RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532751.1

PTPRK-222, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, human

TSL 4

Gene PTPRK, Length 563 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRK-222	ENST00000532751	CERK	Q8TCT0	537 aa		32.54	■■■□□ 2.8
PTPRK-222	ENST00000532751	ZFYVE9	O95405	1425 aa		32.52	■■■□□ 2.8
PTPRK-222	ENST00000532751	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	32.51	■■■□□ 2.79
PTPRK-222	ENST00000532751	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	32.5	■■■□□ 2.79
PTPRK-222	ENST00000532751	FOXD1	Q16676	465 aa		32.5	■■■□□ 2.79
PTPRK-222	ENST00000532751	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	32.46	■■■□□ 2.79
PTPRK-222	ENST00000532751	BCAN	Q96GW7	911 aa		32.45	■■■□□ 2.79
PTPRK-222	ENST00000532751	PLEKHG1	Q9ULL1	1385 aa		32.43	■■■□□ 2.78
PTPRK-222	ENST00000532751	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		32.43	■■■□□ 2.78
PTPRK-222	ENST00000532751	CPS1	P31327	1500 aa		32.42	■■■□□ 2.78
PTPRK-222	ENST00000532751	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		32.4	■■■□□ 2.78
PTPRK-222	ENST00000532751	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	32.39	■■■□□ 2.78
PTPRK-222	ENST00000532751	FBXO41	Q8TF61	875 aa		32.37	■■■□□ 2.77
PTPRK-222	ENST00000532751	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		32.36	■■■□□ 2.77
PTPRK-222	ENST00000532751	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		32.35	■■■□□ 2.77
PTPRK-222	ENST00000532751	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		32.34	■■■□□ 2.77
PTPRK-222	ENST00000532751	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	32.33	■■■□□ 2.77
PTPRK-222	ENST00000532751	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	32.32	■■■□□ 2.76
PTPRK-222	ENST00000532751	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		32.3	■■■□□ 2.76
PTPRK-222	ENST00000532751	DIP2A	Q14689	1571 aa		32.3	■■■□□ 2.76
PTPRK-222	ENST00000532751	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	32.3	■■■□□ 2.76
PTPRK-222	ENST00000532751	PPL	O60437	1756 aa		32.27	■■■□□ 2.76
PTPRK-222	ENST00000532751	TBX22	Q9Y458	520 aa		32.27	■■■□□ 2.76
PTPRK-222	ENST00000532751	KCNA6	P17658	529 aa		32.25	■■■□□ 2.75
PTPRK-222	ENST00000532751	ADAMTS13	Q76LX8	1427 aa		32.25	■■■□□ 2.75
PTPRK-222	ENST00000532751	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	32.24	■■■□□ 2.75
PTPRK-222	ENST00000532751	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		32.24	■■■□□ 2.75
PTPRK-222	ENST00000532751	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	32.23	■■■□□ 2.75
PTPRK-222	ENST00000532751	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		32.23	■■■□□ 2.75
PTPRK-222	ENST00000532751	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		32.22	■■■□□ 2.75
PTPRK-222	ENST00000532751	NWD1	Q149M9	1564 aa		32.22	■■■□□ 2.75
PTPRK-222	ENST00000532751	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		32.22	■■■□□ 2.75
PTPRK-222	ENST00000532751	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		32.21	■■■□□ 2.75
PTPRK-222	ENST00000532751	RGL3	Q3MIN7	710 aa		32.21	■■■□□ 2.75
PTPRK-222	ENST00000532751	PIK3R4	Q99570	1358 aa		32.19	■■■□□ 2.74
PTPRK-222	ENST00000532751	IFT172	Q9UG01	1749 aa		32.17	■■■□□ 2.74
PTPRK-222	ENST00000532751	NKTR	P30414	1462 aa	Known RBP	32.16	■■■□□ 2.74
PTPRK-222	ENST00000532751	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	32.12	■■■□□ 2.73
PTPRK-222	ENST00000532751	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		32.12	■■■□□ 2.73
PTPRK-222	ENST00000532751	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	32.11	■■■□□ 2.73
PTPRK-222	ENST00000532751	TOM1	O60784	492 aa		32.07	■■■□□ 2.72
PTPRK-222	ENST00000532751	TMEM94	Q12767	1356 aa		32.07	■■■□□ 2.72
PTPRK-222	ENST00000532751	ALK	Q9UM73	1620 aa		32.06	■■■□□ 2.72
PTPRK-222	ENST00000532751	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		32.05	■■■□□ 2.72
PTPRK-222	ENST00000532751	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	32.05	■■■□□ 2.72
PTPRK-222	ENST00000532751	ADGRF5	Q8IZF2	1346 aa		32.04	■■■□□ 2.72
PTPRK-222	ENST00000532751	PTPRU	Q92729	1446 aa		32.03	■■■□□ 2.72
