RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531226.5

PACSIN3-208, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, human

TSL 5

Gene PACSIN3, Length 654 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PACSIN3-208	ENST00000531226	FOXD1	Q16676	465 aa		28.21	■■■□□ 2.11
PACSIN3-208	ENST00000531226	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	28.16	■■■□□ 2.1
PACSIN3-208	ENST00000531226	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		28.14	■■■□□ 2.09
PACSIN3-208	ENST00000531226	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		28.13	■■■□□ 2.09
PACSIN3-208	ENST00000531226	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	28.13	■■■□□ 2.09
PACSIN3-208	ENST00000531226	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		28.13	■■■□□ 2.09
PACSIN3-208	ENST00000531226	PLEKHG1	Q9ULL1	1385 aa		28.11	■■■□□ 2.09
PACSIN3-208	ENST00000531226	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	28.11	■■■□□ 2.09
PACSIN3-208	ENST00000531226	PPL	O60437	1756 aa		28.11	■■■□□ 2.09
PACSIN3-208	ENST00000531226	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	28.1	■■■□□ 2.09
PACSIN3-208	ENST00000531226	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	28.09	■■■□□ 2.09
PACSIN3-208	ENST00000531226	CERK	Q8TCT0	537 aa		28.09	■■■□□ 2.09
PACSIN3-208	ENST00000531226	CPS1	P31327	1500 aa		28.08	■■■□□ 2.09
PACSIN3-208	ENST00000531226	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	28.08	■■■□□ 2.09
PACSIN3-208	ENST00000531226	IFT172	Q9UG01	1749 aa		28.06	■■■□□ 2.08
PACSIN3-208	ENST00000531226	DIP2A	Q14689	1571 aa		28.05	■■■□□ 2.08
PACSIN3-208	ENST00000531226	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		28.04	■■■□□ 2.08
PACSIN3-208	ENST00000531226	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		28.04	■■■□□ 2.08
PACSIN3-208	ENST00000531226	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	28.04	■■■□□ 2.08
PACSIN3-208	ENST00000531226	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	28.03	■■■□□ 2.08
PACSIN3-208	ENST00000531226	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		28.02	■■■□□ 2.08
PACSIN3-208	ENST00000531226	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		28.02	■■■□□ 2.08
PACSIN3-208	ENST00000531226	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		28	■■■□□ 2.07
PACSIN3-208	ENST00000531226	NWD1	Q149M9	1564 aa		28	■■■□□ 2.07
PACSIN3-208	ENST00000531226	BCAN	Q96GW7	911 aa		28	■■■□□ 2.07
PACSIN3-208	ENST00000531226	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		28	■■■□□ 2.07
PACSIN3-208	ENST00000531226	ADAMTS13	Q76LX8	1427 aa		28	■■■□□ 2.07
PACSIN3-208	ENST00000531226	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		27.97	■■■□□ 2.07
PACSIN3-208	ENST00000531226	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	27.97	■■■□□ 2.07
PACSIN3-208	ENST00000531226	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	27.96	■■■□□ 2.07
PACSIN3-208	ENST00000531226	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	27.93	■■■□□ 2.06
PACSIN3-208	ENST00000531226	FBXO41	Q8TF61	875 aa		27.93	■■■□□ 2.06
PACSIN3-208	ENST00000531226	TBX22	Q9Y458	520 aa		27.93	■■■□□ 2.06
PACSIN3-208	ENST00000531226	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		27.92	■■■□□ 2.06
PACSIN3-208	ENST00000531226	NKTR	P30414	1462 aa	Known RBP	27.9	■■■□□ 2.06
PACSIN3-208	ENST00000531226	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	27.9	■■■□□ 2.06
PACSIN3-208	ENST00000531226	PIK3R4	Q99570	1358 aa		27.89	■■■□□ 2.06
PACSIN3-208	ENST00000531226	KCNA6	P17658	529 aa		27.89	■■■□□ 2.06
PACSIN3-208	ENST00000531226	RGL3	Q3MIN7	710 aa		27.89	■■■□□ 2.06
PACSIN3-208	ENST00000531226	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	27.86	■■■□□ 2.05
PACSIN3-208	ENST00000531226	ALK	Q9UM73	1620 aa		27.85	■■■□□ 2.05
PACSIN3-208	ENST00000531226	MYOM2	P54296	1465 aa		27.83	■■■□□ 2.04
PACSIN3-208	ENST00000531226	PTPRU	Q92729	1446 aa		27.81	■■■□□ 2.04
PACSIN3-208	ENST00000531226	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	27.79	■■■□□ 2.04
PACSIN3-208	ENST00000531226	ADGRF5	Q8IZF2	1346 aa		27.79	■■■□□ 2.04
PACSIN3-208	ENST00000531226	MET	P08581	1390 aa		27.78	■■■□□ 2.04
PACSIN3-208	ENST00000531226	NRXN1	Q9ULB1	1477 aa		27.77	■■■□□ 2.04
