RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637223.1

CLN6-218, Transcript of CLN6, transmembrane ER protein, humanhuman

TSL 5

Gene CLN6, Length 652 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6-218ENST00000637223 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa25.23■■□□□ 1.63
CLN6-218ENST00000637223 TMEM2Q9UHN6 1383 aa25.23■■□□□ 1.63
CLN6-218ENST00000637223 ANKLE2Q86XL3 938 aa25.22■■□□□ 1.63
CLN6-218ENST00000637223 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
CLN6-218ENST00000637223 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
CLN6-218ENST00000637223 ARHGAP23Q9P227 1491 aa25.21■■□□□ 1.63
CLN6-218ENST00000637223 SLIT1O75093 1534 aa25.2■■□□□ 1.62
CLN6-218ENST00000637223 CPS1P31327 1500 aa25.19■■□□□ 1.62
CLN6-218ENST00000637223 TXNDC2Q86VQ3 553 aa25.19■■□□□ 1.62
CLN6-218ENST00000637223 LTKP29376 864 aa25.18■■□□□ 1.62
CLN6-218ENST00000637223 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
CLN6-218ENST00000637223 EID1Q9Y6B2 187 aa25.17■■□□□ 1.62
CLN6-218ENST00000637223 RIMS2Q9UQ26 1411 aa25.17■■□□□ 1.62
CLN6-218ENST00000637223 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
CLN6-218ENST00000637223 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
CLN6-218ENST00000637223 MYO5BQ9ULV0 1848 aa25.14■■□□□ 1.62
CLN6-218ENST00000637223 ZFYVE9O95405 1425 aa25.14■■□□□ 1.62
CLN6-218ENST00000637223 NEURL4Q96JN8 1562 aa25.14■■□□□ 1.61
CLN6-218ENST00000637223 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
CLN6-218ENST00000637223 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
CLN6-218ENST00000637223 RGL3Q3MIN7 710 aa25.12■■□□□ 1.61
CLN6-218ENST00000637223 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
CLN6-218ENST00000637223 KIF1BO60333 1816 aa25.11■■□□□ 1.61
CLN6-218ENST00000637223 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa25.11■■□□□ 1.61
CLN6-218ENST00000637223 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
CLN6-218ENST00000637223 HDGFP51858 240 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
CLN6-218ENST00000637223 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP25.1■■□□□ 1.61
CLN6-218ENST00000637223 MED14O60244 1454 aa25.09■■□□□ 1.61
CLN6-218ENST00000637223 BCANQ96GW7 911 aa25.06■■□□□ 1.6
CLN6-218ENST00000637223 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa25.06■■□□□ 1.6
CLN6-218ENST00000637223 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa25.05■■□□□ 1.6
CLN6-218ENST00000637223 ALKQ9UM73 1620 aa25.04■■□□□ 1.6
CLN6-218ENST00000637223 SIN3AQ96ST3 1273 aa25.04■■□□□ 1.6
CLN6-218ENST00000637223 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa25.03■■□□□ 1.6
CLN6-218ENST00000637223 IQGAP1P46940 1657 aa25.02■■□□□ 1.6
CLN6-218ENST00000637223 NEUROD1Q13562 356 aa25■■□□□ 1.59
CLN6-218ENST00000637223 SLC26A8Q96RN1 970 aa25■■□□□ 1.59
CLN6-218ENST00000637223 VGFO15240 615 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
CLN6-218ENST00000637223 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
CLN6-218ENST00000637223 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa24.95■■□□□ 1.58
CLN6-218ENST00000637223 PPLO60437 1756 aa24.94■■□□□ 1.58
CLN6-218ENST00000637223 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa24.93■■□□□ 1.58
CLN6-218ENST00000637223 LRRC7Q96NW7 1537 aa24.92■■□□□ 1.58
CLN6-218ENST00000637223 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
CLN6-218ENST00000637223 DCAF11Q8TEB1 546 aa24.92■■□□□ 1.58
CLN6-218ENST00000637223 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa24.92■■□□□ 1.58
CLN6-218ENST00000637223 IFT172Q9UG01 1749 aa24.9■■□□□ 1.58
CLN6-218ENST00000637223 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa24.9■■□□□ 1.58
