RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587957.1

EFTUD2-209, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 503 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-209ENST00000587957 TET3O43151 1660 aa16.23■□□□□ 0.19
EFTUD2-209ENST00000587957 SYNMO15061 1565 aa16.22■□□□□ 0.19
EFTUD2-209ENST00000587957 ATXN8OSP0DMR3 200 aa16.21■□□□□ 0.19
EFTUD2-209ENST00000587957 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP16.21■□□□□ 0.19
EFTUD2-209ENST00000587957 GCC2Q8IWJ2 1684 aa16.21■□□□□ 0.18
EFTUD2-209ENST00000587957 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
EFTUD2-209ENST00000587957 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
EFTUD2-209ENST00000587957 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
EFTUD2-209ENST00000587957 NUP155O75694 1391 aa16.17■□□□□ 0.18
EFTUD2-209ENST00000587957 IQGAP3Q86VI3 1631 aa16.17■□□□□ 0.18
EFTUD2-209ENST00000587957 IDI1Q13907 227 aa16.17■□□□□ 0.18
EFTUD2-209ENST00000587957 TXNDC2Q86VQ3 553 aa16.17■□□□□ 0.18
EFTUD2-209ENST00000587957 EID1Q9Y6B2 187 aa16.17■□□□□ 0.18
EFTUD2-209ENST00000587957 ADGRB3O60242 1522 aa16.17■□□□□ 0.18
EFTUD2-209ENST00000587957 NOS1P29475 1434 aa16.17■□□□□ 0.18
EFTUD2-209ENST00000587957 MED14O60244 1454 aa16.16■□□□□ 0.18
EFTUD2-209ENST00000587957 E9PCH4 1651 aa16.16■□□□□ 0.18
EFTUD2-209ENST00000587957 IQSEC2Q5JU85 1478 aa16.16■□□□□ 0.18
EFTUD2-209ENST00000587957 SLIT1O75093 1534 aa16.15■□□□□ 0.18
EFTUD2-209ENST00000587957 CHGAP10645 457 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
EFTUD2-209ENST00000587957 CPS1P31327 1500 aa16.14■□□□□ 0.18
EFTUD2-209ENST00000587957 UBAP1LF5GYI3 381 aa16.14■□□□□ 0.17
EFTUD2-209ENST00000587957 CHRDL2Q6WN34 429 aa16.14■□□□□ 0.17
EFTUD2-209ENST00000587957 ARHGAP23Q9P227 1491 aa16.14■□□□□ 0.17
EFTUD2-209ENST00000587957 MYO5BQ9ULV0 1848 aa16.14■□□□□ 0.17
EFTUD2-209ENST00000587957 TMEM2Q9UHN6 1383 aa16.13■□□□□ 0.17
EFTUD2-209ENST00000587957 LTKP29376 864 aa16.13■□□□□ 0.17
EFTUD2-209ENST00000587957 BCANQ96GW7 911 aa16.13■□□□□ 0.17
EFTUD2-209ENST00000587957 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
EFTUD2-209ENST00000587957 SLC52A1Q9NWF4 448 aa16.11■□□□□ 0.17
EFTUD2-209ENST00000587957 STRCP1A6NGW2 1772 aa16.1■□□□□ 0.17
EFTUD2-209ENST00000587957 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
EFTUD2-209ENST00000587957 AKT1S1Q96B36 256 aa16.09■□□□□ 0.17
EFTUD2-209ENST00000587957 NAIPQ13075 1403 aa16.09■□□□□ 0.17
EFTUD2-209ENST00000587957 PIP4K2BP78356 416 aa16.08■□□□□ 0.16
EFTUD2-209ENST00000587957 TRIM52Q96A61 297 aa16.08■□□□□ 0.16
EFTUD2-209ENST00000587957 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa16.07■□□□□ 0.16
EFTUD2-209ENST00000587957 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa16.07■□□□□ 0.16
EFTUD2-209ENST00000587957 RIMS2Q9UQ26 1411 aa16.05■□□□□ 0.16
EFTUD2-209ENST00000587957 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
EFTUD2-209ENST00000587957 SLC26A8Q96RN1 970 aa16.05■□□□□ 0.16
EFTUD2-209ENST00000587957 HFM1A2PYH4 1435 aa16.04■□□□□ 0.16
EFTUD2-209ENST00000587957 LRRC7Q96NW7 1537 aa16.04■□□□□ 0.16
EFTUD2-209ENST00000587957 TOM1O60784 492 aa16.02■□□□□ 0.16
EFTUD2-209ENST00000587957 ZFYVE9O95405 1425 aa16.02■□□□□ 0.15
EFTUD2-209ENST00000587957 HDGFP51858 240 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
EFTUD2-209ENST00000587957 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
EFTUD2-209ENST00000587957 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa15.99■□□□□ 0.15
EFTUD2-209ENST00000587957 CLTCL1P53675 1640 aa15.98■□□□□ 0.15
EFTUD2-209ENST00000587957 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
