RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554292.1

PCNX1-206, Transcript of pecanex 1, humanhuman

TSL 4

Gene PCNX1, Length 402 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1-206ENST00000554292 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP41.99■■■■■ 4.31
PCNX1-206ENST00000554292 CCDC144AA2RUR9 1427 aa41.96■■■■■ 4.31
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PCNX1-206ENST00000554292 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP41.95■■■■■ 4.31
PCNX1-206ENST00000554292 LTBP4Q8N2S1 1624 aa41.95■■■■■ 4.31
PCNX1-206ENST00000554292 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP41.94■■■■■ 4.3
PCNX1-206ENST00000554292 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP41.91■■■■■ 4.3
PCNX1-206ENST00000554292 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa41.89■■■■■ 4.3
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PCNX1-206ENST00000554292 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa41.81■■■■■ 4.28
PCNX1-206ENST00000554292 IQSEC2Q5JU85 1478 aa41.78■■■■■ 4.28
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PCNX1-206ENST00000554292 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa41.76■■■■■ 4.28
PCNX1-206ENST00000554292 DIP2AQ14689 1571 aa41.76■■■■■ 4.27
PCNX1-206ENST00000554292 SLC26A8Q96RN1 970 aa41.74■■■■■ 4.27
PCNX1-206ENST00000554292 PPLO60437 1756 aa41.73■■■■■ 4.27
PCNX1-206ENST00000554292 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa41.73■■■■■ 4.27
PCNX1-206ENST00000554292 STRCP1A6NGW2 1772 aa41.72■■■■■ 4.27
PCNX1-206ENST00000554292 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa41.71■■■■■ 4.27
PCNX1-206ENST00000554292 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa41.69■■■■■ 4.26
PCNX1-206ENST00000554292 VGFO15240 615 aaPredicted RBP41.66■■■■■ 4.26
PCNX1-206ENST00000554292 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP41.66■■■■■ 4.26
PCNX1-206ENST00000554292 TBX22Q9Y458 520 aa41.66■■■■■ 4.26
PCNX1-206ENST00000554292 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa41.66■■■■■ 4.26
PCNX1-206ENST00000554292 IFT172Q9UG01 1749 aa41.64■■■■■ 4.26
PCNX1-206ENST00000554292 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa41.63■■■■■ 4.26
PCNX1-206ENST00000554292 NWD1Q149M9 1564 aa41.63■■■■■ 4.25
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PCNX1-206ENST00000554292 FBXO41Q8TF61 875 aa41.61■■■■■ 4.25
PCNX1-206ENST00000554292 KCNA6P17658 529 aa41.6■■■■■ 4.25
PCNX1-206ENST00000554292 PIK3R4Q99570 1358 aa41.59■■■■■ 4.25
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PCNX1-206ENST00000554292 ALKQ9UM73 1620 aa41.44■■■■■ 4.22
PCNX1-206ENST00000554292 MYOM2P54296 1465 aa41.43■■■■■ 4.22
PCNX1-206ENST00000554292 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP41.41■■■■■ 4.22
PCNX1-206ENST00000554292 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa41.4■■■■■ 4.22
PCNX1-206ENST00000554292 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP41.39■■■■■ 4.22
PCNX1-206ENST00000554292 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP41.39■■■■■ 4.22
PCNX1-206ENST00000554292 METP08581 1390 aa41.37■■■■■ 4.21
PCNX1-206ENST00000554292 TMEM94Q12767 1356 aa41.37■■■■■ 4.21
PCNX1-206ENST00000554292 PIK3C2GO75747 1445 aa41.35■■■■■ 4.21
PCNX1-206ENST00000554292 PTPRUQ92729 1446 aa41.35■■■■■ 4.21
PCNX1-206ENST00000554292 UBAP1LF5GYI3 381 aa41.35■■■■■ 4.21
PCNX1-206ENST00000554292 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa41.35■■■■■ 4.21
PCNX1-206ENST00000554292 STAC3Q96MF2 364 aa41.33■■■■■ 4.21
PCNX1-206ENST00000554292 NRXN1Q9ULB1 1477 aa41.33■■■■■ 4.21
PCNX1-206ENST00000554292 TOM1O60784 492 aa41.32■■■■■ 4.21
PCNX1-206ENST00000554292 LAMC1P11047 1609 aa41.32■■■■■ 4.2
PCNX1-206ENST00000554292 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa41.28■■■■■ 4.2
PCNX1-206ENST00000554292 DCAF11Q8TEB1 546 aa41.25■■■■■ 4.19
PCNX1-206ENST00000554292 PCGF6Q9BYE7 350 aa41.25■■■■■ 4.19
PCNX1-206ENST00000554292 MSH6P52701 1360 aa41.22■■■■■ 4.19
PCNX1-206ENST00000554292 PRAG1Q86YV5 1406 aa41.2■■■■■ 4.19
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PCNX1-206ENST00000554292 C14orf37Q86TY3 774 aa41.17■■■■■ 4.18
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PCNX1-206ENST00000554292 KNDC1Q76NI1 1749 aa41.13■■■■■ 4.18
PCNX1-206ENST00000554292 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP41.12■■■■■ 4.17
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PCNX1-206ENST00000554292 CFAP70Q5T0N1 1121 aa41.09■■■■■ 4.17
PCNX1-206ENST00000554292 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP41.09■■■■■ 4.17
PCNX1-206ENST00000554292 NEUROD1Q13562 356 aa41.08■■■■■ 4.17
PCNX1-206ENST00000554292 TECPR2O15040 1411 aa41.08■■■■■ 4.17
PCNX1-206ENST00000554292 C19orf44Q9H6X5 657 aa41.07■■■■■ 4.17
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PCNX1-206ENST00000554292 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP41.06■■■■■ 4.16
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PCNX1-206ENST00000554292 TMEM132EQ6IEE7 984 aa41.05■■■■■ 4.16
PCNX1-206ENST00000554292 DCCP43146 1447 aa41.04■■■■■ 4.16
PCNX1-206ENST00000554292 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa41.03■■■■■ 4.16
PCNX1-206ENST00000554292 NALCNQ8IZF0 1738 aa41.02■■■■■ 4.16
PCNX1-206ENST00000554292 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa41.02■■■■■ 4.16
PCNX1-206ENST00000554292 STK26Q9P289 416 aa41.02■■■■■ 4.16
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PCNX1-206ENST00000554292 ATF3P18847 181 aa41■■■■■ 4.15
PCNX1-206ENST00000554292 ADGRB1O14514 1584 aa40.99■■■■■ 4.15
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PCNX1-206ENST00000554292 TONSLQ96HA7 1378 aa40.9■■■■■ 4.14
PCNX1-206ENST00000554292 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa40.9■■■■■ 4.14
PCNX1-206ENST00000554292 CLSPNQ9HAW4 1339 aa40.84■■■■■ 4.13
PCNX1-206ENST00000554292 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa40.83■■■■■ 4.13
PCNX1-206ENST00000554292 WAPLQ7Z5K2 1190 aa40.83■■■■■ 4.13
PCNX1-206ENST00000554292 MST1RQ04912 1400 aa40.8■■■■■ 4.12
PCNX1-206ENST00000554292 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa40.79■■■■■ 4.12
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