RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589600.5

ILF3-216, Transcript of interleukin enhancer binding factor 3, humanhuman

TSL 5

Gene ILF3, Length 839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3-216ENST00000589600 EID1Q9Y6B2 187 aa36.36■■■■□ 3.41
ILF3-216ENST00000589600 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa36.35■■■■□ 3.41
ILF3-216ENST00000589600 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa36.34■■■■□ 3.41
ILF3-216ENST00000589600 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa36.31■■■■□ 3.4
ILF3-216ENST00000589600 LTBP4Q8N2S1 1624 aa36.3■■■■□ 3.4
ILF3-216ENST00000589600 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa36.27■■■■□ 3.4
ILF3-216ENST00000589600 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP36.25■■■■□ 3.39
ILF3-216ENST00000589600 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP36.24■■■■□ 3.39
ILF3-216ENST00000589600 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP36.24■■■■□ 3.39
ILF3-216ENST00000589600 PPLO60437 1756 aa36.24■■■■□ 3.39
ILF3-216ENST00000589600 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP36.23■■■■□ 3.39
ILF3-216ENST00000589600 HDGFP51858 240 aaKnown RBP36.22■■■■□ 3.39
ILF3-216ENST00000589600 IFT172Q9UG01 1749 aa36.21■■■■□ 3.39
ILF3-216ENST00000589600 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa36.2■■■■□ 3.39
ILF3-216ENST00000589600 STRCP1A6NGW2 1772 aa36.2■■■■□ 3.38
ILF3-216ENST00000589600 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP36.19■■■■□ 3.38
ILF3-216ENST00000589600 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa36.17■■■■□ 3.38
ILF3-216ENST00000589600 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP36.16■■■■□ 3.38
ILF3-216ENST00000589600 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa36.16■■■■□ 3.38
ILF3-216ENST00000589600 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa36.14■■■■□ 3.38
ILF3-216ENST00000589600 SLC26A8Q96RN1 970 aa36.13■■■■□ 3.37
ILF3-216ENST00000589600 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP36.13■■■■□ 3.37
ILF3-216ENST00000589600 DIP2AQ14689 1571 aa36.12■■■■□ 3.37
ILF3-216ENST00000589600 RGL3Q3MIN7 710 aa36.1■■■■□ 3.37
ILF3-216ENST00000589600 PCGF6Q9BYE7 350 aa36.1■■■■□ 3.37
ILF3-216ENST00000589600 CPS1P31327 1500 aa36.07■■■■□ 3.36
ILF3-216ENST00000589600 NWD1Q149M9 1564 aa36.06■■■■□ 3.36
ILF3-216ENST00000589600 CERKQ8TCT0 537 aa36.05■■■■□ 3.36
ILF3-216ENST00000589600 BCANQ96GW7 911 aa36.05■■■■□ 3.36
ILF3-216ENST00000589600 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP36.05■■■■□ 3.36
ILF3-216ENST00000589600 TBX22Q9Y458 520 aa36.04■■■■□ 3.36
ILF3-216ENST00000589600 VGFO15240 615 aaPredicted RBP36.03■■■■□ 3.36
ILF3-216ENST00000589600 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP36.03■■■■□ 3.36
ILF3-216ENST00000589600 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa36■■■■□ 3.35
ILF3-216ENST00000589600 MYOM2P54296 1465 aa35.99■■■■□ 3.35
ILF3-216ENST00000589600 NRXN1Q9ULB1 1477 aa35.98■■■■□ 3.35
ILF3-216ENST00000589600 IQSEC2Q5JU85 1478 aa35.97■■■■□ 3.35
ILF3-216ENST00000589600 LRRC7Q96NW7 1537 aa35.96■■■■□ 3.35
ILF3-216ENST00000589600 ALKQ9UM73 1620 aa35.96■■■■□ 3.35
ILF3-216ENST00000589600 PIK3R4Q99570 1358 aa35.95■■■■□ 3.35
ILF3-216ENST00000589600 KCNA6P17658 529 aa35.95■■■■□ 3.35
ILF3-216ENST00000589600 PIK3C2GO75747 1445 aa35.94■■■■□ 3.34
ILF3-216ENST00000589600 PTPRUQ92729 1446 aa35.93■■■■□ 3.34
ILF3-216ENST00000589600 METP08581 1390 aa35.93■■■■□ 3.34
ILF3-216ENST00000589600 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP35.92■■■■□ 3.34
ILF3-216ENST00000589600 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP35.92■■■■□ 3.34
ILF3-216ENST00000589600 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP35.91■■■■□ 3.34
