RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548746.5

CS-213, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 5

Gene CS, Length 551 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-213ENST00000548746 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa8.81□□□□□ -1
CS-213ENST00000548746 LTKP29376 864 aa8.81□□□□□ -1
CS-213ENST00000548746 IQSEC2Q5JU85 1478 aa8.81□□□□□ -1
CS-213ENST00000548746 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
CS-213ENST00000548746 RIMS2Q9UQ26 1411 aa8.8□□□□□ -1
CS-213ENST00000548746 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa8.8□□□□□ -1
CS-213ENST00000548746 DIP2AQ14689 1571 aa8.8□□□□□ -1
CS-213ENST00000548746 IFT172Q9UG01 1749 aa8.8□□□□□ -1
CS-213ENST00000548746 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa8.8□□□□□ -1
CS-213ENST00000548746 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa8.8□□□□□ -1
CS-213ENST00000548746 PPLO60437 1756 aa8.79□□□□□ -1
CS-213ENST00000548746 NWD1Q149M9 1564 aa8.79□□□□□ -1
CS-213ENST00000548746 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa8.79□□□□□ -1
CS-213ENST00000548746 STAG3Q9UJ98 1225 aa8.79□□□□□ -1
CS-213ENST00000548746 CPS1P31327 1500 aa8.79□□□□□ -1
CS-213ENST00000548746 CCDC144AA2RUR9 1427 aa8.79□□□□□ -1
CS-213ENST00000548746 STRCP1A6NGW2 1772 aa8.78□□□□□ -1
CS-213ENST00000548746 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa8.78□□□□□ -1
CS-213ENST00000548746 TXNDC2Q86VQ3 553 aa8.78□□□□□ -1
CS-213ENST00000548746 EID1Q9Y6B2 187 aa8.78□□□□□ -1
CS-213ENST00000548746 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
CS-213ENST00000548746 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP8.77□□□□□ -1.01
CS-213ENST00000548746 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-213ENST00000548746 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
CS-213ENST00000548746 HDGFP51858 240 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
CS-213ENST00000548746 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-213ENST00000548746 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
CS-213ENST00000548746 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
CS-213ENST00000548746 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
CS-213ENST00000548746 PIK3R4Q99570 1358 aa8.74□□□□□ -1.01
CS-213ENST00000548746 PRAG1Q86YV5 1406 aa8.74□□□□□ -1.01
CS-213ENST00000548746 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
CS-213ENST00000548746 MYOM2P54296 1465 aa8.74□□□□□ -1.01
CS-213ENST00000548746 NRXN1Q9ULB1 1477 aa8.74□□□□□ -1.01
CS-213ENST00000548746 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
CS-213ENST00000548746 CERKQ8TCT0 537 aa8.73□□□□□ -1.01
CS-213ENST00000548746 TBX22Q9Y458 520 aa8.73□□□□□ -1.01
CS-213ENST00000548746 LRRC7Q96NW7 1537 aa8.73□□□□□ -1.01
CS-213ENST00000548746 CHGAP10645 457 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
CS-213ENST00000548746 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
CS-213ENST00000548746 KCNA6P17658 529 aa8.71□□□□□ -1.02
CS-213ENST00000548746 LAMC1P11047 1609 aa8.71□□□□□ -1.02
CS-213ENST00000548746 ALKQ9UM73 1620 aa8.71□□□□□ -1.02
CS-213ENST00000548746 PIK3C2GO75747 1445 aa8.71□□□□□ -1.02
CS-213ENST00000548746 VGFO15240 615 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
CS-213ENST00000548746 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
CS-213ENST00000548746 SLC26A8Q96RN1 970 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-213ENST00000548746 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
CS-213ENST00000548746 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-213ENST00000548746 PTPRUQ92729 1446 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-213ENST00000548746 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-213ENST00000548746 KNDC1Q76NI1 1749 aa8.68□□□□□ -1.02
CS-213ENST00000548746 FBXO41Q8TF61 875 aa8.68□□□□□ -1.02
CS-213ENST00000548746 METP08581 1390 aa8.68□□□□□ -1.02
CS-213ENST00000548746 PTCH1Q13635 1447 aa8.68□□□□□ -1.02
CS-213ENST00000548746 TECPR2O15040 1411 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-213ENST00000548746 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
CS-213ENST00000548746 STAC3Q96MF2 364 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-213ENST00000548746 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-213ENST00000548746 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-213ENST00000548746 ADGRB1O14514 1584 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-213ENST00000548746 TMEM94Q12767 1356 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-213ENST00000548746 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
CS-213ENST00000548746 DCCP43146 1447 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-213ENST00000548746 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
CS-213ENST00000548746 RGL3Q3MIN7 710 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-213ENST00000548746 BCANQ96GW7 911 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-213ENST00000548746 NALCNQ8IZF0 1738 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-213ENST00000548746 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
CS-213ENST00000548746 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
CS-213ENST00000548746 KCNA4P22459 653 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-213ENST00000548746 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-213ENST00000548746 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
CS-213ENST00000548746 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-213ENST00000548746 DLC1Q96QB1 1528 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-213ENST00000548746 ABCC11Q96J66 1382 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-213ENST00000548746 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
CS-213ENST00000548746 FAM135BQ49AJ0 1406 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-213ENST00000548746 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-213ENST00000548746 ROBO2Q9HCK4 1378 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-213ENST00000548746 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
CS-213ENST00000548746 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
CS-213ENST00000548746 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-213ENST00000548746 MSH6P52701 1360 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-213ENST00000548746 CLSPNQ9HAW4 1339 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-213ENST00000548746 TOM1O60784 492 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-213ENST00000548746 DCAF11Q8TEB1 546 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-213ENST00000548746 SIRT1Q96EB6 747 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-213ENST00000548746 UBAP1LF5GYI3 381 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-213ENST00000548746 ADGRB2O60241 1585 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-213ENST00000548746 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
CS-213ENST00000548746 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa8.58□□□□□ -1.04
CS-213ENST00000548746 CFAP70Q5T0N1 1121 aa8.58□□□□□ -1.04
CS-213ENST00000548746 SIN3AQ96ST3 1273 aa8.58□□□□□ -1.04
CS-213ENST00000548746 C19orf44Q9H6X5 657 aa8.58□□□□□ -1.04
CS-213ENST00000548746 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa8.58□□□□□ -1.04
CS-213ENST00000548746 MST1RQ04912 1400 aa8.57□□□□□ -1.04
CS-213ENST00000548746 CADPS2Q86UW7 1296 aa8.57□□□□□ -1.04
CS-213ENST00000548746 L3MBTL2Q969R5 705 aa8.57□□□□□ -1.04
CS-213ENST00000548746 PCGF6Q9BYE7 350 aa8.57□□□□□ -1.04
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