241ENST00000640511 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP14.6□□□□□ -0.07
SPIN3-241ENST00000640511 PDCL2Q8N4E4 241 aa14.6□□□□□ -0.07
SPIN3-241ENST00000640511 MPHOSPH9Q99550 1183 aa14.6□□□□□ -0.07
SPIN3-241ENST00000640511 C22orf23Q9BZE7 217 aa14.6□□□□□ -0.07
SPIN3-241ENST00000640511 NUP160Q12769 1436 aa14.59□□□□□ -0.07
SPIN3-241ENST00000640511 KIF3AQ9Y496 699 aa14.59□□□□□ -0.07
SPIN3-241ENST00000640511 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa14.59□□□□□ -0.07
SPIN3-241ENST00000640511 CFAP43Q8NDM7 1665 aa14.59□□□□□ -0.07
SPIN3-241ENST00000640511 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
SPIN3-241ENST00000640511 DDIT3P35638 169 aa14.59□□□□□ -0.07
SPIN3-241ENST00000640511 TIGD1Q96MW7 591 aa14.59□□□□□ -0.07
SPIN3-241ENST00000640511 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SPIN3-241ENST00000640511 USP47Q96K76 1375 aa14.59□□□□□ -0.07
SPIN3-241ENST00000640511 KLHL40Q2TBA0 621 aa14.59□□□□□ -0.07
SPIN3-241ENST00000640511 SCAPERQ9BY12 1400 aa14.58□□□□□ -0.07
SPIN3-241ENST00000640511 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
SPIN3-241ENST00000640511 RAB3GAP1Q15042 981 aa14.58□□□□□ -0.08
SPIN3-241ENST00000640511 ARID3CA6NKF2 412 aa14.58□□□□□ -0.08
SPIN3-241ENST00000640511 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
SPIN3-241ENST00000640511 ZNF445P59923 1031 aa14.57□□□□□ -0.08
SPIN3-241ENST00000640511 KIAA2012Q0VF49 1180 aa14.57□□□□□ -0.08
SPIN3-241ENST00000640511 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa14.57□□□□□ -0.08
SPIN3-241ENST00000640511 CAPN2P17655 700 aa14.57□□□□□ -0.08
SPIN3-241ENST00000640511 INSRP06213 1382 aa14.57□□□□□ -0.08
SPIN3-241ENST00000640511 DUSP27Q5VZP5 1158 aa14.57□□□□□ -0.08
SPIN3-241ENST00000640511 UGGT2Q9NYU1 1516 aa14.57□□□□□ -0.08
SPIN3-241ENST00000640511 FAM193AP78312 1265 aa14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 163.1 ms