RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524864.1

RPS25-201, Transcript of ribosomal protein S25, humanhuman

TSL 2

Gene RPS25, Length 1,078 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS25-201ENST00000524864 ZFYVE9O95405 1425 aa20.53■□□□□ 0.88
RPS25-201ENST00000524864 RIMS2Q9UQ26 1411 aa20.53■□□□□ 0.88
RPS25-201ENST00000524864 UBAP1LF5GYI3 381 aa20.53■□□□□ 0.88
RPS25-201ENST00000524864 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP20.53■□□□□ 0.88
RPS25-201ENST00000524864 SLC26A8Q96RN1 970 aa20.53■□□□□ 0.88
RPS25-201ENST00000524864 BCANQ96GW7 911 aa20.52■□□□□ 0.88
RPS25-201ENST00000524864 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
RPS25-201ENST00000524864 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
RPS25-201ENST00000524864 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa20.48■□□□□ 0.87
RPS25-201ENST00000524864 KCNA6P17658 529 aa20.48■□□□□ 0.87
RPS25-201ENST00000524864 MPHOSPH9Q99550 1183 aa20.47■□□□□ 0.87
RPS25-201ENST00000524864 MYO5BQ9ULV0 1848 aa20.47■□□□□ 0.87
RPS25-201ENST00000524864 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
RPS25-201ENST00000524864 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa20.47■□□□□ 0.87
RPS25-201ENST00000524864 SETD5Q9C0A6 1442 aa20.46■□□□□ 0.87
RPS25-201ENST00000524864 TOM1O60784 492 aa20.46■□□□□ 0.87
RPS25-201ENST00000524864 LRRC7Q96NW7 1537 aa20.46■□□□□ 0.87
RPS25-201ENST00000524864 STRCP1A6NGW2 1772 aa20.46■□□□□ 0.87
RPS25-201ENST00000524864 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
RPS25-201ENST00000524864 TBX22Q9Y458 520 aa20.45■□□□□ 0.86
RPS25-201ENST00000524864 TRPM2O94759 1503 aa20.44■□□□□ 0.86
RPS25-201ENST00000524864 CLTCL1P53675 1640 aa20.41■□□□□ 0.86
RPS25-201ENST00000524864 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
RPS25-201ENST00000524864 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa20.38■□□□□ 0.85
RPS25-201ENST00000524864 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa20.38■□□□□ 0.85
RPS25-201ENST00000524864 PIP4K2BP78356 416 aa20.38■□□□□ 0.85
RPS25-201ENST00000524864 TMEM94Q12767 1356 aa20.35■□□□□ 0.85
RPS25-201ENST00000524864 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
RPS25-201ENST00000524864 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
RPS25-201ENST00000524864 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa20.34■□□□□ 0.85
RPS25-201ENST00000524864 HRCP23327 699 aa20.34■□□□□ 0.85
RPS25-201ENST00000524864 PIK3R4Q99570 1358 aa20.34■□□□□ 0.85
RPS25-201ENST00000524864 VGFO15240 615 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
RPS25-201ENST00000524864 ALKQ9UM73 1620 aa20.32■□□□□ 0.84
RPS25-201ENST00000524864 KIF1BO60333 1816 aa20.32■□□□□ 0.84
RPS25-201ENST00000524864 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
RPS25-201ENST00000524864 NWD1Q149M9 1564 aa20.31■□□□□ 0.84
RPS25-201ENST00000524864 CCDC144AA2RUR9 1427 aa20.31■□□□□ 0.84
RPS25-201ENST00000524864 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa20.31■□□□□ 0.84
RPS25-201ENST00000524864 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa20.31■□□□□ 0.84
RPS25-201ENST00000524864 DIP2AQ14689 1571 aa20.3■□□□□ 0.84
RPS25-201ENST00000524864 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
RPS25-201ENST00000524864 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa20.29■□□□□ 0.84
RPS25-201ENST00000524864 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
RPS25-201ENST00000524864 HSPA1LP34931 641 aa20.28■□□□□ 0.84
RPS25-201ENST00000524864 RGL3Q3MIN7 710 aa20.28■□□□□ 0.84
RPS25-201ENST00000524864 METP08581 1390 aa20.27■□□□□ 0.84
RPS25-201ENST00000524864 PTPRUQ92729 1446 aa20.27■□□□□ 0.83
