RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572043.5

CTDNEP1-207, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CTDNEP1, Length 857 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-207ENST00000572043 ZFYVE9O95405 1425 aa26.69■■□□□ 1.86
CTDNEP1-207ENST00000572043 PIP4K2BP78356 416 aa26.69■■□□□ 1.86
CTDNEP1-207ENST00000572043 HDGFP51858 240 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
CTDNEP1-207ENST00000572043 LRRC7Q96NW7 1537 aa26.67■■□□□ 1.86
CTDNEP1-207ENST00000572043 STRCP1A6NGW2 1772 aa26.66■■□□□ 1.86
CTDNEP1-207ENST00000572043 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
CTDNEP1-207ENST00000572043 TOM1O60784 492 aa26.65■■□□□ 1.86
CTDNEP1-207ENST00000572043 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP26.64■■□□□ 1.86
CTDNEP1-207ENST00000572043 MYO5BQ9ULV0 1848 aa26.63■■□□□ 1.85
CTDNEP1-207ENST00000572043 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa26.63■■□□□ 1.85
CTDNEP1-207ENST00000572043 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
CTDNEP1-207ENST00000572043 KCNA6P17658 529 aa26.61■■□□□ 1.85
CTDNEP1-207ENST00000572043 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa26.6■■□□□ 1.85
CTDNEP1-207ENST00000572043 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
CTDNEP1-207ENST00000572043 FOXD1Q16676 465 aa26.59■■□□□ 1.85
CTDNEP1-207ENST00000572043 TRPM2O94759 1503 aa26.56■■□□□ 1.84
CTDNEP1-207ENST00000572043 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
CTDNEP1-207ENST00000572043 CLTCL1P53675 1640 aa26.54■■□□□ 1.84
CTDNEP1-207ENST00000572043 TMEM94Q12767 1356 aa26.54■■□□□ 1.84
CTDNEP1-207ENST00000572043 TBX22Q9Y458 520 aa26.53■■□□□ 1.84
CTDNEP1-207ENST00000572043 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa26.51■■□□□ 1.83
CTDNEP1-207ENST00000572043 ALKQ9UM73 1620 aa26.5■■□□□ 1.83
CTDNEP1-207ENST00000572043 SETD5Q9C0A6 1442 aa26.5■■□□□ 1.83
CTDNEP1-207ENST00000572043 HSPA1LP34931 641 aa26.5■■□□□ 1.83
CTDNEP1-207ENST00000572043 MPHOSPH9Q99550 1183 aa26.5■■□□□ 1.83
CTDNEP1-207ENST00000572043 NWD1Q149M9 1564 aa26.46■■□□□ 1.83
CTDNEP1-207ENST00000572043 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.82
CTDNEP1-207ENST00000572043 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa26.43■■□□□ 1.82
CTDNEP1-207ENST00000572043 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa26.42■■□□□ 1.82
CTDNEP1-207ENST00000572043 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
CTDNEP1-207ENST00000572043 DIP2AQ14689 1571 aa26.41■■□□□ 1.82
CTDNEP1-207ENST00000572043 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa26.4■■□□□ 1.82
CTDNEP1-207ENST00000572043 DISP3Q9P2K9 1392 aa26.4■■□□□ 1.82
CTDNEP1-207ENST00000572043 C14orf37Q86TY3 774 aa26.39■■□□□ 1.82
CTDNEP1-207ENST00000572043 CCDC144AA2RUR9 1427 aa26.39■■□□□ 1.81
CTDNEP1-207ENST00000572043 MSH6P52701 1360 aa26.38■■□□□ 1.81
CTDNEP1-207ENST00000572043 PIK3R4Q99570 1358 aa26.38■■□□□ 1.81
CTDNEP1-207ENST00000572043 PTPRUQ92729 1446 aa26.38■■□□□ 1.81
CTDNEP1-207ENST00000572043 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa26.37■■□□□ 1.81
CTDNEP1-207ENST00000572043 METP08581 1390 aa26.36■■□□□ 1.81
CTDNEP1-207ENST00000572043 RGL3Q3MIN7 710 aa26.36■■□□□ 1.81
CTDNEP1-207ENST00000572043 KIF1BO60333 1816 aa26.36■■□□□ 1.81
CTDNEP1-207ENST00000572043 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa26.36■■□□□ 1.81
CTDNEP1-207ENST00000572043 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP26.35■■□□□ 1.81
CTDNEP1-207ENST00000572043 VGFO15240 615 aaPredicted RBP26.35■■□□□ 1.81
CTDNEP1-207ENST00000572043 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa26.33■■□□□ 1.81
CTDNEP1-207ENST00000572043 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP26.33■■□□□ 1.81
CTDNEP1-207ENST00000572043 SLAIN2Q9P270 581 aa26.27■■□□□ 1.8
CTDNEP1-207ENST00000572043 FAM135BQ49AJ0 1406 aa26.27■■□□□ 1.8
