RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563857.1

RNPS1-208, Transcript of RNA binding protein with serine rich domain 1, humanhuman

TSL 2

Gene RNPS1, Length 739 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPS1-208ENST00000563857 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa23.84■■□□□ 1.41
RNPS1-208ENST00000563857 HRCP23327 699 aa23.82■■□□□ 1.4
RNPS1-208ENST00000563857 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa23.81■■□□□ 1.4
RNPS1-208ENST00000563857 TRPM2O94759 1503 aa23.8■■□□□ 1.4
RNPS1-208ENST00000563857 ZFYVE9O95405 1425 aa23.8■■□□□ 1.4
RNPS1-208ENST00000563857 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP23.8■■□□□ 1.4
RNPS1-208ENST00000563857 MPHOSPH9Q99550 1183 aa23.8■■□□□ 1.4
RNPS1-208ENST00000563857 TOM1O60784 492 aa23.78■■□□□ 1.4
RNPS1-208ENST00000563857 KCNA6P17658 529 aa23.77■■□□□ 1.4
RNPS1-208ENST00000563857 TBX22Q9Y458 520 aa23.77■■□□□ 1.4
RNPS1-208ENST00000563857 UBAP1LF5GYI3 381 aa23.75■■□□□ 1.39
RNPS1-208ENST00000563857 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa23.75■■□□□ 1.39
RNPS1-208ENST00000563857 SLC26A8Q96RN1 970 aa23.74■■□□□ 1.39
RNPS1-208ENST00000563857 MYO5BQ9ULV0 1848 aa23.73■■□□□ 1.39
RNPS1-208ENST00000563857 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa23.72■■□□□ 1.39
RNPS1-208ENST00000563857 KIF1BO60333 1816 aa23.71■■□□□ 1.39
RNPS1-208ENST00000563857 PIK3R4Q99570 1358 aa23.71■■□□□ 1.39
RNPS1-208ENST00000563857 VGFO15240 615 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
RNPS1-208ENST00000563857 CCDC144AA2RUR9 1427 aa23.7■■□□□ 1.38
RNPS1-208ENST00000563857 DIP2AQ14689 1571 aa23.69■■□□□ 1.38
RNPS1-208ENST00000563857 CLTCL1P53675 1640 aa23.68■■□□□ 1.38
RNPS1-208ENST00000563857 LRRC7Q96NW7 1537 aa23.67■■□□□ 1.38
RNPS1-208ENST00000563857 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
RNPS1-208ENST00000563857 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
RNPS1-208ENST00000563857 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
RNPS1-208ENST00000563857 FOXD1Q16676 465 aa23.62■■□□□ 1.37
RNPS1-208ENST00000563857 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa23.6■■□□□ 1.37
RNPS1-208ENST00000563857 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa23.6■■□□□ 1.37
RNPS1-208ENST00000563857 NWD1Q149M9 1564 aa23.59■■□□□ 1.37
RNPS1-208ENST00000563857 STRCP1A6NGW2 1772 aa23.59■■□□□ 1.37
RNPS1-208ENST00000563857 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa23.58■■□□□ 1.37
RNPS1-208ENST00000563857 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa23.58■■□□□ 1.37
RNPS1-208ENST00000563857 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa23.58■■□□□ 1.36
RNPS1-208ENST00000563857 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.36
RNPS1-208ENST00000563857 TMEM94Q12767 1356 aa23.57■■□□□ 1.36
RNPS1-208ENST00000563857 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
RNPS1-208ENST00000563857 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
RNPS1-208ENST00000563857 MSH6P52701 1360 aa23.54■■□□□ 1.36
RNPS1-208ENST00000563857 PIP4K2BP78356 416 aa23.54■■□□□ 1.36
RNPS1-208ENST00000563857 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa23.54■■□□□ 1.36
RNPS1-208ENST00000563857 RGL3Q3MIN7 710 aa23.53■■□□□ 1.36
RNPS1-208ENST00000563857 C14orf37Q86TY3 774 aa23.52■■□□□ 1.36
RNPS1-208ENST00000563857 STAC3Q96MF2 364 aa23.52■■□□□ 1.36
RNPS1-208ENST00000563857 SOCS7O14512 581 aa23.51■■□□□ 1.35
RNPS1-208ENST00000563857 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa23.5■■□□□ 1.35
RNPS1-208ENST00000563857 C19orf44Q9H6X5 657 aa23.48■■□□□ 1.35
RNPS1-208ENST00000563857 PPLO60437 1756 aa23.46■■□□□ 1.35
