RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517309.5

PTDSS1-202, Transcript of phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTDSS1, Length 5,177 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1-202ENST00000517309 KIF7Q2M1P5 1343 aa21.62■■□□□ 1.05
PTDSS1-202ENST00000517309 BCL2L13Q9BXK5 485 aa21.62■■□□□ 1.05
PTDSS1-202ENST00000517309 DRC7Q8IY82 874 aa21.62■■□□□ 1.05
PTDSS1-202ENST00000517309 GNAI1P63096 354 aa21.61■■□□□ 1.05
PTDSS1-202ENST00000517309 RRP1P56182 461 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
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PTDSS1-202ENST00000517309 C9orf84Q5VXU9 1444 aa21.61■■□□□ 1.05
PTDSS1-202ENST00000517309 ROCK1Q13464 1354 aa21.61■■□□□ 1.05
PTDSS1-202ENST00000517309 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
PTDSS1-202ENST00000517309 SLC52A1Q9NWF4 448 aa21.6■■□□□ 1.05
PTDSS1-202ENST00000517309 TXNDC2Q86VQ3 553 aa21.6■■□□□ 1.05
PTDSS1-202ENST00000517309 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
PTDSS1-202ENST00000517309 CLSTN1O94985 981 aa21.59■■□□□ 1.05
PTDSS1-202ENST00000517309 TMEM132EQ6IEE7 984 aa21.58■■□□□ 1.05
PTDSS1-202ENST00000517309 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
PTDSS1-202ENST00000517309 ANKRD45Q5TZF3 282 aa21.58■■□□□ 1.05
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PTDSS1-202ENST00000517309 TOMM22Q9NS69 142 aa21.58■■□□□ 1.04
PTDSS1-202ENST00000517309 KIF16BQ96L93 1317 aa21.57■■□□□ 1.04
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PTDSS1-202ENST00000517309 CABP2Q9NPB3 220 aa21.57■■□□□ 1.04
PTDSS1-202ENST00000517309 HECW1Q76N89 1606 aa21.56■■□□□ 1.04
PTDSS1-202ENST00000517309 CFAP70Q5T0N1 1121 aa21.56■■□□□ 1.04
PTDSS1-202ENST00000517309 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa21.56■■□□□ 1.04
PTDSS1-202ENST00000517309 NLRP6P59044 892 aa21.56■■□□□ 1.04
PTDSS1-202ENST00000517309 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
PTDSS1-202ENST00000517309 SCAPERQ9BY12 1400 aa21.56■■□□□ 1.04
PTDSS1-202ENST00000517309 GGNBP2Q9H3C7 697 aa21.56■■□□□ 1.04
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PTDSS1-202ENST00000517309 TPM4P67936 248 aa21.54■■□□□ 1.04
PTDSS1-202ENST00000517309 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
PTDSS1-202ENST00000517309 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
PTDSS1-202ENST00000517309 RUFY2Q8WXA3 655 aa21.53■■□□□ 1.04
PTDSS1-202ENST00000517309 RILPL2Q969X0 211 aa21.53■■□□□ 1.04
PTDSS1-202ENST00000517309 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa21.53■■□□□ 1.04
PTDSS1-202ENST00000517309 TSPYL4Q9UJ04 414 aa21.53■■□□□ 1.04
PTDSS1-202ENST00000517309 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
PTDSS1-202ENST00000517309 AAMPQ13685 434 aa21.52■■□□□ 1.03
PTDSS1-202ENST00000517309 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.03
PTDSS1-202ENST00000517309 WASHC2AQ641Q2 1341 aa21.52■■□□□ 1.03
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PTDSS1-202ENST00000517309 FAM161AQ3B820 660 aa21.5■■□□□ 1.03
PTDSS1-202ENST00000517309 CRBNQ96SW2 442 aa21.5■■□□□ 1.03
PTDSS1-202ENST00000517309 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa21.5■■□□□ 1.03
PTDSS1-202ENST00000517309 PLIN1O60240 522 aa21.5■■□□□ 1.03
PTDSS1-202ENST00000517309 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
PTDSS1-202ENST00000517309 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa21.49■■□□□ 1.03
PTDSS1-202ENST00000517309 POGZQ7Z3K3 1410 aa21.49■■□□□ 1.03
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PTDSS1-202ENST00000517309 MSH5O43196 834 aa21.49■■□□□ 1.03
PTDSS1-202ENST00000517309 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa21.49■■□□□ 1.03
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PTDSS1-202ENST00000517309 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa21.48■■□□□ 1.03
PTDSS1-202ENST00000517309 KIAA2012Q0VF49 1180 aa21.48■■□□□ 1.03
PTDSS1-202ENST00000517309 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.48■■□□□ 1.03
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PTDSS1-202ENST00000517309 REC8O95072 547 aa21.47■■□□□ 1.03
PTDSS1-202ENST00000517309 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
PTDSS1-202ENST00000517309 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP21.46■■□□□ 1.03
PTDSS1-202ENST00000517309 GAS2L2Q8NHY3 880 aa21.46■■□□□ 1.03
PTDSS1-202ENST00000517309 AMOTL1Q8IY63 956 aa21.46■■□□□ 1.03
PTDSS1-202ENST00000517309 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
PTDSS1-202ENST00000517309 MTHFSP49914 203 aa21.45■■□□□ 1.03
PTDSS1-202ENST00000517309 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.03
PTDSS1-202ENST00000517309 ABTB2Q8N961 1025 aa21.45■■□□□ 1.03
PTDSS1-202ENST00000517309 PRAM1Q96QH2 718 aa21.45■■□□□ 1.03
PTDSS1-202ENST00000517309 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
PTDSS1-202ENST00000517309 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa21.44■■□□□ 1.02
PTDSS1-202ENST00000517309 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
PTDSS1-202ENST00000517309 ESCO1Q5FWF5 840 aa21.43■■□□□ 1.02
PTDSS1-202ENST00000517309 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa21.43■■□□□ 1.02
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PTDSS1-202ENST00000517309 NECTIN2Q92692 538 aa21.43■■□□□ 1.02
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PTDSS1-202ENST00000517309 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa21.43■■□□□ 1.02
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PTDSS1-202ENST00000517309 NUTM2GQ5VZR2 741 aa21.41■■□□□ 1.02
PTDSS1-202ENST00000517309 FAM184AQ8NB25 1140 aa21.41■■□□□ 1.02
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PTDSS1-202ENST00000517309 H3BQV1 296 aa21.4■■□□□ 1.02
PTDSS1-202ENST00000517309 IFFO2Q5TF58 517 aa21.4■■□□□ 1.02
PTDSS1-202ENST00000517309 RIC3Q7Z5B4 369 aa21.39■■□□□ 1.01
PTDSS1-202ENST00000517309 VPS37DQ86XT2 251 aa21.39■■□□□ 1.01
PTDSS1-202ENST00000517309 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
PTDSS1-202ENST00000517309 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
PTDSS1-202ENST00000517309 RNF20Q5VTR2 975 aa21.38■■□□□ 1.01
PTDSS1-202ENST00000517309 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
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