RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 MED14O60244 1454 aa48.52■■■■■ 5.36
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CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP48.48■■■■■ 5.35
CTDNEP1-209ENST00000574205 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP48.44■■■■■ 5.35
CTDNEP1-209ENST00000574205 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP48.44■■■■■ 5.35
CTDNEP1-209ENST00000574205 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa48.44■■■■■ 5.34
CTDNEP1-209ENST00000574205 IQGAP1P46940 1657 aa48.42■■■■■ 5.34
CTDNEP1-209ENST00000574205 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa48.39■■■■■ 5.34
CTDNEP1-209ENST00000574205 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP48.37■■■■■ 5.33
CTDNEP1-209ENST00000574205 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa48.35■■■■■ 5.33
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CTDNEP1-209ENST00000574205 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP48.32■■■■■ 5.33
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CTDNEP1-209ENST00000574205 PPLO60437 1756 aa48.3■■■■■ 5.32
CTDNEP1-209ENST00000574205 IFT172Q9UG01 1749 aa48.23■■■■■ 5.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 VGFO15240 615 aaPredicted RBP48.22■■■■■ 5.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 BCANQ96GW7 911 aa48.2■■■■■ 5.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa48.14■■■■■ 5.3
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CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC26A8Q96RN1 970 aa48.12■■■■■ 5.29
CTDNEP1-209ENST00000574205 SIN3AQ96ST3 1273 aa48.11■■■■■ 5.29
CTDNEP1-209ENST00000574205 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa48.1■■■■■ 5.29
CTDNEP1-209ENST00000574205 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa48.09■■■■■ 5.29
CTDNEP1-209ENST00000574205 DIP2AQ14689 1571 aa48.09■■■■■ 5.29
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP48.06■■■■■ 5.28
CTDNEP1-209ENST00000574205 MYOM2P54296 1465 aa48.06■■■■■ 5.28
CTDNEP1-209ENST00000574205 TBX22Q9Y458 520 aa48.05■■■■■ 5.28
CTDNEP1-209ENST00000574205 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa48.03■■■■■ 5.28
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CTDNEP1-209ENST00000574205 DCAF11Q8TEB1 546 aa47.99■■■■■ 5.27
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CTDNEP1-209ENST00000574205 LTBP4Q8N2S1 1624 aa47.98■■■■■ 5.27
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CTDNEP1-209ENST00000574205 PIK3C2GO75747 1445 aa47.95■■■■■ 5.27
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CTDNEP1-209ENST00000574205 ALKQ9UM73 1620 aa47.92■■■■■ 5.26
CTDNEP1-209ENST00000574205 PIK3R4Q99570 1358 aa47.92■■■■■ 5.26
CTDNEP1-209ENST00000574205 STRCP1A6NGW2 1772 aa47.91■■■■■ 5.26
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CTDNEP1-209ENST00000574205 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa47.9■■■■■ 5.26
CTDNEP1-209ENST00000574205 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP47.89■■■■■ 5.26
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CTDNEP1-209ENST00000574205 KCNA6P17658 529 aa47.86■■■■■ 5.25
CTDNEP1-209ENST00000574205 NWD1Q149M9 1564 aa47.86■■■■■ 5.25
CTDNEP1-209ENST00000574205 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP47.86■■■■■ 5.25
CTDNEP1-209ENST00000574205 METP08581 1390 aa47.83■■■■■ 5.25
