RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524481.5

PTPRK-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 3,157 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-216ENST00000524481 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa15.72■□□□□ 0.11
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PTPRK-216ENST00000524481 CDCA7LQ96GN5 454 aa15.72■□□□□ 0.11
PTPRK-216ENST00000524481 ADAMTS8Q9UP79 889 aa15.71■□□□□ 0.11
PTPRK-216ENST00000524481 ARAP3Q8WWN8 1544 aa15.71■□□□□ 0.11
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PTPRK-216ENST00000524481 WAPLQ7Z5K2 1190 aa15.7■□□□□ 0.1
PTPRK-216ENST00000524481 CLTCL1P53675 1640 aa15.69■□□□□ 0.1
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PTPRK-216ENST00000524481 SLC52A1Q9NWF4 448 aa15.69■□□□□ 0.1
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PTPRK-216ENST00000524481 SOX12O15370 315 aa15.64■□□□□ 0.09
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PTPRK-216ENST00000524481 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa15.63■□□□□ 0.09
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PTPRK-216ENST00000524481 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
PTPRK-216ENST00000524481 NUDCQ9Y266 331 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRK-216ENST00000524481 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
PTPRK-216ENST00000524481 TET3O43151 1660 aa15.61■□□□□ 0.09
PTPRK-216ENST00000524481 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
PTPRK-216ENST00000524481 APAF1O14727 1248 aa15.61■□□□□ 0.09
PTPRK-216ENST00000524481 ABCA6Q8N139 1617 aa15.61■□□□□ 0.09
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PTPRK-216ENST00000524481 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa15.59■□□□□ 0.09
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PTPRK-216ENST00000524481 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa15.58■□□□□ 0.09
PTPRK-216ENST00000524481 CCDC136Q96JN2 1154 aa15.58■□□□□ 0.08
PTPRK-216ENST00000524481 ABCC3O15438 1527 aa15.58■□□□□ 0.08
PTPRK-216ENST00000524481 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
PTPRK-216ENST00000524481 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa15.58■□□□□ 0.08
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PTPRK-216ENST00000524481 CDK19Q9BWU1 502 aa15.57■□□□□ 0.08
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PTPRK-216ENST00000524481 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP15.55■□□□□ 0.08
PTPRK-216ENST00000524481 RCAN3Q9UKA8 241 aa15.55■□□□□ 0.08
PTPRK-216ENST00000524481 ZMYM3Q14202 1370 aa15.55■□□□□ 0.08
PTPRK-216ENST00000524481 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa15.55■□□□□ 0.08
PTPRK-216ENST00000524481 SLC24A1O60721 1099 aa15.55■□□□□ 0.08
PTPRK-216ENST00000524481 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
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PTPRK-216ENST00000524481 CFAP74Q9C0B2 1584 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRK-216ENST00000524481 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa15.53■□□□□ 0.08
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PTPRK-216ENST00000524481 KIF1BO60333 1816 aa15.52■□□□□ 0.08
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PTPRK-216ENST00000524481 VWDEQ8N2E2 1590 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRK-216ENST00000524481 DIP2BQ9P265 1576 aa15.49■□□□□ 0.07
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PTPRK-216ENST00000524481 ERVK-7P63135 1459 aa15.49■□□□□ 0.07
PTPRK-216ENST00000524481 CFAP53Q96M91 514 aa15.48■□□□□ 0.07
PTPRK-216ENST00000524481 HDGFP51858 240 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
PTPRK-216ENST00000524481 PIK3C2GO75747 1445 aa15.48■□□□□ 0.07
PTPRK-216ENST00000524481 C14orf37Q86TY3 774 aa15.47■□□□□ 0.07
PTPRK-216ENST00000524481 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa15.47■□□□□ 0.07
PTPRK-216ENST00000524481 MROH2AA6NES4 1674 aa15.47■□□□□ 0.07
PTPRK-216ENST00000524481 EID1Q9Y6B2 187 aa15.47■□□□□ 0.07
PTPRK-216ENST00000524481 GOLGA2Q08379 1002 aa15.46■□□□□ 0.07
PTPRK-216ENST00000524481 ZRANB1Q9UGI0 708 aa15.46■□□□□ 0.07
PTPRK-216ENST00000524481 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa15.46■□□□□ 0.07
PTPRK-216ENST00000524481 CANXP27824 592 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
PTPRK-216ENST00000524481 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa15.46■□□□□ 0.07
PTPRK-216ENST00000524481 LTKP29376 864 aa15.46■□□□□ 0.06
PTPRK-216ENST00000524481 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
PTPRK-216ENST00000524481 BCL2L13Q9BXK5 485 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRK-216ENST00000524481 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
PTPRK-216ENST00000524481 BCL11AQ9H165 835 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRK-216ENST00000524481 RIMS2Q9UQ26 1411 aa15.44■□□□□ 0.06
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