CTDNEP1-207ENST00000572043 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa26.25■■□□□ 1.79
CTDNEP1-207ENST00000572043 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa26.25■■□□□ 1.79
CTDNEP1-207ENST00000572043 C19orf44Q9H6X5 657 aa26.25■■□□□ 1.79
CTDNEP1-207ENST00000572043 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa26.24■■□□□ 1.79
CTDNEP1-207ENST00000572043 ATF3P18847 181 aa26.24■■□□□ 1.79
CTDNEP1-207ENST00000572043 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
CTDNEP1-207ENST00000572043 CADPS2Q86UW7 1296 aa26.21■■□□□ 1.79
CTDNEP1-207ENST00000572043 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa26.19■■□□□ 1.78
CTDNEP1-207ENST00000572043 PPLO60437 1756 aa26.19■■□□□ 1.78
CTDNEP1-207ENST00000572043 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa26.18■■□□□ 1.78
CTDNEP1-207ENST00000572043 ILDR2Q71H61 639 aa26.17■■□□□ 1.78
CTDNEP1-207ENST00000572043 HRCP23327 699 aa26.16■■□□□ 1.78
CTDNEP1-207ENST00000572043 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP26.16■■□□□ 1.78
CTDNEP1-207ENST00000572043 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP26.15■■□□□ 1.78
CTDNEP1-207ENST00000572043 ROBO2Q9HCK4 1378 aa26.14■■□□□ 1.78
CTDNEP1-207ENST00000572043 STK26Q9P289 416 aa26.12■■□□□ 1.77
CTDNEP1-207ENST00000572043 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
CTDNEP1-207ENST00000572043 TMEM132EQ6IEE7 984 aa26.1■■□□□ 1.77
CTDNEP1-207ENST00000572043 PTCH1Q13635 1447 aa26.1■■□□□ 1.77
CTDNEP1-207ENST00000572043 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa26.1■■□□□ 1.77
CTDNEP1-207ENST00000572043 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
CTDNEP1-207ENST00000572043 PIK3C2GO75747 1445 aa26.08■■□□□ 1.77
CTDNEP1-207ENST00000572043 DCCP43146 1447 aa26.08■■□□□ 1.77
CTDNEP1-207ENST00000572043 BRINP3Q76B58 766 aa26.07■■□□□ 1.76
CTDNEP1-207ENST00000572043 IFT172Q9UG01 1749 aa26.06■■□□□ 1.76
CTDNEP1-207ENST00000572043 MST1RQ04912 1400 aa26.05■■□□□ 1.76
CTDNEP1-207ENST00000572043 CFAP70Q5T0N1 1121 aa26.04■■□□□ 1.76
CTDNEP1-207ENST00000572043 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa26.04■■□□□ 1.76
CTDNEP1-207ENST00000572043 WAPLQ7Z5K2 1190 aa26.02■■□□□ 1.76
CTDNEP1-207ENST00000572043 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa26.02■■□□□ 1.76
CTDNEP1-207ENST00000572043 PHLPP1O60346 1717 aa26.02■■□□□ 1.76
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CTDNEP1-207ENST00000572043 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
CTDNEP1-207ENST00000572043 MYOM2P54296 1465 aa26.01■■□□□ 1.75
CTDNEP1-207ENST00000572043 PRAG1Q86YV5 1406 aa26.01■■□□□ 1.75
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CTDNEP1-207ENST00000572043 DCAF11Q8TEB1 546 aa26■■□□□ 1.75
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CTDNEP1-207ENST00000572043 JCADQ9P266 1359 aa25.98■■□□□ 1.75
CTDNEP1-207ENST00000572043 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
CTDNEP1-207ENST00000572043 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa25.97■■□□□ 1.75
CTDNEP1-207ENST00000572043 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
CTDNEP1-207ENST00000572043 ABCC11Q96J66 1382 aa25.96■■□□□ 1.75
CTDNEP1-207ENST00000572043 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
CTDNEP1-207ENST00000572043 C1orf167Q5SNV9 1468 aa25.95■■□□□ 1.74
CTDNEP1-207ENST00000572043 TECPR2O15040 1411 aa25.95■■□□□ 1.74
CTDNEP1-207ENST00000572043 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
CTDNEP1-207ENST00000572043 ORAI2Q96SN7 254 aa25.94■■□□□ 1.74
CTDNEP1-207ENST00000572043 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
CTDNEP1-207ENST00000572043 NUTM2FA1L443 756 aa25.92■■□□□ 1.74
CTDNEP1-207ENST00000572043 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP25.9■■□□□ 1.74
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