CTDNEP1-209ENST00000574205 L3MBTL2Q969R5 705 aa47.83■■■■■ 5.25
CTDNEP1-209ENST00000574205 LAMC1P11047 1609 aa47.8■■■■■ 5.24
CTDNEP1-209ENST00000574205 TONSLQ96HA7 1378 aa47.77■■■■■ 5.24
CTDNEP1-209ENST00000574205 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP47.76■■■■■ 5.24
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CTDNEP1-209ENST00000574205 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP47.76■■■■■ 5.24
CTDNEP1-209ENST00000574205 CERKQ8TCT0 537 aa47.72■■■■■ 5.23
CTDNEP1-209ENST00000574205 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa47.71■■■■■ 5.23
CTDNEP1-209ENST00000574205 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP47.71■■■■■ 5.23
CTDNEP1-209ENST00000574205 CFAP70Q5T0N1 1121 aa47.7■■■■■ 5.23
CTDNEP1-209ENST00000574205 LRRC7Q96NW7 1537 aa47.69■■■■■ 5.23
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CTDNEP1-209ENST00000574205 IQSEC2Q5JU85 1478 aa47.65■■■■■ 5.22
CTDNEP1-209ENST00000574205 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP47.61■■■■■ 5.21
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CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM132EQ6IEE7 984 aa47.6■■■■■ 5.21
CTDNEP1-209ENST00000574205 ADGRB1O14514 1584 aa47.56■■■■■ 5.2
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CTDNEP1-209ENST00000574205 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa47.54■■■■■ 5.2
CTDNEP1-209ENST00000574205 KNDC1Q76NI1 1749 aa47.51■■■■■ 5.2
CTDNEP1-209ENST00000574205 TECPR2O15040 1411 aa47.5■■■■■ 5.19
CTDNEP1-209ENST00000574205 ABCC11Q96J66 1382 aa47.5■■■■■ 5.19
CTDNEP1-209ENST00000574205 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa47.48■■■■■ 5.19
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CTDNEP1-209ENST00000574205 ROBO2Q9HCK4 1378 aa47.45■■■■■ 5.19
CTDNEP1-209ENST00000574205 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa47.45■■■■■ 5.19
CTDNEP1-209ENST00000574205 NBPF8Q3BBV2 869 aa47.4■■■■■ 5.18
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CTDNEP1-209ENST00000574205 DLC1Q96QB1 1528 aa47.35■■■■■ 5.17
CTDNEP1-209ENST00000574205 SIRT1Q96EB6 747 aa47.35■■■■■ 5.17
CTDNEP1-209ENST00000574205 C14orf37Q86TY3 774 aa47.34■■■■■ 5.17
CTDNEP1-209ENST00000574205 MSH6P52701 1360 aa47.34■■■■■ 5.17
CTDNEP1-209ENST00000574205 FAM135BQ49AJ0 1406 aa47.34■■■■■ 5.17
CTDNEP1-209ENST00000574205 TRAK1Q9UPV9 953 aa47.3■■■■■ 5.16
CTDNEP1-209ENST00000574205 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP47.29■■■■■ 5.16
CTDNEP1-209ENST00000574205 C19orf44Q9H6X5 657 aa47.28■■■■■ 5.16
CTDNEP1-209ENST00000574205 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa47.27■■■■■ 5.16
CTDNEP1-209ENST00000574205 NALCNQ8IZF0 1738 aa47.27■■■■■ 5.16
CTDNEP1-209ENST00000574205 RALGAPBQ86X10 1494 aa47.26■■■■■ 5.16
CTDNEP1-209ENST00000574205 WAPLQ7Z5K2 1190 aa47.26■■■■■ 5.16
CTDNEP1-209ENST00000574205 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP47.25■■■■■ 5.15
CTDNEP1-209ENST00000574205 UBAP1LF5GYI3 381 aa47.24■■■■■ 5.15
CTDNEP1-209ENST00000574205 TOM1O60784 492 aa47.24■■■■■ 5.15
CTDNEP1-209ENST00000574205 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP47.24■■■■■ 5.15
CTDNEP1-209ENST00000574205 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa47.24■■■■■ 5.15
CTDNEP1-209ENST00000574205 GPRASP1Q5JY77 1395 aa47.22■■■■■ 5.15
CTDNEP1-209ENST00000574205 PRAM1Q96QH2 718 aa47.21■■■■■ 5.15
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