EFTUD2-209ENST00000587957 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP15.98■□□□□ 0.15
EFTUD2-209ENST00000587957 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
EFTUD2-209ENST00000587957 TRPM2O94759 1503 aa15.97■□□□□ 0.15
EFTUD2-209ENST00000587957 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
EFTUD2-209ENST00000587957 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
EFTUD2-209ENST00000587957 DISP3Q9P2K9 1392 aa15.95■□□□□ 0.14
EFTUD2-209ENST00000587957 KIF1BO60333 1816 aa15.94■□□□□ 0.14
EFTUD2-209ENST00000587957 KCNA6P17658 529 aa15.94■□□□□ 0.14
EFTUD2-209ENST00000587957 HSPA1LP34931 641 aa15.94■□□□□ 0.14
EFTUD2-209ENST00000587957 TMEM94Q12767 1356 aa15.94■□□□□ 0.14
EFTUD2-209ENST00000587957 NWD1Q149M9 1564 aa15.94■□□□□ 0.14
EFTUD2-209ENST00000587957 ALKQ9UM73 1620 aa15.94■□□□□ 0.14
EFTUD2-209ENST00000587957 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
EFTUD2-209ENST00000587957 DIP2AQ14689 1571 aa15.92■□□□□ 0.14
EFTUD2-209ENST00000587957 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
EFTUD2-209ENST00000587957 C14orf37Q86TY3 774 aa15.9■□□□□ 0.14
EFTUD2-209ENST00000587957 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa15.9■□□□□ 0.14
EFTUD2-209ENST00000587957 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa15.88■□□□□ 0.13
EFTUD2-209ENST00000587957 MSH6P52701 1360 aa15.87■□□□□ 0.13
EFTUD2-209ENST00000587957 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
EFTUD2-209ENST00000587957 TBX22Q9Y458 520 aa15.87■□□□□ 0.13
EFTUD2-209ENST00000587957 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa15.86■□□□□ 0.13
EFTUD2-209ENST00000587957 SETD5Q9C0A6 1442 aa15.86■□□□□ 0.13
EFTUD2-209ENST00000587957 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa15.85■□□□□ 0.13
EFTUD2-209ENST00000587957 CCDC144AA2RUR9 1427 aa15.85■□□□□ 0.13
EFTUD2-209ENST00000587957 MPHOSPH9Q99550 1183 aa15.84■□□□□ 0.13
EFTUD2-209ENST00000587957 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa15.83■□□□□ 0.12
EFTUD2-209ENST00000587957 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa15.83■□□□□ 0.12
EFTUD2-209ENST00000587957 PITPNM1O00562 1244 aa15.82■□□□□ 0.12
EFTUD2-209ENST00000587957 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa15.82■□□□□ 0.12
EFTUD2-209ENST00000587957 PIK3R4Q99570 1358 aa15.82■□□□□ 0.12
EFTUD2-209ENST00000587957 PTPRUQ92729 1446 aa15.82■□□□□ 0.12
EFTUD2-209ENST00000587957 PPLO60437 1756 aa15.81■□□□□ 0.12
EFTUD2-209ENST00000587957 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP15.81■□□□□ 0.12
EFTUD2-209ENST00000587957 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP15.8■□□□□ 0.12
EFTUD2-209ENST00000587957 METP08581 1390 aa15.8■□□□□ 0.12
EFTUD2-209ENST00000587957 RGL3Q3MIN7 710 aa15.8■□□□□ 0.12
EFTUD2-209ENST00000587957 PIP4P2Q8N4L2 257 aa15.79■□□□□ 0.12
EFTUD2-209ENST00000587957 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
EFTUD2-209ENST00000587957 VGFO15240 615 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
EFTUD2-209ENST00000587957 SPDYE2BA6NHP3 402 aa15.77■□□□□ 0.12
EFTUD2-209ENST00000587957 SPDYE6P0CI01 402 aa15.77■□□□□ 0.12
EFTUD2-209ENST00000587957 ATF3P18847 181 aa15.77■□□□□ 0.12
EFTUD2-209ENST00000587957 SPDYE2Q495Y8 402 aa15.77■□□□□ 0.12
EFTUD2-209ENST00000587957 FAM135BQ49AJ0 1406 aa15.77■□□□□ 0.11
EFTUD2-209ENST00000587957 SLAIN2Q9P270 581 aa15.76■□□□□ 0.11
EFTUD2-209ENST00000587957 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa15.75■□□□□ 0.11
EFTUD2-209ENST00000587957 PHLPP1O60346 1717 aa15.75■□□□□ 0.11
EFTUD2-209ENST00000587957 ILDR2Q71H61 639 aa15.75■□□□□ 0.11
EFTUD2-209ENST00000587957 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.1 ms