RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000594708.1

SMC5-AS1-201, Transcript of SMC5 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SMC5-AS1, Length 1,818 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC5-AS1-201ENST00000594708 LTKP29376 864 aa28.36■■■□□ 2.13
SMC5-AS1-201ENST00000594708 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa28.35■■■□□ 2.13
SMC5-AS1-201ENST00000594708 TXNDC2Q86VQ3 553 aa28.34■■■□□ 2.13
SMC5-AS1-201ENST00000594708 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa28.33■■■□□ 2.13
SMC5-AS1-201ENST00000594708 PPLO60437 1756 aa28.32■■■□□ 2.12
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ANKLE2Q86XL3 938 aa28.32■■■□□ 2.12
SMC5-AS1-201ENST00000594708 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa28.32■■■□□ 2.12
SMC5-AS1-201ENST00000594708 EID1Q9Y6B2 187 aa28.31■■■□□ 2.12
SMC5-AS1-201ENST00000594708 IFT172Q9UG01 1749 aa28.31■■■□□ 2.12
SMC5-AS1-201ENST00000594708 STRCQ7RTU9 1775 aa28.3■■■□□ 2.12
SMC5-AS1-201ENST00000594708 DCAF11Q8TEB1 546 aa28.29■■■□□ 2.12
SMC5-AS1-201ENST00000594708 L3MBTL2Q969R5 705 aa28.29■■■□□ 2.12
SMC5-AS1-201ENST00000594708 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP28.29■■■□□ 2.12
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SMC5-AS1-201ENST00000594708 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP28.29■■■□□ 2.12
SMC5-AS1-201ENST00000594708 HDGFP51858 240 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP28.28■■■□□ 2.12
SMC5-AS1-201ENST00000594708 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
SMC5-AS1-201ENST00000594708 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa28.27■■■□□ 2.12
SMC5-AS1-201ENST00000594708 TONSLQ96HA7 1378 aa28.26■■■□□ 2.11
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa28.24■■■□□ 2.11
SMC5-AS1-201ENST00000594708 VGFO15240 615 aaPredicted RBP28.24■■■□□ 2.11
SMC5-AS1-201ENST00000594708 MED14O60244 1454 aa28.2■■■□□ 2.1
SMC5-AS1-201ENST00000594708 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa28.19■■■□□ 2.1
SMC5-AS1-201ENST00000594708 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP28.19■■■□□ 2.1
SMC5-AS1-201ENST00000594708 MYOM2P54296 1465 aa28.19■■■□□ 2.1
SMC5-AS1-201ENST00000594708 BCANQ96GW7 911 aa28.19■■■□□ 2.1
SMC5-AS1-201ENST00000594708 IQGAP1P46940 1657 aa28.17■■■□□ 2.1
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SMC5-AS1-201ENST00000594708 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa28.14■■■□□ 2.1
SMC5-AS1-201ENST00000594708 STAC3Q96MF2 364 aa28.14■■■□□ 2.1
SMC5-AS1-201ENST00000594708 SLC26A8Q96RN1 970 aa28.13■■■□□ 2.09
SMC5-AS1-201ENST00000594708 PIK3C2GO75747 1445 aa28.13■■■□□ 2.09
SMC5-AS1-201ENST00000594708 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa28.12■■■□□ 2.09
SMC5-AS1-201ENST00000594708 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa28.12■■■□□ 2.09
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa28.11■■■□□ 2.09
SMC5-AS1-201ENST00000594708 PRAG1Q86YV5 1406 aa28.09■■■□□ 2.09
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ALKQ9UM73 1620 aa28.07■■■□□ 2.08
SMC5-AS1-201ENST00000594708 DMRT2Q9Y5R5 561 aa28.07■■■□□ 2.08
SMC5-AS1-201ENST00000594708 NBPF8Q3BBV2 869 aa28.06■■■□□ 2.08
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CFAP70Q5T0N1 1121 aa28.06■■■□□ 2.08
SMC5-AS1-201ENST00000594708 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP28.04■■■□□ 2.08
SMC5-AS1-201ENST00000594708 TBX22Q9Y458 520 aa28.04■■■□□ 2.08
SMC5-AS1-201ENST00000594708 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP28.04■■■□□ 2.08
SMC5-AS1-201ENST00000594708 DIP2AQ14689 1571 aa28.02■■■□□ 2.08
SMC5-AS1-201ENST00000594708 METP08581 1390 aa28.01■■■□□ 2.07
SMC5-AS1-201ENST00000594708 TMEM132EQ6IEE7 984 aa27.99■■■□□ 2.07
SMC5-AS1-201ENST00000594708 LAMC1P11047 1609 aa27.98■■■□□ 2.07
