RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000573600.5

CTDNEP1-208, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,724 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-208ENST00000573600 NRXN1Q9ULB1 1477 aa40.51■■■■■ 4.08
CTDNEP1-208ENST00000573600 IQGAP1P46940 1657 aa40.46■■■■■ 4.07
CTDNEP1-208ENST00000573600 ERVK-7P63135 1459 aa40.46■■■■■ 4.07
CTDNEP1-208ENST00000573600 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa40.42■■■■■ 4.06
CTDNEP1-208ENST00000573600 MLECQ14165 292 aa40.42■■■■■ 4.06
CTDNEP1-208ENST00000573600 IDI1Q13907 227 aa40.41■■■■■ 4.06
CTDNEP1-208ENST00000573600 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP40.39■■■■■ 4.06
CTDNEP1-208ENST00000573600 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa40.38■■■■■ 4.06
CTDNEP1-208ENST00000573600 CCER2I3L3R5 266 aa40.37■■■■■ 4.05
CTDNEP1-208ENST00000573600 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP40.37■■■■■ 4.05
CTDNEP1-208ENST00000573600 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa40.35■■■■■ 4.05
CTDNEP1-208ENST00000573600 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP40.35■■■■■ 4.05
CTDNEP1-208ENST00000573600 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP40.34■■■■■ 4.05
CTDNEP1-208ENST00000573600 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa40.34■■■■■ 4.05
CTDNEP1-208ENST00000573600 PIK3C2GO75747 1445 aa40.33■■■■■ 4.05
CTDNEP1-208ENST00000573600 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa40.31■■■■■ 4.04
CTDNEP1-208ENST00000573600 CFAP70Q5T0N1 1121 aa40.3■■■■■ 4.04
CTDNEP1-208ENST00000573600 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP40.3■■■■■ 4.04
CTDNEP1-208ENST00000573600 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP40.29■■■■■ 4.04
CTDNEP1-208ENST00000573600 MYO5BQ9ULV0 1848 aa40.29■■■■■ 4.04
CTDNEP1-208ENST00000573600 VGFO15240 615 aaPredicted RBP40.29■■■■■ 4.04
CTDNEP1-208ENST00000573600 TESK2Q96S53 571 aa40.29■■■■■ 4.04
CTDNEP1-208ENST00000573600 POLR3GLQ9BT43 218 aa40.28■■■■■ 4.04
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZFYVE9O95405 1425 aa40.27■■■■■ 4.04
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZMYM3Q14202 1370 aa40.26■■■■■ 4.04
CTDNEP1-208ENST00000573600 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP40.23■■■■■ 4.03
CTDNEP1-208ENST00000573600 TMF1P82094 1093 aa40.22■■■■■ 4.03
CTDNEP1-208ENST00000573600 SLC24A1O60721 1099 aa40.15■■■■■ 4.02
CTDNEP1-208ENST00000573600 DISP3Q9P2K9 1392 aa40.15■■■■■ 4.02
CTDNEP1-208ENST00000573600 STAG3Q9UJ98 1225 aa40.13■■■■■ 4.02
CTDNEP1-208ENST00000573600 ADGRB1O14514 1584 aa40.12■■■■■ 4.01
CTDNEP1-208ENST00000573600 MYO3AQ8NEV4 1616 aa40.12■■■■■ 4.01
CTDNEP1-208ENST00000573600 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP40.11■■■■■ 4.01
CTDNEP1-208ENST00000573600 A2ML1A8K2U0 1454 aa40.08■■■■■ 4.01
CTDNEP1-208ENST00000573600 CDCA8Q53HL2 280 aa40.08■■■■■ 4.01
CTDNEP1-208ENST00000573600 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP40.05■■■■■ 4
CTDNEP1-208ENST00000573600 TNRQ92752 1358 aa40.03■■■■■ 4
CTDNEP1-208ENST00000573600 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP40.02■■■■■ 4
CTDNEP1-208ENST00000573600 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa40.01■■■■□ 3.99
CTDNEP1-208ENST00000573600 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa40■■■■□ 3.99
CTDNEP1-208ENST00000573600 RIMS2Q9UQ26 1411 aa39.94■■■■□ 3.98
CTDNEP1-208ENST00000573600 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP39.94■■■■□ 3.98
CTDNEP1-208ENST00000573600 TMEM132EQ6IEE7 984 aa39.94■■■■□ 3.98
CTDNEP1-208ENST00000573600 C3P01024 1663 aa39.92■■■■□ 3.98
CTDNEP1-208ENST00000573600 TRAK1Q9UPV9 953 aa39.91■■■■□ 3.98
CTDNEP1-208ENST00000573600 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP39.9■■■■□ 3.98
CTDNEP1-208ENST00000573600 QRICH2Q9H0J4 1663 aa39.9■■■■□ 3.98
CTDNEP1-208ENST00000573600 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP39.89■■■■□ 3.98
