RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547298.5

CS-208, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 656 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-208ENST00000547298 AFF2P51816 1311 aa18.19■□□□□ 0.5
CS-208ENST00000547298 NOS1P29475 1434 aa18.17■□□□□ 0.5
CS-208ENST00000547298 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
CS-208ENST00000547298 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
CS-208ENST00000547298 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
CS-208ENST00000547298 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
CS-208ENST00000547298 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP18.16■□□□□ 0.56e-9■□□□□ 10
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CS-208ENST00000547298 BCANQ96GW7 911 aa18.13■□□□□ 0.49
CS-208ENST00000547298 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
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CS-208ENST00000547298 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
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CS-208ENST00000547298 TBX22Q9Y458 520 aa18.12■□□□□ 0.49
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CS-208ENST00000547298 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
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CS-208ENST00000547298 C14orf37Q86TY3 774 aa18.07■□□□□ 0.48
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CS-208ENST00000547298 C8orf37Q96NL8 207 aa18.06■□□□□ 0.48
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CS-208ENST00000547298 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP18.04■□□□□ 0.48
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CS-208ENST00000547298 PIK3R4Q99570 1358 aa18.01■□□□□ 0.47
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CS-208ENST00000547298 CROCC2H7BZ55 1655 aa18■□□□□ 0.47
CS-208ENST00000547298 MST1RQ04912 1400 aa18■□□□□ 0.47
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CS-208ENST00000547298 DAPK1P53355 1430 aa17.97■□□□□ 0.47
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CS-208ENST00000547298 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP17.92■□□□□ 0.46
CS-208ENST00000547298 TRPM2O94759 1503 aa17.92■□□□□ 0.46
CS-208ENST00000547298 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa17.91■□□□□ 0.46
CS-208ENST00000547298 CCDC125Q86Z20 511 aa17.9■□□□□ 0.46
CS-208ENST00000547298 PTPN23Q9H3S7 1636 aa17.9■□□□□ 0.46
CS-208ENST00000547298 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP17.89■□□□□ 0.45
CS-208ENST00000547298 VPS8Q8N3P4 1428 aa17.89■□□□□ 0.45
CS-208ENST00000547298 CHGAP10645 457 aaKnown RBP17.88■□□□□ 0.45
CS-208ENST00000547298 UNC13BO14795 1591 aa17.87■□□□□ 0.45
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CS-208ENST00000547298 BCL9LQ86UU0 1499 aa17.84■□□□□ 0.45
CS-208ENST00000547298 PTCH1Q13635 1447 aa17.84■□□□□ 0.45
CS-208ENST00000547298 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa17.84■□□□□ 0.45
CS-208ENST00000547298 C1orf167Q5SNV9 1468 aa17.83■□□□□ 0.45
CS-208ENST00000547298 METP08581 1390 aa17.83■□□□□ 0.45
CS-208ENST00000547298 ADGRL2O95490 1459 aa17.82■□□□□ 0.44
CS-208ENST00000547298 LRP5O75197 1615 aa17.82■□□□□ 0.44
CS-208ENST00000547298 DEFB132Q7Z7B7 95 aa17.81■□□□□ 0.44
CS-208ENST00000547298 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa17.81■□□□□ 0.44
CS-208ENST00000547298 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP17.8■□□□□ 0.44
CS-208ENST00000547298 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP17.79■□□□□ 0.44
CS-208ENST00000547298 ORAI2Q96SN7 254 aa17.79■□□□□ 0.44
CS-208ENST00000547298 NALCNQ8IZF0 1738 aa17.78■□□□□ 0.44
CS-208ENST00000547298 MYOM2P54296 1465 aa17.78■□□□□ 0.44
CS-208ENST00000547298 E9PCH4 1651 aa17.77■□□□□ 0.44
CS-208ENST00000547298 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP17.77■□□□□ 0.44
CS-208ENST00000547298 GLI3P10071 1580 aa17.72■□□□□ 0.43
CS-208ENST00000547298 RALGAPBQ86X10 1494 aa17.7■□□□□ 0.42
CS-208ENST00000547298 HRCP23327 699 aa17.7■□□□□ 0.42
CS-208ENST00000547298 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP17.68■□□□□ 0.42
CS-208ENST00000547298 IQGAP3Q86VI3 1631 aa17.68■□□□□ 0.42
CS-208ENST00000547298 SLIT2O94813 1529 aa17.67■□□□□ 0.42
CS-208ENST00000547298 ROBO2Q9HCK4 1378 aa17.67■□□□□ 0.42
CS-208ENST00000547298 UNC5CLQ8IV45 518 aa17.67■□□□□ 0.42
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