SMC5-AS1-201ENST00000594708 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa27.97■■■□□ 2.07
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SMC5-AS1-201ENST00000594708 NBPF1Q3BBV0 1214 aa27.97■■■□□ 2.07
SMC5-AS1-201ENST00000594708 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa27.96■■■□□ 2.07
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SMC5-AS1-201ENST00000594708 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP27.93■■■□□ 2.06
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP27.93■■■□□ 2.06
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ADGRB1O14514 1584 aa27.93■■■□□ 2.06
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SMC5-AS1-201ENST00000594708 STK26Q9P289 416 aa27.89■■■□□ 2.06
SMC5-AS1-201ENST00000594708 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa27.89■■■□□ 2.06
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP27.89■■■□□ 2.06
SMC5-AS1-201ENST00000594708 KCNA6P17658 529 aa27.88■■■□□ 2.05
SMC5-AS1-201ENST00000594708 RALGAPBQ86X10 1494 aa27.88■■■□□ 2.05
SMC5-AS1-201ENST00000594708 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP27.87■■■□□ 2.05
SMC5-AS1-201ENST00000594708 NWD1Q149M9 1564 aa27.85■■■□□ 2.05
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SMC5-AS1-201ENST00000594708 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP27.84■■■□□ 2.05
SMC5-AS1-201ENST00000594708 TRAK1Q9UPV9 953 aa27.83■■■□□ 2.05
SMC5-AS1-201ENST00000594708 GPRASP1Q5JY77 1395 aa27.82■■■□□ 2.04
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CARD11Q9BXL7 1154 aa27.81■■■□□ 2.04
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ABCC11Q96J66 1382 aa27.8■■■□□ 2.04
SMC5-AS1-201ENST00000594708 KNDC1Q76NI1 1749 aa27.79■■■□□ 2.04
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ROBO2Q9HCK4 1378 aa27.79■■■□□ 2.04
SMC5-AS1-201ENST00000594708 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP27.78■■■□□ 2.04
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP27.78■■■□□ 2.04
SMC5-AS1-201ENST00000594708 LTBP4Q8N2S1 1624 aa27.78■■■□□ 2.04
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SMC5-AS1-201ENST00000594708 CPS1P31327 1500 aa27.75■■■□□ 2.03
SMC5-AS1-201ENST00000594708 WAPLQ7Z5K2 1190 aa27.75■■■□□ 2.03
SMC5-AS1-201ENST00000594708 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP27.75■■■□□ 2.03
SMC5-AS1-201ENST00000594708 PTCH1Q13635 1447 aa27.74■■■□□ 2.03
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP27.73■■■□□ 2.03
SMC5-AS1-201ENST00000594708 PRAM1Q96QH2 718 aa27.72■■■□□ 2.03
SMC5-AS1-201ENST00000594708 DLC1Q96QB1 1528 aa27.72■■■□□ 2.03
SMC5-AS1-201ENST00000594708 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa27.72■■■□□ 2.03
SMC5-AS1-201ENST00000594708 LRRC7Q96NW7 1537 aa27.72■■■□□ 2.03
SMC5-AS1-201ENST00000594708 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP27.7■■■□□ 2.02
SMC5-AS1-201ENST00000594708 TMEM94Q12767 1356 aa27.69■■■□□ 2.02
SMC5-AS1-201ENST00000594708 SIRT1Q96EB6 747 aa27.69■■■□□ 2.02
SMC5-AS1-201ENST00000594708 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP27.69■■■□□ 2.02
SMC5-AS1-201ENST00000594708 FAM135BQ49AJ0 1406 aa27.69■■■□□ 2.02
SMC5-AS1-201ENST00000594708 POGKQ9P215 609 aa27.68■■■□□ 2.02
SMC5-AS1-201ENST00000594708 USP47Q96K76 1375 aa27.66■■■□□ 2.02
SMC5-AS1-201ENST00000594708 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP27.64■■■□□ 2.01
SMC5-AS1-201ENST00000594708 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP27.63■■■□□ 2.01
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP27.62■■■□□ 2.01
SMC5-AS1-201ENST00000594708 C14orf37Q86TY3 774 aa27.62■■■□□ 2.01
SMC5-AS1-201ENST00000594708 NALCNQ8IZF0 1738 aa27.61■■■□□ 2.01
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa27.6■■■□□ 2.01
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