PACSIN3-208	ENST00000531226	PIK3C2G	O75747	1445 aa		27.77	■■■□□ 2.04
PACSIN3-208	ENST00000531226	LAMC1	P11047	1609 aa		27.77	■■■□□ 2.04
PACSIN3-208	ENST00000531226	TMEM94	Q12767	1356 aa		27.76	■■■□□ 2.03
PACSIN3-208	ENST00000531226	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	27.75	■■■□□ 2.03
PACSIN3-208	ENST00000531226	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		27.73	■■■□□ 2.03
PACSIN3-208	ENST00000531226	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		27.72	■■■□□ 2.03
PACSIN3-208	ENST00000531226	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		27.7	■■■□□ 2.02
PACSIN3-208	ENST00000531226	KNDC1	Q76NI1	1749 aa		27.69	■■■□□ 2.02
PACSIN3-208	ENST00000531226	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		27.68	■■■□□ 2.02
PACSIN3-208	ENST00000531226	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		27.67	■■■□□ 2.02
PACSIN3-208	ENST00000531226	TOM1	O60784	492 aa		27.67	■■■□□ 2.02
PACSIN3-208	ENST00000531226	RBM33	Q96EV2	1170 aa	Known RBP	27.67	■■■□□ 2.02
PACSIN3-208	ENST00000531226	SIPA1L2	Q9P2F8	1722 aa	Predicted RBP	27.66	■■■□□ 2.02
PACSIN3-208	ENST00000531226	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		27.65	■■■□□ 2.02
PACSIN3-208	ENST00000531226	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		27.65	■■■□□ 2.02
PACSIN3-208	ENST00000531226	PTCH1	Q13635	1447 aa		27.65	■■■□□ 2.02
PACSIN3-208	ENST00000531226	STAC3	Q96MF2	364 aa		27.64	■■■□□ 2.02
PACSIN3-208	ENST00000531226	MSH6	P52701	1360 aa		27.63	■■■□□ 2.01
PACSIN3-208	ENST00000531226	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		27.63	■■■□□ 2.01
PACSIN3-208	ENST00000531226	C14orf93	Q9H972	538 aa	Known RBP	27.61	■■■□□ 2.01
PACSIN3-208	ENST00000531226	KDM2A	Q9Y2K7	1162 aa		27.61	■■■□□ 2.01
PACSIN3-208	ENST00000531226	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		27.6	■■■□□ 2.01
PACSIN3-208	ENST00000531226	KIAA1210	Q9ULL0	1709 aa		27.59	■■■□□ 2.01
PACSIN3-208	ENST00000531226	TECPR2	O15040	1411 aa		27.58	■■■□□ 2.01
PACSIN3-208	ENST00000531226	LRPPRC	P42704	1394 aa	Known RBP	27.58	■■■□□ 2.01
PACSIN3-208	ENST00000531226	CFAP70	Q5T0N1	1121 aa		27.57	■■■□□ 2
PACSIN3-208	ENST00000531226	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		27.57	■■■□□ 2
PACSIN3-208	ENST00000531226	ADGRB1	O14514	1584 aa		27.56	■■■□□ 2
PACSIN3-208	ENST00000531226	C14orf37	Q86TY3	774 aa		27.56	■■■□□ 2
PACSIN3-208	ENST00000531226	YTHDC2	Q9H6S0	1430 aa	Known RBP	27.56	■■■□□ 2
PACSIN3-208	ENST00000531226	PIP4K2B	P78356	416 aa		27.55	■■■□□ 2
PACSIN3-208	ENST00000531226	TMEM132E	Q6IEE7	984 aa		27.55	■■■□□ 2
PACSIN3-208	ENST00000531226	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	27.54	■■■□□ 2
PACSIN3-208	ENST00000531226	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		27.54	■■■□□ 2
PACSIN3-208	ENST00000531226	DCC	P43146	1447 aa		27.53	■■■□□ 2
PACSIN3-208	ENST00000531226	ABCC11	Q96J66	1382 aa		27.53	■■■□□ 2
PACSIN3-208	ENST00000531226	NEUROD1	Q13562	356 aa		27.53	■■■□□ 2
PACSIN3-208	ENST00000531226	C19orf44	Q9H6X5	657 aa		27.52	■■■□□ 2
PACSIN3-208	ENST00000531226	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		27.52	■■■□□ 2
PACSIN3-208	ENST00000531226	STK26	Q9P289	416 aa		27.5	■■□□□ 1.99
PACSIN3-208	ENST00000531226	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		27.49	■■□□□ 1.99
PACSIN3-208	ENST00000531226	DLC1	Q96QB1	1528 aa		27.48	■■□□□ 1.99
PACSIN3-208	ENST00000531226	CADPS2	Q86UW7	1296 aa		27.47	■■□□□ 1.99
PACSIN3-208	ENST00000531226	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		27.46	■■□□□ 1.99
PACSIN3-208	ENST00000531226	ARHGEF28	Q8N1W1	1705 aa	Known RBP	27.45	■■□□□ 1.99
PACSIN3-208	ENST00000531226	ATF3	P18847	181 aa		27.45	■■□□□ 1.98
PACSIN3-208	ENST00000531226	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		27.44	■■□□□ 1.98
PACSIN3-208	ENST00000531226	CDC42BPG	Q6DT37	1551 aa		27.43	■■□□□ 1.98
PACSIN3-208	ENST00000531226	SLAIN2	Q9P270	581 aa		27.43	■■□□□ 1.98
PACSIN3-208	ENST00000531226	SIRT1	Q96EB6	747 aa		27.42	■■□□□ 1.98
PACSIN3-208	ENST00000531226	PLEKHH1	Q9ULM0	1364 aa		27.41	■■□□□ 1.98
PACSIN3-208	ENST00000531226	MST1R	Q04912	1400 aa		27.41	■■□□□ 1.98
PACSIN3-208	ENST00000531226	WAPL	Q7Z5K2	1190 aa		27.4	■■□□□ 1.98

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms