RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539804.1

PITX3-202, Transcript of paired like homeodomain 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PITX3, Length 1,187 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3-202ENST00000539804 RIMS2Q9UQ26 1411 aa36.07■■■■□ 3.36
PITX3-202ENST00000539804 ZFYVE9O95405 1425 aa36.05■■■■□ 3.36
PITX3-202ENST00000539804 BCANQ96GW7 911 aa36.04■■■■□ 3.36
PITX3-202ENST00000539804 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa36.02■■■■□ 3.36
PITX3-202ENST00000539804 MYO5BQ9ULV0 1848 aa35.99■■■■□ 3.35
PITX3-202ENST00000539804 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP35.95■■■■□ 3.35
PITX3-202ENST00000539804 MPHOSPH9Q99550 1183 aa35.95■■■■□ 3.35
PITX3-202ENST00000539804 HRCP23327 699 aa35.93■■■■□ 3.34
PITX3-202ENST00000539804 KIF1BO60333 1816 aa35.91■■■■□ 3.34
PITX3-202ENST00000539804 CLTCL1P53675 1640 aa35.9■■■■□ 3.34
PITX3-202ENST00000539804 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa35.89■■■■□ 3.34
PITX3-202ENST00000539804 UBAP1LF5GYI3 381 aa35.89■■■■□ 3.34
PITX3-202ENST00000539804 TOM1O60784 492 aa35.89■■■■□ 3.34
PITX3-202ENST00000539804 KCNA6P17658 529 aa35.89■■■■□ 3.34
PITX3-202ENST00000539804 SLC26A8Q96RN1 970 aa35.89■■■■□ 3.34
PITX3-202ENST00000539804 TBX22Q9Y458 520 aa35.89■■■■□ 3.34
PITX3-202ENST00000539804 DIP2AQ14689 1571 aa35.87■■■■□ 3.33
PITX3-202ENST00000539804 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa35.85■■■■□ 3.33
PITX3-202ENST00000539804 CCDC144AA2RUR9 1427 aa35.84■■■■□ 3.33
PITX3-202ENST00000539804 LRRC7Q96NW7 1537 aa35.83■■■■□ 3.33
PITX3-202ENST00000539804 PIK3R4Q99570 1358 aa35.83■■■■□ 3.33
PITX3-202ENST00000539804 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP35.8■■■■□ 3.32
PITX3-202ENST00000539804 STRCP1A6NGW2 1772 aa35.79■■■■□ 3.32
PITX3-202ENST00000539804 VGFO15240 615 aaPredicted RBP35.79■■■■□ 3.32
PITX3-202ENST00000539804 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP35.77■■■■□ 3.32
PITX3-202ENST00000539804 NWD1Q149M9 1564 aa35.76■■■■□ 3.32
PITX3-202ENST00000539804 FOXD1Q16676 465 aa35.74■■■■□ 3.31
PITX3-202ENST00000539804 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP35.73■■■■□ 3.31
PITX3-202ENST00000539804 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa35.73■■■■□ 3.31
PITX3-202ENST00000539804 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa35.73■■■■□ 3.31
PITX3-202ENST00000539804 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa35.72■■■■□ 3.31
PITX3-202ENST00000539804 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP35.69■■■■□ 3.3
PITX3-202ENST00000539804 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa35.66■■■■□ 3.3
PITX3-202ENST00000539804 TMEM94Q12767 1356 aa35.66■■■■□ 3.3
PITX3-202ENST00000539804 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP35.65■■■■□ 3.3
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PITX3-202ENST00000539804 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa35.62■■■■□ 3.29
PITX3-202ENST00000539804 MSH6P52701 1360 aa35.6■■■■□ 3.29
PITX3-202ENST00000539804 PIP4K2BP78356 416 aa35.59■■■■□ 3.29
PITX3-202ENST00000539804 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa35.58■■■■□ 3.29
PITX3-202ENST00000539804 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa35.57■■■■□ 3.28
PITX3-202ENST00000539804 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa35.57■■■■□ 3.28
PITX3-202ENST00000539804 PPLO60437 1756 aa35.56■■■■□ 3.28
PITX3-202ENST00000539804 RGL3Q3MIN7 710 aa35.55■■■■□ 3.28
PITX3-202ENST00000539804 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP35.54■■■■□ 3.28
PITX3-202ENST00000539804 C14orf37Q86TY3 774 aa35.51■■■■□ 3.28
PITX3-202ENST00000539804 METP08581 1390 aa35.47■■■■□ 3.27
PITX3-202ENST00000539804 STAC3Q96MF2 364 aa35.45■■■■□ 3.27