ILF3-216ENST00000589600 SIN3AQ96ST3 1273 aa35.88■■■■□ 3.33
ILF3-216ENST00000589600 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa35.84■■■■□ 3.33
ILF3-216ENST00000589600 DCAF11Q8TEB1 546 aa35.81■■■■□ 3.32
ILF3-216ENST00000589600 LAMC1P11047 1609 aa35.8■■■■□ 3.32
ILF3-216ENST00000589600 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa35.79■■■■□ 3.32
ILF3-216ENST00000589600 TMEM94Q12767 1356 aa35.77■■■■□ 3.32
ILF3-216ENST00000589600 PRAG1Q86YV5 1406 aa35.76■■■■□ 3.32
ILF3-216ENST00000589600 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa35.75■■■■□ 3.31
ILF3-216ENST00000589600 STAC3Q96MF2 364 aa35.74■■■■□ 3.31
ILF3-216ENST00000589600 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP35.74■■■■□ 3.31
ILF3-216ENST00000589600 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP35.73■■■■□ 3.31
ILF3-216ENST00000589600 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP35.73■■■■□ 3.31
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ILF3-216ENST00000589600 FBXO41Q8TF61 875 aa35.72■■■■□ 3.31
ILF3-216ENST00000589600 CFAP70Q5T0N1 1121 aa35.7■■■■□ 3.31
ILF3-216ENST00000589600 PTCH1Q13635 1447 aa35.69■■■■□ 3.3
ILF3-216ENST00000589600 L3MBTL2Q969R5 705 aa35.69■■■■□ 3.3
ILF3-216ENST00000589600 ADGRB1O14514 1584 aa35.68■■■■□ 3.3
ILF3-216ENST00000589600 KNDC1Q76NI1 1749 aa35.68■■■■□ 3.3
ILF3-216ENST00000589600 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa35.66■■■■□ 3.3
ILF3-216ENST00000589600 TMEM132EQ6IEE7 984 aa35.65■■■■□ 3.3
ILF3-216ENST00000589600 TECPR2O15040 1411 aa35.65■■■■□ 3.3
ILF3-216ENST00000589600 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP35.64■■■■□ 3.3
ILF3-216ENST00000589600 ROBO2Q9HCK4 1378 aa35.64■■■■□ 3.3
ILF3-216ENST00000589600 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa35.63■■■■□ 3.29
ILF3-216ENST00000589600 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP35.62■■■■□ 3.29
ILF3-216ENST00000589600 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP35.6■■■■□ 3.29
ILF3-216ENST00000589600 UBAP1LF5GYI3 381 aa35.59■■■■□ 3.29
ILF3-216ENST00000589600 ABCC11Q96J66 1382 aa35.59■■■■□ 3.29
ILF3-216ENST00000589600 NALCNQ8IZF0 1738 aa35.58■■■■□ 3.29
ILF3-216ENST00000589600 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP35.57■■■■□ 3.29
ILF3-216ENST00000589600 CLSPNQ9HAW4 1339 aa35.55■■■■□ 3.28
ILF3-216ENST00000589600 STK26Q9P289 416 aa35.54■■■■□ 3.28
ILF3-216ENST00000589600 MSH6P52701 1360 aa35.53■■■■□ 3.28
ILF3-216ENST00000589600 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa35.52■■■■□ 3.28
ILF3-216ENST00000589600 TOM1O60784 492 aa35.51■■■■□ 3.28
ILF3-216ENST00000589600 TONSLQ96HA7 1378 aa35.51■■■■□ 3.27
ILF3-216ENST00000589600 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa35.5■■■■□ 3.27
ILF3-216ENST00000589600 DLC1Q96QB1 1528 aa35.5■■■■□ 3.27
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ILF3-216ENST00000589600 C19orf44Q9H6X5 657 aa35.47■■■■□ 3.27
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ILF3-216ENST00000589600 C14orf37Q86TY3 774 aa35.45■■■■□ 3.27
ILF3-216ENST00000589600 SIRT1Q96EB6 747 aa35.44■■■■□ 3.26
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ILF3-216ENST00000589600 WAPLQ7Z5K2 1190 aa35.43■■■■□ 3.26
ILF3-216ENST00000589600 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP35.43■■■■□ 3.26
ILF3-216ENST00000589600 NBPF8Q3BBV2 869 aa35.42■■■■□ 3.26
ILF3-216ENST00000589600 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP35.41■■■■□ 3.26
ILF3-216ENST00000589600 PIP4K2BP78356 416 aa35.39■■■■□ 3.26
ILF3-216ENST00000589600 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa35.38■■■■□ 3.25
ILF3-216ENST00000589600 TRAK1Q9UPV9 953 aa35.37■■■■□ 3.25
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