RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525459.1

PTPRK-218, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRK, Length 1,722 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-218ENST00000525459 RIMS2Q9UQ26 1411 aa27.23■■□□□ 1.95
PTPRK-218ENST00000525459 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa27.23■■□□□ 1.95
PTPRK-218ENST00000525459 EID1Q9Y6B2 187 aa27.22■■□□□ 1.95
PTPRK-218ENST00000525459 ANKLE2Q86XL3 938 aa27.21■■□□□ 1.95
PTPRK-218ENST00000525459 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP27.21■■□□□ 1.95
PTPRK-218ENST00000525459 IQGAP1P46940 1657 aa27.21■■□□□ 1.95
PTPRK-218ENST00000525459 MED14O60244 1454 aa27.21■■□□□ 1.95
PTPRK-218ENST00000525459 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP27.21■■□□□ 1.95
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PTPRK-218ENST00000525459 MYOM2P54296 1465 aa27.15■■□□□ 1.94
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PTPRK-218ENST00000525459 DMRT2Q9Y5R5 561 aa27.13■■□□□ 1.93
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PTPRK-218ENST00000525459 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP27.13■■□□□ 1.93
PTPRK-218ENST00000525459 STAC3Q96MF2 364 aa27.13■■□□□ 1.93
PTPRK-218ENST00000525459 DIP2AQ14689 1571 aa27.12■■□□□ 1.93
PTPRK-218ENST00000525459 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa27.12■■□□□ 1.93
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PTPRK-218ENST00000525459 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa27.09■■□□□ 1.93
PTPRK-218ENST00000525459 SIN3AQ96ST3 1273 aa27.09■■□□□ 1.93
PTPRK-218ENST00000525459 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa27.07■■□□□ 1.92
PTPRK-218ENST00000525459 NRXN1Q9ULB1 1477 aa27.06■■□□□ 1.92
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PTPRK-218ENST00000525459 TONSLQ96HA7 1378 aa27.04■■□□□ 1.92
PTPRK-218ENST00000525459 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
PTPRK-218ENST00000525459 PIK3C2GO75747 1445 aa27.02■■□□□ 1.92
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PTPRK-218ENST00000525459 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa26.98■■□□□ 1.91
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PTPRK-218ENST00000525459 PIK3R4Q99570 1358 aa26.94■■□□□ 1.9
PTPRK-218ENST00000525459 TBX22Q9Y458 520 aa26.93■■□□□ 1.9
PTPRK-218ENST00000525459 NWD1Q149M9 1564 aa26.92■■□□□ 1.9
PTPRK-218ENST00000525459 PRAG1Q86YV5 1406 aa26.92■■□□□ 1.9
PTPRK-218ENST00000525459 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa26.9■■□□□ 1.9
PTPRK-218ENST00000525459 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa26.89■■□□□ 1.89
PTPRK-218ENST00000525459 SLC26A8Q96RN1 970 aa26.87■■□□□ 1.89
PTPRK-218ENST00000525459 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
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PTPRK-218ENST00000525459 ADGRB1O14514 1584 aa26.81■■□□□ 1.88
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PTPRK-218ENST00000525459 LTBP4Q8N2S1 1624 aa26.79■■□□□ 1.88
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PTPRK-218ENST00000525459 CFAP70Q5T0N1 1121 aa26.76■■□□□ 1.88
PTPRK-218ENST00000525459 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.88
PTPRK-218ENST00000525459 TECPR2O15040 1411 aa26.75■■□□□ 1.87
PTPRK-218ENST00000525459 PTCH1Q13635 1447 aa26.75■■□□□ 1.87
PTPRK-218ENST00000525459 PTPRUQ92729 1446 aa26.74■■□□□ 1.87
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PTPRK-218ENST00000525459 DLC1Q96QB1 1528 aa26.73■■□□□ 1.87
PTPRK-218ENST00000525459 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
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PTPRK-218ENST00000525459 ABCC11Q96J66 1382 aa26.7■■□□□ 1.87
PTPRK-218ENST00000525459 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
PTPRK-218ENST00000525459 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
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PTPRK-218ENST00000525459 IQSEC2Q5JU85 1478 aa26.69■■□□□ 1.86
PTPRK-218ENST00000525459 NBPF8Q3BBV2 869 aa26.68■■□□□ 1.86
PTPRK-218ENST00000525459 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa26.67■■□□□ 1.86
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PTPRK-218ENST00000525459 SIRT1Q96EB6 747 aa26.62■■□□□ 1.85
PTPRK-218ENST00000525459 NBPF1Q3BBV0 1214 aa26.61■■□□□ 1.85
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PTPRK-218ENST00000525459 STK26Q9P289 416 aa26.59■■□□□ 1.85
PTPRK-218ENST00000525459 TMEM94Q12767 1356 aa26.59■■□□□ 1.85
PTPRK-218ENST00000525459 CARD11Q9BXL7 1154 aa26.56■■□□□ 1.84
PTPRK-218ENST00000525459 QRICH2Q9H0J4 1663 aa26.56■■□□□ 1.84
PTPRK-218ENST00000525459 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa26.55■■□□□ 1.84
PTPRK-218ENST00000525459 ADGRB2O60241 1585 aa26.54■■□□□ 1.84
PTPRK-218ENST00000525459 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
PTPRK-218ENST00000525459 TRAK1Q9UPV9 953 aa26.54■■□□□ 1.84
PTPRK-218ENST00000525459 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
PTPRK-218ENST00000525459 DCCP43146 1447 aa26.54■■□□□ 1.84
PTPRK-218ENST00000525459 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa26.53■■□□□ 1.84
PTPRK-218ENST00000525459 MSH6P52701 1360 aa26.52■■□□□ 1.84
PTPRK-218ENST00000525459 CERKQ8TCT0 537 aa26.51■■□□□ 1.83
PTPRK-218ENST00000525459 POGKQ9P215 609 aa26.5■■□□□ 1.83
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