CTDNEP1-208ENST00000573600 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP39.89■■■■□ 3.98
CTDNEP1-208ENST00000573600 NLRP1Q9C000 1473 aa39.88■■■■□ 3.97
CTDNEP1-208ENST00000573600 ALKQ9UM73 1620 aa39.87■■■■□ 3.97
CTDNEP1-208ENST00000573600 UBR1Q8IWV7 1749 aa39.87■■■■□ 3.97
CTDNEP1-208ENST00000573600 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa39.86■■■■□ 3.97
CTDNEP1-208ENST00000573600 HDGFP51858 240 aaKnown RBP39.85■■■■□ 3.97
CTDNEP1-208ENST00000573600 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP39.82■■■■□ 3.97
CTDNEP1-208ENST00000573600 PANK3Q9H999 370 aa39.82■■■■□ 3.96
CTDNEP1-208ENST00000573600 MYOM1P52179 1685 aa39.81■■■■□ 3.96
CTDNEP1-208ENST00000573600 RALBP1Q15311 655 aa39.79■■■■□ 3.96
CTDNEP1-208ENST00000573600 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP39.76■■■■□ 3.96
CTDNEP1-208ENST00000573600 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP39.75■■■■□ 3.95
CTDNEP1-208ENST00000573600 MRS2Q9HD23 443 aa39.74■■■■□ 3.95
CTDNEP1-208ENST00000573600 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP39.74■■■■□ 3.95
CTDNEP1-208ENST00000573600 TMEM2Q9UHN6 1383 aa39.73■■■■□ 3.95
CTDNEP1-208ENST00000573600 CCDC184Q52MB2 194 aa39.7■■■■□ 3.95
CTDNEP1-208ENST00000573600 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa39.69■■■■□ 3.94
CTDNEP1-208ENST00000573600 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP39.68■■■■□ 3.94
CTDNEP1-208ENST00000573600 PARD3Q8TEW0 1356 aa39.68■■■■□ 3.94
CTDNEP1-208ENST00000573600 PTPRMP28827 1452 aa39.67■■■■□ 3.94
CTDNEP1-208ENST00000573600 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP39.67■■■■□ 3.94
CTDNEP1-208ENST00000573600 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP39.67■■■■□ 3.94
CTDNEP1-208ENST00000573600 STK26Q9P289 416 aa39.65■■■■□ 3.94
CTDNEP1-208ENST00000573600 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP39.65■■■■□ 3.94
CTDNEP1-208ENST00000573600 DLC1Q96QB1 1528 aa39.64■■■■□ 3.94
CTDNEP1-208ENST00000573600 EVC2Q86UK5 1308 aa39.64■■■■□ 3.94
CTDNEP1-208ENST00000573600 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP39.63■■■■□ 3.93
CTDNEP1-208ENST00000573600 KNSTRNQ9Y448 316 aa39.62■■■■□ 3.93
CTDNEP1-208ENST00000573600 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP39.61■■■■□ 3.93
CTDNEP1-208ENST00000573600 ADAMTSL3P82987 1691 aa39.6■■■■□ 3.93
CTDNEP1-208ENST00000573600 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP39.59■■■■□ 3.93
CTDNEP1-208ENST00000573600 TULP4Q9NRJ4 1543 aa39.59■■■■□ 3.93
CTDNEP1-208ENST00000573600 SLIT1O75093 1534 aa39.57■■■■□ 3.92
CTDNEP1-208ENST00000573600 POGKQ9P215 609 aa39.55■■■■□ 3.92
CTDNEP1-208ENST00000573600 ABCC11Q96J66 1382 aa39.55■■■■□ 3.92
CTDNEP1-208ENST00000573600 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa39.55■■■■□ 3.92
CTDNEP1-208ENST00000573600 ARHGAP23Q9P227 1491 aa39.54■■■■□ 3.92
CTDNEP1-208ENST00000573600 PRAM1Q96QH2 718 aa39.54■■■■□ 3.92
CTDNEP1-208ENST00000573600 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa39.53■■■■□ 3.92
CTDNEP1-208ENST00000573600 PLPPR3Q6T4P5 718 aa39.53■■■■□ 3.92
CTDNEP1-208ENST00000573600 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP39.52■■■■□ 3.92
CTDNEP1-208ENST00000573600 TMC1Q8TDI8 760 aa39.51■■■■□ 3.92
CTDNEP1-208ENST00000573600 NLRP13Q86W25 1043 aa39.51■■■■□ 3.91
CTDNEP1-208ENST00000573600 FAM9BQ8IZU0 186 aa39.51■■■■□ 3.91
CTDNEP1-208ENST00000573600 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP39.51■■■■□ 3.91
CTDNEP1-208ENST00000573600 EID1Q9Y6B2 187 aa39.51■■■■□ 3.91
CTDNEP1-208ENST00000573600 KNDC1Q76NI1 1749 aa39.5■■■■□ 3.91
CTDNEP1-208ENST00000573600 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP39.48■■■■□ 3.91
CTDNEP1-208ENST00000573600 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP39.48■■■■□ 3.91
CTDNEP1-208ENST00000573600 TXNDC2Q86VQ3 553 aa39.47■■■■□ 3.91
CTDNEP1-208ENST00000573600 BCANQ96GW7 911 aa39.47■■■■□ 3.91
CTDNEP1-208ENST00000573600 METP08581 1390 aa39.46■■■■□ 3.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 88.8 ms