PTPRK-222	ENST00000532751	MET	P08581	1390 aa		32.03	■■■□□ 2.72
PTPRK-222	ENST00000532751	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	32.02	■■■□□ 2.72
PTPRK-222	ENST00000532751	MYOM2	P54296	1465 aa		32	■■■□□ 2.71
PTPRK-222	ENST00000532751	RBM33	Q96EV2	1170 aa	Known RBP	31.97	■■■□□ 2.71
PTPRK-222	ENST00000532751	PIK3C2G	O75747	1445 aa		31.97	■■■□□ 2.71
PTPRK-222	ENST00000532751	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		31.97	■■■□□ 2.71
PTPRK-222	ENST00000532751	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	31.95	■■■□□ 2.7
PTPRK-222	ENST00000532751	MSH6	P52701	1360 aa		31.94	■■■□□ 2.7
PTPRK-222	ENST00000532751	NRXN1	Q9ULB1	1477 aa		31.93	■■■□□ 2.7
PTPRK-222	ENST00000532751	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	31.93	■■■□□ 2.7
PTPRK-222	ENST00000532751	PIP4K2B	P78356	416 aa		31.92	■■■□□ 2.7
PTPRK-222	ENST00000532751	C14orf37	Q86TY3	774 aa		31.92	■■■□□ 2.7
PTPRK-222	ENST00000532751	STAC3	Q96MF2	364 aa		31.92	■■■□□ 2.7
PTPRK-222	ENST00000532751	LAMC1	P11047	1609 aa		31.91	■■■□□ 2.7
PTPRK-222	ENST00000532751	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		31.91	■■■□□ 2.7
PTPRK-222	ENST00000532751	KDM2A	Q9Y2K7	1162 aa		31.88	■■■□□ 2.69
PTPRK-222	ENST00000532751	PTCH1	Q13635	1447 aa		31.86	■■■□□ 2.69
PTPRK-222	ENST00000532751	C14orf93	Q9H972	538 aa	Known RBP	31.85	■■■□□ 2.69
PTPRK-222	ENST00000532751	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		31.83	■■■□□ 2.69
PTPRK-222	ENST00000532751	SIPA1L2	Q9P2F8	1722 aa	Predicted RBP	31.83	■■■□□ 2.69
PTPRK-222	ENST00000532751	C19orf44	Q9H6X5	657 aa		31.83	■■■□□ 2.69
PTPRK-222	ENST00000532751	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		31.81	■■■□□ 2.68
PTPRK-222	ENST00000532751	CFAP70	Q5T0N1	1121 aa		31.81	■■■□□ 2.68
PTPRK-222	ENST00000532751	TMEM132E	Q6IEE7	984 aa		31.8	■■■□□ 2.68
PTPRK-222	ENST00000532751	KNDC1	Q76NI1	1749 aa		31.8	■■■□□ 2.68
PTPRK-222	ENST00000532751	LRPPRC	P42704	1394 aa	Known RBP	31.8	■■■□□ 2.68
PTPRK-222	ENST00000532751	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		31.79	■■■□□ 2.68
PTPRK-222	ENST00000532751	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		31.79	■■■□□ 2.68
PTPRK-222	ENST00000532751	ATF3	P18847	181 aa		31.78	■■■□□ 2.68
PTPRK-222	ENST00000532751	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		31.78	■■■□□ 2.68
PTPRK-222	ENST00000532751	CADPS2	Q86UW7	1296 aa		31.77	■■■□□ 2.68
PTPRK-222	ENST00000532751	STK26	Q9P289	416 aa		31.77	■■■□□ 2.68
PTPRK-222	ENST00000532751	YTHDC2	Q9H6S0	1430 aa	Known RBP	31.76	■■■□□ 2.68
PTPRK-222	ENST00000532751	NEUROD1	Q13562	356 aa		31.76	■■■□□ 2.67
PTPRK-222	ENST00000532751	TECPR2	O15040	1411 aa		31.75	■■■□□ 2.67
PTPRK-222	ENST00000532751	DCC	P43146	1447 aa		31.75	■■■□□ 2.67
PTPRK-222	ENST00000532751	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		31.75	■■■□□ 2.67
PTPRK-222	ENST00000532751	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		31.75	■■■□□ 2.67
PTPRK-222	ENST00000532751	ABCC11	Q96J66	1382 aa		31.75	■■■□□ 2.67
PTPRK-222	ENST00000532751	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		31.74	■■■□□ 2.67
PTPRK-222	ENST00000532751	SLAIN2	Q9P270	581 aa		31.73	■■■□□ 2.67
PTPRK-222	ENST00000532751	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		31.72	■■■□□ 2.67
PTPRK-222	ENST00000532751	HSPA1L	P34931	641 aa		31.69	■■■□□ 2.66
PTPRK-222	ENST00000532751	KIAA1210	Q9ULL0	1709 aa		31.68	■■■□□ 2.66
PTPRK-222	ENST00000532751	ADGRB1	O14514	1584 aa		31.68	■■■□□ 2.66
PTPRK-222	ENST00000532751	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		31.67	■■■□□ 2.66
PTPRK-222	ENST00000532751	SIRT1	Q96EB6	747 aa		31.66	■■■□□ 2.66
PTPRK-222	ENST00000532751	WAPL	Q7Z5K2	1190 aa		31.63	■■■□□ 2.65
PTPRK-222	ENST00000532751	DLC1	Q96QB1	1528 aa		31.63	■■■□□ 2.65
PTPRK-222	ENST00000532751	MST1R	Q04912	1400 aa		31.6	■■■□□ 2.65
PTPRK-222	ENST00000532751	PLEKHH1	Q9ULM0	1364 aa		31.59	■■■□□ 2.65
PTPRK-222	ENST00000532751	CDC42BPG	Q6DT37	1551 aa		31.58	■■■□□ 2.65
PTPRK-222	ENST00000532751	TRAK1	Q9UPV9	953 aa		31.57	■■■□□ 2.64

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