PITX3-202ENST00000539804 C19orf44Q9H6X5 657 aa35.45■■■■□ 3.27
PITX3-202ENST00000539804 PTPRUQ92729 1446 aa35.45■■■■□ 3.27
PITX3-202ENST00000539804 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP35.44■■■■□ 3.26
PITX3-202ENST00000539804 ALKQ9UM73 1620 aa35.44■■■■□ 3.26
PITX3-202ENST00000539804 CADPS2Q86UW7 1296 aa35.43■■■■□ 3.26
PITX3-202ENST00000539804 FAM135BQ49AJ0 1406 aa35.42■■■■□ 3.26
PITX3-202ENST00000539804 IFT172Q9UG01 1749 aa35.42■■■■□ 3.26
PITX3-202ENST00000539804 ATF3P18847 181 aa35.41■■■■□ 3.26
PITX3-202ENST00000539804 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP35.4■■■■□ 3.26
PITX3-202ENST00000539804 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa35.38■■■■□ 3.25
PITX3-202ENST00000539804 MYOM2P54296 1465 aa35.37■■■■□ 3.25
PITX3-202ENST00000539804 HSPA1LP34931 641 aa35.37■■■■□ 3.25
PITX3-202ENST00000539804 DCCP43146 1447 aa35.37■■■■□ 3.25
PITX3-202ENST00000539804 PTCH1Q13635 1447 aa35.37■■■■□ 3.25
PITX3-202ENST00000539804 PRAG1Q86YV5 1406 aa35.36■■■■□ 3.25
PITX3-202ENST00000539804 SLAIN2Q9P270 581 aa35.36■■■■□ 3.25
PITX3-202ENST00000539804 PIK3C2GO75747 1445 aa35.35■■■■□ 3.25
PITX3-202ENST00000539804 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP35.34■■■■□ 3.25
PITX3-202ENST00000539804 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP35.33■■■■□ 3.25
PITX3-202ENST00000539804 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP35.28■■■■□ 3.24
PITX3-202ENST00000539804 NRXN1Q9ULB1 1477 aa35.28■■■■□ 3.24
PITX3-202ENST00000539804 LAMC1P11047 1609 aa35.28■■■■□ 3.24
PITX3-202ENST00000539804 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP35.26■■■■□ 3.24
PITX3-202ENST00000539804 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa35.25■■■■□ 3.23
PITX3-202ENST00000539804 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa35.23■■■■□ 3.23
PITX3-202ENST00000539804 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP35.23■■■■□ 3.23
PITX3-202ENST00000539804 DCAF11Q8TEB1 546 aa35.21■■■■□ 3.23
PITX3-202ENST00000539804 ABCC11Q96J66 1382 aa35.21■■■■□ 3.23
PITX3-202ENST00000539804 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP35.2■■■■□ 3.23
PITX3-202ENST00000539804 TECPR2O15040 1411 aa35.2■■■■□ 3.23
PITX3-202ENST00000539804 ROBO2Q9HCK4 1378 aa35.19■■■■□ 3.22
PITX3-202ENST00000539804 SIRT1Q96EB6 747 aa35.17■■■■□ 3.22
PITX3-202ENST00000539804 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP35.15■■■■□ 3.22
PITX3-202ENST00000539804 KNDC1Q76NI1 1749 aa35.13■■■■□ 3.21
PITX3-202ENST00000539804 STK26Q9P289 416 aa35.13■■■■□ 3.21
PITX3-202ENST00000539804 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa35.13■■■■□ 3.21
PITX3-202ENST00000539804 CFAP70Q5T0N1 1121 aa35.12■■■■□ 3.21
PITX3-202ENST00000539804 TMEM132EQ6IEE7 984 aa35.11■■■■□ 3.21
PITX3-202ENST00000539804 DISP3Q9P2K9 1392 aa35.11■■■■□ 3.21
PITX3-202ENST00000539804 NALCNQ8IZF0 1738 aa35.1■■■■□ 3.21
PITX3-202ENST00000539804 MST1RQ04912 1400 aa35.08■■■■□ 3.21
PITX3-202ENST00000539804 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa35.06■■■■□ 3.2
PITX3-202ENST00000539804 PHLPP1O60346 1717 aa35.03■■■■□ 3.2
PITX3-202ENST00000539804 BRINP3Q76B58 766 aa35.03■■■■□ 3.2
PITX3-202ENST00000539804 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP35.02■■■■□ 3.2
PITX3-202ENST00000539804 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa35■■■■□ 3.19
PITX3-202ENST00000539804 DLC1Q96QB1 1528 aa35■■■■□ 3.19
PITX3-202ENST00000539804 JCADQ9P266 1359 aa34.99■■■■□ 3.19
PITX3-202ENST00000539804 C1orf167Q5SNV9 1468 aa34.98■■■■□ 3.19
PITX3-202ENST00000539804 WAPLQ7Z5K2 1190 aa34.98■■■■□ 3.19
PITX3-202ENST00000539804 POGKQ9P215 609 aa34.96■■■■□ 3.19
PITX3-202ENST00000539804 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP34.96■■■■□ 3.19
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