RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590049.5

CAPNS1-209, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene CAPNS1, Length 592 nt, Biotype non stop decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-209ENST00000590049 C1QTNF8P60827 252 aa18.69■□□□□ 0.58
CAPNS1-209ENST00000590049 C14orf37Q86TY3 774 aa18.69■□□□□ 0.58
CAPNS1-209ENST00000590049 TET3O43151 1660 aa18.69■□□□□ 0.58
CAPNS1-209ENST00000590049 ATRNO75882 1429 aa18.68■□□□□ 0.58
CAPNS1-209ENST00000590049 DCAF8L1A6NGE4 600 aa18.68■□□□□ 0.58
CAPNS1-209ENST00000590049 ATF3P18847 181 aa18.68■□□□□ 0.58
CAPNS1-209ENST00000590049 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP18.68■□□□□ 0.58
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CAPNS1-209ENST00000590049 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa18.66■□□□□ 0.58
CAPNS1-209ENST00000590049 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP18.66■□□□□ 0.58
CAPNS1-209ENST00000590049 MAST1Q9Y2H9 1570 aa18.66■□□□□ 0.58
CAPNS1-209ENST00000590049 PNPLA6Q8IY17 1366 aa18.66■□□□□ 0.58
CAPNS1-209ENST00000590049 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP18.64■□□□□ 0.57
CAPNS1-209ENST00000590049 C19orf44Q9H6X5 657 aa18.64■□□□□ 0.57
CAPNS1-209ENST00000590049 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa18.63■□□□□ 0.57
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CAPNS1-209ENST00000590049 CCDC18Q5T9S5 1454 aa18.6■□□□□ 0.57
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CAPNS1-209ENST00000590049 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP18.59■□□□□ 0.57
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CAPNS1-209ENST00000590049 CEP350Q5VT06 3117 aa18.57■□□□□ 0.56
CAPNS1-209ENST00000590049 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa18.57■□□□□ 0.56
CAPNS1-209ENST00000590049 MBD5Q9P267 1494 aa18.57■□□□□ 0.56
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CAPNS1-209ENST00000590049 PTCH1Q13635 1447 aa18.53■□□□□ 0.56
CAPNS1-209ENST00000590049 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
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CAPNS1-209ENST00000590049 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
CAPNS1-209ENST00000590049 DCCP43146 1447 aa18.46■□□□□ 0.55
CAPNS1-209ENST00000590049 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP18.44■□□□□ 0.54
CAPNS1-209ENST00000590049 NINLQ9Y2I6 1382 aa18.43■□□□□ 0.54
CAPNS1-209ENST00000590049 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa18.43■□□□□ 0.54
CAPNS1-209ENST00000590049 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa18.43■□□□□ 0.54
CAPNS1-209ENST00000590049 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
CAPNS1-209ENST00000590049 CCDC141Q6ZP82 1450 aa18.43■□□□□ 0.54
CAPNS1-209ENST00000590049 MST1RQ04912 1400 aa18.41■□□□□ 0.54
CAPNS1-209ENST00000590049 CEP152O94986 1710 aa18.41■□□□□ 0.54
CAPNS1-209ENST00000590049 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP18.41■□□□□ 0.54
CAPNS1-209ENST00000590049 TBX22Q9Y458 520 aa18.41■□□□□ 0.54
CAPNS1-209ENST00000590049 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa18.41■□□□□ 0.54
CAPNS1-209ENST00000590049 RALGAPBQ86X10 1494 aa18.4■□□□□ 0.54
CAPNS1-209ENST00000590049 BRWD3Q6RI45 1802 aa18.4■□□□□ 0.54
CAPNS1-209ENST00000590049 IDI1Q13907 227 aa18.4■□□□□ 0.54