CLN6-218ENST00000637223 TBX22Q9Y458 520 aa24.89■■□□□ 1.58
CLN6-218ENST00000637223 STRCP1A6NGW2 1772 aa24.89■■□□□ 1.57
CLN6-218ENST00000637223 MYOM2P54296 1465 aa24.89■■□□□ 1.57
CLN6-218ENST00000637223 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa24.88■■□□□ 1.57
CLN6-218ENST00000637223 L3MBTL2Q969R5 705 aa24.86■■□□□ 1.57
CLN6-218ENST00000637223 DIP2AQ14689 1571 aa24.85■■□□□ 1.57
CLN6-218ENST00000637223 PIK3C2GO75747 1445 aa24.85■■□□□ 1.57
CLN6-218ENST00000637223 NRXN1Q9ULB1 1477 aa24.83■■□□□ 1.57
CLN6-218ENST00000637223 CLSPNQ9HAW4 1339 aa24.83■■□□□ 1.56
CLN6-218ENST00000637223 METP08581 1390 aa24.82■■□□□ 1.56
CLN6-218ENST00000637223 TONSLQ96HA7 1378 aa24.81■■□□□ 1.56
CLN6-218ENST00000637223 KCNA6P17658 529 aa24.81■■□□□ 1.56
CLN6-218ENST00000637223 STAC3Q96MF2 364 aa24.81■■□□□ 1.56
CLN6-218ENST00000637223 CFAP70Q5T0N1 1121 aa24.79■■□□□ 1.56
CLN6-218ENST00000637223 POTEAQ6S8J7 498 aa24.79■■□□□ 1.56
CLN6-218ENST00000637223 PIK3R4Q99570 1358 aa24.78■■□□□ 1.56
CLN6-218ENST00000637223 PTPRUQ92729 1446 aa24.78■■□□□ 1.56
CLN6-218ENST00000637223 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
CLN6-218ENST00000637223 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa24.76■■□□□ 1.55
CLN6-218ENST00000637223 NWD1Q149M9 1564 aa24.75■■□□□ 1.55
CLN6-218ENST00000637223 TMEM132EQ6IEE7 984 aa24.74■■□□□ 1.55
CLN6-218ENST00000637223 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
CLN6-218ENST00000637223 PRAG1Q86YV5 1406 aa24.73■■□□□ 1.55
CLN6-218ENST00000637223 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa24.71■■□□□ 1.55
CLN6-218ENST00000637223 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
CLN6-218ENST00000637223 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.55
CLN6-218ENST00000637223 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
CLN6-218ENST00000637223 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
CLN6-218ENST00000637223 STK26Q9P289 416 aa24.69■■□□□ 1.54
CLN6-218ENST00000637223 FAM135BQ49AJ0 1406 aa24.69■■□□□ 1.54
CLN6-218ENST00000637223 LAMC1P11047 1609 aa24.68■■□□□ 1.54
CLN6-218ENST00000637223 TMEM94Q12767 1356 aa24.67■■□□□ 1.54
CLN6-218ENST00000637223 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
CLN6-218ENST00000637223 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
CLN6-218ENST00000637223 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
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CLN6-218ENST00000637223 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
CLN6-218ENST00000637223 ADGRB1O14514 1584 aa24.63■■□□□ 1.53
CLN6-218ENST00000637223 NBPF1Q3BBV0 1214 aa24.63■■□□□ 1.53
CLN6-218ENST00000637223 ROBO2Q9HCK4 1378 aa24.63■■□□□ 1.53
CLN6-218ENST00000637223 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa24.61■■□□□ 1.53
CLN6-218ENST00000637223 ABCC11Q96J66 1382 aa24.61■■□□□ 1.53
CLN6-218ENST00000637223 PTCH1Q13635 1447 aa24.61■■□□□ 1.53
CLN6-218ENST00000637223 C14orf37Q86TY3 774 aa24.59■■□□□ 1.53
CLN6-218ENST00000637223 TECPR2O15040 1411 aa24.59■■□□□ 1.53
CLN6-218ENST00000637223 TRAK1Q9UPV9 953 aa24.58■■□□□ 1.53
CLN6-218ENST00000637223 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa24.57■■□□□ 1.52
CLN6-218ENST00000637223 WAPLQ7Z5K2 1190 aa24.56■■□□□ 1.52
CLN6-218ENST00000637223 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
CLN6-218ENST00000637223 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa24.55■■□□□ 1.52
CLN6-218ENST00000637223 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa24.55■■□□□ 1.52
CLN6-218ENST00000637223 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa24.54■■□□□ 1.52
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