RPS25-201ENST00000524864 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa20.26■□□□□ 0.83
RPS25-201ENST00000524864 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa20.25■□□□□ 0.83
RPS25-201ENST00000524864 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa20.25■□□□□ 0.83
RPS25-201ENST00000524864 MSH6P52701 1360 aa20.23■□□□□ 0.83
RPS25-201ENST00000524864 C14orf37Q86TY3 774 aa20.21■□□□□ 0.83
RPS25-201ENST00000524864 C19orf44Q9H6X5 657 aa20.21■□□□□ 0.83
RPS25-201ENST00000524864 SLAIN2Q9P270 581 aa20.21■□□□□ 0.83
RPS25-201ENST00000524864 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa20.2■□□□□ 0.82
RPS25-201ENST00000524864 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa20.2■□□□□ 0.82
RPS25-201ENST00000524864 FAM135BQ49AJ0 1406 aa20.19■□□□□ 0.82
RPS25-201ENST00000524864 PPLO60437 1756 aa20.17■□□□□ 0.82
RPS25-201ENST00000524864 ATF3P18847 181 aa20.15■□□□□ 0.82
RPS25-201ENST00000524864 CADPS2Q86UW7 1296 aa20.15■□□□□ 0.82
RPS25-201ENST00000524864 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
RPS25-201ENST00000524864 DISP3Q9P2K9 1392 aa20.1■□□□□ 0.81
RPS25-201ENST00000524864 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
RPS25-201ENST00000524864 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
RPS25-201ENST00000524864 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
RPS25-201ENST00000524864 ROBO2Q9HCK4 1378 aa20.08■□□□□ 0.81
RPS25-201ENST00000524864 PIK3C2GO75747 1445 aa20.08■□□□□ 0.8
RPS25-201ENST00000524864 IFT172Q9UG01 1749 aa20.07■□□□□ 0.8
RPS25-201ENST00000524864 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa20.07■□□□□ 0.8
RPS25-201ENST00000524864 TMEM132EQ6IEE7 984 aa20.07■□□□□ 0.8
RPS25-201ENST00000524864 PTCH1Q13635 1447 aa20.07■□□□□ 0.8
RPS25-201ENST00000524864 DCCP43146 1447 aa20.06■□□□□ 0.8
RPS25-201ENST00000524864 PRAG1Q86YV5 1406 aa20.06■□□□□ 0.8
RPS25-201ENST00000524864 STK26Q9P289 416 aa20.06■□□□□ 0.8
RPS25-201ENST00000524864 NRXN1Q9ULB1 1477 aa20.05■□□□□ 0.8
RPS25-201ENST00000524864 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa20.04■□□□□ 0.8
RPS25-201ENST00000524864 CFAP70Q5T0N1 1121 aa20.04■□□□□ 0.8
RPS25-201ENST00000524864 DCAF11Q8TEB1 546 aa20.04■□□□□ 0.8
RPS25-201ENST00000524864 MYOM2P54296 1465 aa20.04■□□□□ 0.8
RPS25-201ENST00000524864 STAC3Q96MF2 364 aa20.03■□□□□ 0.8
RPS25-201ENST00000524864 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa20.03■□□□□ 0.8
RPS25-201ENST00000524864 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
RPS25-201ENST00000524864 ABCC11Q96J66 1382 aa20.03■□□□□ 0.8
RPS25-201ENST00000524864 BRINP3Q76B58 766 aa20.02■□□□□ 0.8
RPS25-201ENST00000524864 MST1RQ04912 1400 aa20.01■□□□□ 0.79
RPS25-201ENST00000524864 WAPLQ7Z5K2 1190 aa20■□□□□ 0.79
RPS25-201ENST00000524864 SIRT1Q96EB6 747 aa20■□□□□ 0.79
RPS25-201ENST00000524864 TECPR2O15040 1411 aa19.99■□□□□ 0.79
RPS25-201ENST00000524864 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
RPS25-201ENST00000524864 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
RPS25-201ENST00000524864 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa19.97■□□□□ 0.79
RPS25-201ENST00000524864 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP19.97■□□□□ 0.79
RPS25-201ENST00000524864 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP19.96■□□□□ 0.79
RPS25-201ENST00000524864 ILDR2Q71H61 639 aa19.96■□□□□ 0.79
RPS25-201ENST00000524864 NALCNQ8IZF0 1738 aa19.96■□□□□ 0.79
RPS25-201ENST00000524864 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa19.94■□□□□ 0.78
RPS25-201ENST00000524864 PHLPP1O60346 1717 aa19.93■□□□□ 0.78
RPS25-201ENST00000524864 C1orf167Q5SNV9 1468 aa19.93■□□□□ 0.78
RPS25-201ENST00000524864 JCADQ9P266 1359 aa19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 800.2 ms