CAPNS1-209ENST00000590049 SEPT12Q8IYM1 358 aa18.39■□□□□ 0.53
CAPNS1-209ENST00000590049 RSPH4AQ5TD94 716 aa18.38■□□□□ 0.53
CAPNS1-209ENST00000590049 GLI3P10071 1580 aa18.38■□□□□ 0.53
CAPNS1-209ENST00000590049 SLC34A2O95436 690 aa18.36■□□□□ 0.53
CAPNS1-209ENST00000590049 KRT27Q7Z3Y8 459 aa18.36■□□□□ 0.53
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CAPNS1-209ENST00000590049 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa18.34■□□□□ 0.53
CAPNS1-209ENST00000590049 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
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CAPNS1-209ENST00000590049 UNC5CLQ8IV45 518 aa18.33■□□□□ 0.52
CAPNS1-209ENST00000590049 ADGRB3O60242 1522 aa18.33■□□□□ 0.52
CAPNS1-209ENST00000590049 MTUS2Q5JR59 1369 aa18.32■□□□□ 0.52
CAPNS1-209ENST00000590049 PIK3R4Q99570 1358 aa18.32■□□□□ 0.52
CAPNS1-209ENST00000590049 UBTFP17480 764 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
CAPNS1-209ENST00000590049 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
CAPNS1-209ENST00000590049 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP18.31■□□□□ 0.52
CAPNS1-209ENST00000590049 TSPY4P0CV99 314 aa18.31■□□□□ 0.52
CAPNS1-209ENST00000590049 TSPY10P0CW01 314 aa18.31■□□□□ 0.52
CAPNS1-209ENST00000590049 SPON1Q9HCB6 807 aa18.31■□□□□ 0.52
CAPNS1-209ENST00000590049 HDGFP51858 240 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
CAPNS1-209ENST00000590049 MYOM2P54296 1465 aa18.29■□□□□ 0.52
CAPNS1-209ENST00000590049 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa18.29■□□□□ 0.52
CAPNS1-209ENST00000590049 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
CAPNS1-209ENST00000590049 DISP2A7MBM2 1401 aa18.29■□□□□ 0.52
CAPNS1-209ENST00000590049 ZFYVE9O95405 1425 aa18.29■□□□□ 0.52
CAPNS1-209ENST00000590049 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa18.27■□□□□ 0.52
CAPNS1-209ENST00000590049 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
CAPNS1-209ENST00000590049 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
CAPNS1-209ENST00000590049 LAMC1P11047 1609 aa18.26■□□□□ 0.51
CAPNS1-209ENST00000590049 FYCO1Q9BQS8 1478 aa18.26■□□□□ 0.51
CAPNS1-209ENST00000590049 KCNQ2O43526 872 aa18.25■□□□□ 0.51
CAPNS1-209ENST00000590049 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa18.24■□□□□ 0.51
CAPNS1-209ENST00000590049 RGPD1P0DJD0 1748 aa18.24■□□□□ 0.51
CAPNS1-209ENST00000590049 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
CAPNS1-209ENST00000590049 RIMS2Q9UQ26 1411 aa18.23■□□□□ 0.51
CAPNS1-209ENST00000590049 TRPM2O94759 1503 aa18.23■□□□□ 0.51
CAPNS1-209ENST00000590049 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa18.23■□□□□ 0.51
CAPNS1-209ENST00000590049 SLIT2O94813 1529 aa18.23■□□□□ 0.51
CAPNS1-209ENST00000590049 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
CAPNS1-209ENST00000590049 SLC52A1Q9NWF4 448 aa18.22■□□□□ 0.51
CAPNS1-209ENST00000590049 PCDH10Q9P2E7 1040 aa18.22■□□□□ 0.51
CAPNS1-209ENST00000590049 CHD4Q14839 1912 aa18.2■□□□□ 0.5
CAPNS1-209ENST00000590049 VPS72Q15906 364 aa18.19■□□□□ 0.5
CAPNS1-209ENST00000590049 CAMKK2Q96RR4 588 aa18.19■□□□□ 0.5
CAPNS1-209ENST00000590049 ARHGEF5Q12774 1597 aa18.18■□□□□ 0.5
CAPNS1-209ENST00000590049 PTPRUQ92729 1446 aa18.18■□□□□ 0.5
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