RNPS1-208ENST00000563857 CADPS2Q86UW7 1296 aa23.46■■□□□ 1.35
RNPS1-208ENST00000563857 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa23.45■■□□□ 1.34
RNPS1-208ENST00000563857 ATF3P18847 181 aa23.45■■□□□ 1.34
RNPS1-208ENST00000563857 METP08581 1390 aa23.43■■□□□ 1.34
RNPS1-208ENST00000563857 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
RNPS1-208ENST00000563857 FAM135BQ49AJ0 1406 aa23.42■■□□□ 1.34
RNPS1-208ENST00000563857 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
RNPS1-208ENST00000563857 ILDR2Q71H61 639 aa23.41■■□□□ 1.34
RNPS1-208ENST00000563857 SLAIN2Q9P270 581 aa23.41■■□□□ 1.34
RNPS1-208ENST00000563857 PTPRUQ92729 1446 aa23.41■■□□□ 1.34
RNPS1-208ENST00000563857 ALKQ9UM73 1620 aa23.41■■□□□ 1.34
RNPS1-208ENST00000563857 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa23.39■■□□□ 1.34
RNPS1-208ENST00000563857 HSPA1LP34931 641 aa23.39■■□□□ 1.33
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RNPS1-208ENST00000563857 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
RNPS1-208ENST00000563857 MYOM2P54296 1465 aa23.36■■□□□ 1.33
RNPS1-208ENST00000563857 PTCH1Q13635 1447 aa23.36■■□□□ 1.33
RNPS1-208ENST00000563857 PRAG1Q86YV5 1406 aa23.36■■□□□ 1.33
RNPS1-208ENST00000563857 IFT172Q9UG01 1749 aa23.35■■□□□ 1.33
RNPS1-208ENST00000563857 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
RNPS1-208ENST00000563857 DISP3Q9P2K9 1392 aa23.34■■□□□ 1.33
RNPS1-208ENST00000563857 PIK3C2GO75747 1445 aa23.33■■□□□ 1.33
RNPS1-208ENST00000563857 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
RNPS1-208ENST00000563857 DCAF11Q8TEB1 546 aa23.31■■□□□ 1.32
RNPS1-208ENST00000563857 SIRT1Q96EB6 747 aa23.31■■□□□ 1.32
RNPS1-208ENST00000563857 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
RNPS1-208ENST00000563857 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa23.3■■□□□ 1.32
RNPS1-208ENST00000563857 NRXN1Q9ULB1 1477 aa23.3■■□□□ 1.32
RNPS1-208ENST00000563857 ABCC11Q96J66 1382 aa23.29■■□□□ 1.32
RNPS1-208ENST00000563857 LAMC1P11047 1609 aa23.29■■□□□ 1.32
RNPS1-208ENST00000563857 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
RNPS1-208ENST00000563857 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
RNPS1-208ENST00000563857 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa23.26■■□□□ 1.31
RNPS1-208ENST00000563857 TECPR2O15040 1411 aa23.25■■□□□ 1.31
RNPS1-208ENST00000563857 STK26Q9P289 416 aa23.25■■□□□ 1.31
RNPS1-208ENST00000563857 ROBO2Q9HCK4 1378 aa23.25■■□□□ 1.31
RNPS1-208ENST00000563857 CFAP70Q5T0N1 1121 aa23.24■■□□□ 1.31
RNPS1-208ENST00000563857 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa23.24■■□□□ 1.31
RNPS1-208ENST00000563857 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
RNPS1-208ENST00000563857 TMEM132EQ6IEE7 984 aa23.23■■□□□ 1.31
RNPS1-208ENST00000563857 MST1RQ04912 1400 aa23.17■■□□□ 1.3
RNPS1-208ENST00000563857 KNDC1Q76NI1 1749 aa23.17■■□□□ 1.3
RNPS1-208ENST00000563857 BRINP3Q76B58 766 aa23.17■■□□□ 1.3
RNPS1-208ENST00000563857 POGKQ9P215 609 aa23.16■■□□□ 1.3
RNPS1-208ENST00000563857 JCADQ9P266 1359 aa23.14■■□□□ 1.3
RNPS1-208ENST00000563857 WAPLQ7Z5K2 1190 aa23.14■■□□□ 1.29
RNPS1-208ENST00000563857 NALCNQ8IZF0 1738 aa23.13■■□□□ 1.29
RNPS1-208ENST00000563857 DLC1Q96QB1 1528 aa23.13■■□□□ 1.29
RNPS1-208ENST00000563857 PHLPP1O60346 1717 aa23.12■■□□□ 1.29
RNPS1-208ENST00000563857 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa23.12■■□□□ 1.29
RNPS1-208ENST00000563857 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
RNPS1-208ENST00000563857 C1orf167Q5SNV9 1468 aa23.11■■□□□ 1.29
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